Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08177
• Subject: XM_017019369.1
• Aligned Length: 1160
• Identities: 1001
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGAAGCCAGCGCTGC--TGGAAGTGAT-GAGGA------TGAACAGAATC---------------------TG  44
               |.|.| |.|||.|  |||.|| .|| |||||      |||  |.||||                     ||
Sbjct    1  ---ATGTC-GGGCTCCCATGGCAG-AATAGAGGATATCTGTGA--AAAATCCAAATTTTCCTCCTATGTGTGTG  67

Query   45  CCGG-ATGGTGCTGG---CCACTTG----CTTG--GGATCCTTTATCCTGGTCATCTTCTATTTCCAAAGTATG  108
            .||| .||.||||||   ..|||||    ||||  |.|.||.|||    .|.||||||.|              
Sbjct   68  TCGGCCTGCTGCTGGGTAGAACTTGCTGTCTTGAAGCAGCCATTA----CGCCATCTTTT--------------  123

Query  109  TTGCACCCAGTCATGCGGAGGAATCCCTTTGGTGTGGACATCTGCTGCCGGAAGGGGTCCCGAAGCCCCCTGCA  182
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  ----------TCATGCGGAGGAATCCCTTTGGTGTGGACATCTGCTGCCGGAAGGGGTCCCGAAGCCCCCTGCA  187

Query  183  GGAACTCTACAACCCAATCC------------------------------------------------------  202
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  188  GGAACTCTACAACCCAATCCAGATCTCGCATTGACCCTTTTGCCCAGTGCCTTCCTCGGGGCAGTGGAGGAAGA  261

Query  203  ----------AGCTGGAGCTCTCAAACACTGCTGTCCTGCACCAGATGCGGCGGGACCAGGTGACAGACACGTG  266
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  CACAGAGTGGAGCTGGAGCTCTCAAACACTGCTGTCCTGCACCAGATGCGGCGGGACCAGGTGACAGACACGTG  335

Query  267  CCGAGCCAACAGCGCCACAAGCCGTAAGCGGAGGGTGCTGACCCCCAACGACCTGAAGCACTTGGTGGTGGATG  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  CCGAGCCAACAGCGCCACAAGCCGTAAGCGGAGGGTGCTGACCCCCAACGACCTGAAGCACTTGGTGGTGGATG  409

Query  341  AGGACCACGAGCTCATCTACTGCTACGTGCCCAAGGTGGCCTGCACCAACTGGAAGCGGCTCATGATGGTCCTG  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  AGGACCACGAGCTCATCTACTGCTACGTGCCCAAGGTGGCCTGCACCAACTGGAAGCGGCTCATGATGGTCCTG  483

Query  415  ACCGGGCGGGGGAAGTACAGCGACCCCATGGAGATCCCGGCCAACGAGGCACACGTCTCCGCCAACCTGAAGAC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  ACCGGGCGGGGGAAGTACAGCGACCCCATGGAGATCCCGGCCAACGAGGCACACGTCTCCGCCAACCTGAAGAC  557

Query  489  CCTGAACCAGTACAGCATCCCAGAAATCAACCACCGCTTGAAAAGCTACATGAAGTTCCTGTTTGTCCGGGAGC  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  CCTGAACCAGTACAGCATCCCAGAAATCAACCACCGCTTGAAAAGCTACATGAAGTTCCTGTTTGTCCGGGAGC  631

Query  563  CCTTCGAGAGGCTAGTGTCCGCCTACCGCAACAAGTTCACCCAGAAGTACAACATCTCCTTCCACAAGCGGTAC  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  CCTTCGAGAGGCTAGTGTCCGCCTACCGCAACAAGTTCACCCAGAAGTACAACATCTCCTTCCACAAGCGGTAC  705

Query  637  GGCACCAAGATCATCAAACGCCAGCGGAAGAACGCCACCCAGGAGGCCCTGCGCAAAGGGGACGATGTCAAATT  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  GGCACCAAGATCATCAAACGCCAGCGGAAGAACGCCACCCAGGAGGCCCTGCGCAAAGGGGACGATGTCAAATT  779

Query  711  CGAGGAGTTTGTGGCCTATCTCATCGACCCACACACCCAGCGGGAGGAGCCTTTCAACGAACACTGGCAAACCG  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  CGAGGAGTTTGTGGCCTATCTCATCGACCCACACACCCAGCGGGAGGAGCCTTTCAACGAACACTGGCAAACCG  853

Query  785  TCTACTCACTCTGCCATCCCTGCCACATCCACTATGACCTCGTGGGCAAGTACGAGACACTGGAAGAGGATTCT  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  TCTACTCACTCTGCCATCCCTGCCACATCCACTATGACCTCGTGGGCAAGTACGAGACACTGGAAGAGGATTCT  927

Query  859  AATTACGTCCTGCAGCTGGCAGGAGTGGGCAGCTACCTGAAGTTCCCCACCTATGCAAAGTCTACGAGAACTAC  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  AATTACGTCCTGCAGCTGGCAGGAGTGGGCAGCTACCTGAAGTTCCCCACCTATGCAAAGTCTACGAGAACTAC  1001

Query  933  TGATGAAATGACCACAGAATTCTTCCAGAACATCAGCTCAGAGCACCAAACGCAGCTGTACGAAGTCTACAAAC  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  TGATGAAATGACCACAGAATTCTTCCAGAACATCAGCTCAGAGCACCAAACGCAGCTGTACGAAGTCTACAAAC  1075

Query 1007  TCGATTTTTTAATGTTCAATTACTCAGTGCCNAGCTACCTGAAATTNGAA  1056
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1076  TCGATTTTTTAATGTTCAATTACTCAGTGCCAAGCTACCTGAAATTGGAA  1125