Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08193
• Subject: NM_001170431.1
• Aligned Length: 1247
• Identities: 1025
• Gaps: 52

Alignment

Query    1  ATGGACTTGA------------------------------------CACAGCAAGCAAAAGACATACAGAACAT  38
            ||||||..||                                    |.||||.||||.||||.|.||||.||..
Sbjct    1  ATGGACAGGACCCTTGCTCAGAGCACGCAGGAGCAGGGTGGAGAGGCCCAGCCAGCAGAAGAAAGACAGGACGA  74

Query   39  AACAGTCCAGGAAACCAACA-AAAATAACTCTGAAAGCATTGAATG-----CAGCAAAATAACAATGGATCTCA  106
            |.|| |||  ||||..|.|| |.|..||.| ||.|.||.||||.||     .||||.|  |||||||||.||||
Sbjct   75  AGCA-TCC--GAAAAGAGCAGAGACCAAGT-TGCAGGCCTTGACTGTGGCAGAGCAGA--AACAATGGACCTCA  142

Query  107  AGTTCAACAATTCCAGGAAATATATTTCTATCACTGTGCCATCCAAAACCCAAACAATGTCACCACACATCAAG  180
            ||||||||||.||||||||.|||.|.||.|||.|.|||||.||||||||.||..|.|||||.||.|||||||||
Sbjct  143  AGTTCAACAACTCCAGGAAGTATGTCTCCATCTCAGTGCCCTCCAAAACGCAGGCCATGTCGCCGCACATCAAG  216

Query  181  TCAGTTGACGACGTTGTGGTACTTGGCATGAATCTCAGCAAGTTTAACAAACTTACTCAGTTTTTCATATGTGT  254
            ||||||||.|||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||.|||.||.||.||||||.||||.|||||
Sbjct  217  TCAGTTGAGGACGTCGTGGTGCTGGGCGTGAACCTCAGCAAGTTTAGCAAGCTCACACAGTTTCTCATCTGTGT  290

Query  255  TGCTGGAGTTTTTGTATTTTACCTAATTTATGGGTATTTACAGGAATTAATATTTTCAGTGGAGGGTTTTAAGT  328
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||.||||||.
Sbjct  291  GGCTGGAGTTTTTGTATTTTACCTAATTTATGGATACTTACAGGAGCTGATCTTTTCAGTGGAAGGCTTTAAGC  364

Query  329  CCTGTGGCTGGTACCTTACCTTAGTGCAGTTTGCCTTTTACTCCATATTTGGCCTAATAGAACTTCAGCTTATT  402
            |.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|.|
Sbjct  365  CTTACGGCTGGTACCTTACCTTAGTGCAGTTTGCCTTTTACTCCGTATTTGGCCTAATCGAGCTACAGCTCACT  438

Query  403  CAGGACAAAAGGAGGAGAATACCAGGAAAAACCTACATGATAATAGCTTTTCTAACTGTGGGTACTATGGGGTT  476
            |||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  439  CAGGACAGAAGGAGAAGAATACCAGGAAAAACCTACATGCTAATAGCTTTTCTAACTGTGGGTACTATGGGCTT  512

Query  477  ATCAAACACTTCCTTGGGCTACCTGAATTACCCTACCCAAGTCATCTTCAAGTGCTGCAAATTGATTCCTGTTA  550
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  513  ATCAAACACTTCCTTGGGCTACCTGAATTACCCAACCCAAGTCATCTTCAAGTGCTGCAAACTGATTCCTGTTA  586

Query  551  TGCTAGGAGGAGTTTTTATTCAAGGAAAGCGTTATAATGTTGCAGATGTGTCTGCTGCCATATGTATGAGCCTT  624
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||||||||.||..|.||.||||||||.
Sbjct  587  TGCTAGGAGGAGTTTTTATTCAAGGAAAGCGGTACAACCTTGCAGATGTGTCTGCCGCAGTGTGCATGAGCCTG  660

Query  625  GGCCTGATATGGTTTACCCTCGCTGACAGCACAACTGCACCAAATTTCAACCTGACGGGTGTGGTGCTTATTTC  698
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||.||
Sbjct  661  GGCCTGATCTGGTTTACCCTCGCTGACAGCACAATTGCACCAAACTTTAATCTGACAGGTGTGATGCTTATCTC  734

Query  699  CCTGGCACTATGTGCAGATGCCGTCATTGGAAATGTTCAAGAGAAAGCTATGAAACTTCATAATGCTTCTAATT  772
            ||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct  735  CCTGGCGCTGTGTGCAGACGCTGTCATTGGGAACGTTCAGGAGAAGGCCATGAAACTGCACAATGCTTCCAACT  808

Query  773  CTGAAATGGTATTGTATTCGTATTCAATTGGTTTTGTATACATTTTACTGGGATTGACATGCACTAGTGGATTA  846
            |.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||.||.||||||||||||||.|.
Sbjct  809  CGGAGATGGTTTTGTATTCCTACTCAATCGGGTTTGTGTACATTTTGCTGGGACTGTCATGCACTAGTGGACTG  882

Query  847  GGCCCTGCAGTAACATTTTGTGCAAAGAATCCAGTTCGGACCTATGGTTATGCGTTCCTTTTTTCCCTCACTGG  920
            |||||||||||..||||||||.|||||||.||.|||.||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  883  GGCCCTGCAGTGGCATTTTGTTCAAAGAACCCTGTTGGGACTTACGGCTACGCCTTCCTGTTTTCCCTCACTGG  956

Query  921  ATATTTTGGAATCTCCTTTGTTCTGGCTTTGATTAAAATTTTTGGTGCACTTATTGCTGTAACAGTGACAACAG  994
            |||.|||||.|||||||||||||||||..|.||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct  957  ATACTTTGGGATCTCCTTTGTTCTGGCCCTCATTAAAATCTTCGGTGCACTTCTGGCTGTAACAGTGACAACAG  1030

Query  995  GAAGAAAAGCAATGACCATTGTACTTTCGTTTATATTCTTTGCTAAACCATTCACGTTTCAGTATGTATGGTCT  1068
            ||||.||||||||||||.||||.||.||.||..|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 1031  GAAGGAAAGCAATGACCGTTGTCCTGTCCTTCCTGTTCTTTGCTAAGCCGTTCACTTTTCAGTATATATGGTCT  1104

Query 1069  GGTTTGTTAGTTGTCCTTGGTATATTTCTCAATGTTTACAGCAAAAATATGGATAAAATAAGACTACCATCACT  1142
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||..|
Sbjct 1105  GGCTTGTTAGTTGTCCTTGGCATATTTCTCAATGTTTACAGCAAAAATATGGATAAAATAAGATTGCCATCGGT  1178

Query 1143  GTATGATTTGATAAACAAATCAGTGGAAGCA--AGAAAGTCAAGGACGCTGGCACAGACTGTA  1203
            |||..|..|||||||.|||.|..||||  ||  |.|||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 1179  GTACAACATGATAAAGAAAGCCATGGA--CATGAAAAAGTCAAGGACGTTGGCACAGACTGTG  1239