Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08210
• Subject: NM_001371912.1
• Aligned Length: 1011
• Identities: 890
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCT----------------  58
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct    1  ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGATGGAGTCTCACT  74

Query   59  --------------------------------------------------------------------------  58
                                                                                      
Sbjct   75  GTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGTCGTTATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCAGGTTCAAGCGATTC  148

Query   59  ------------------------------CAGGACCGCATCTGAATGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAA  102
                                          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCGTGCCTCAGCCTCCCAAATCTGGGATTACAGGACCGCAGCTGAATGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAA  222

Query  103  GTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATGCAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGC  176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATGCAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGC  296

Query  177  TGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATTTTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGC  250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATTTTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGC  370

Query  251  CCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACCTCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAG  324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACCTCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAG  444

Query  325  ATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTCTGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTAT  398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTCTGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTAT  518

Query  399  TGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAGGATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGG  472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAGGATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGG  592

Query  473  TTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTTCAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAAT  546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTTCAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAAT  666

Query  547  CTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCCGTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGG  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCCGTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGG  740

Query  621  GGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGTATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTT  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGTATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTT  814

Query  695  TTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACATCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATC  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACATCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATC  888

Query  769  ACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGAATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAA  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGAATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAA  962

Query  843  CTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTCCAC  891
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTCCAC  1011