Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08210
• Subject: XM_011246712.2
• Aligned Length: 891
• Identities: 579
• Gaps: 288

Alignment

Query   1  ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGGACCGCATCTGAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAAGTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATG  148
                                                                                  |||
Sbjct   1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query 149  CAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGCTGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATT  222
           |.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct   4  CGGGATACACATACTGTGGGTCCTGTGCTGCCCATGCTTACAAACAAGTGGATCCATCTGTTACCCGGAGAATT  77

Query 223  TTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACC  296
           |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  78  TTCATCCTTGGGCCTTCCCATCATGTGCCCCTGTCTCGATGTGCACTCTCCAGTGTGGATATATATAGGACTCC  151

Query 297  TCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTC  370
           |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 152  TCTGTATGATCTTCGTATTGACCAAAAGATTTACGGAGAGCTATGGAAGACAGGAATGTTTGAACGAATGTCTC  225

Query 371  TGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 226  TGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAA--------  291

Query 445  GATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGGTTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTT  518
                                                                                     
Sbjct 292  --------------------------------------------------------------------------  291

Query 519  CAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAATCTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCC  592
                                                                        |||||||||||||
Sbjct 292  -------------------------------------------------------------GGTCAAAGGTTCC  304

Query 593  GTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305  GTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGT  378

Query 667  ATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACA  740
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 379  ATTATAGAACAATTAGATCCTGTATCTTTTAGCAATTATTTGAAGAAATATCATAATACTATATGTGGAAGACA  452

Query 741  TCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 453  TCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATCACAGAGCTTCAGAAGAATGGAATGAATATGAGCTTTTCCTTTTTGA  526

Query 815  ATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTC  888
           |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 527  ATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAGCTGGCAAGACAGTTCAGTCAGTTACGCAGCTGGAGCACTCACGGTC  600

Query 889  CAC  891
           |||
Sbjct 601  CAC  603