Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08255
• Subject: XM_005267739.1
• Aligned Length: 2304
• Identities: 2165
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTGGGGCAGAAAGAGCGGCAGAGCCAACTCCTTCCCTGCTCCACAGCACCTGTTGCCTTCATTAGCAGCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------ATGG--------------AGGGCT  10
                                                              ||||              ||||||
Sbjct   75  TTCCTCCTCTTCCCTGCACTTCCCAGAACCAAAGAATGTGAAGGGGGTCCATGGAGATCTTTCTCCACAGGGCT  148

Query   11  CACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGA  84
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGA  222

Query   85  TACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGG  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGG  296

Query  159  CGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGG  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGG  370

Query  233  CGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCG  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCG  444

Query  307  CACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGC  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGC  518

Query  381  GCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTC  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTC  592

Query  455  TGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCG  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCG  666

Query  529  GAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGA  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGA  740

Query  603  GGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGC  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGC  814

Query  677  CTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCG  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCG  888

Query  751  GAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCACAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCG  824
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCG  962

Query  825  CTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCT  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCT  1036

Query  899  TCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCAC  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCAC  1110

Query  973  GCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCT  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCT  1184

Query 1047  CGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTG  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTG  1258

Query 1121  AGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCC  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCC  1332

Query 1195  GGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGC  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGC  1406

Query 1269  GGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCT  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCT  1480

Query 1343  CTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGA  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGA  1554

Query 1417  TCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGG  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGG  1628

Query 1491  CAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAG  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAG  1702

Query 1565  GCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAG  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAG  1776

Query 1639  CGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGG  1712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGG  1850

Query 1713  TTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGC  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGC  1924

Query 1787  CTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGA  1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGA  1998

Query 1861  GGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCT  1934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCT  2072

Query 1935  CCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACA  2008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACA  2146

Query 2009  GCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAG  2082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAG  2220

Query 2083  ACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGG  2156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGG  2294

Query 2157  GCAAGAACGG  2166
            ||||||||||
Sbjct 2295  GCAAGAACGG  2304