Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08255
• Subject: XM_011536825.1
• Aligned Length: 2277
• Identities: 2165
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATCCTATACGCTCCACAGCACCTGTTGCCTTCATTAGCAGCTTTTCCTCCTCTTCCCTGCACTTCCCAGA  74

Query    1  -----------------------ATGG--------------AGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACT  37
                                   ||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCAAAGAATGTGAAGGGGGTCCATGGAGATCTTTCTCCACAGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACT  148

Query   38  TAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCA  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCA  222

Query  112  GGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATG  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATG  296

Query  186  CGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGT  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGT  370

Query  260  GCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGC  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGC  444

Query  334  CCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAG  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAG  518

Query  408  AGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGT  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGT  592

Query  482  CCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTG  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTG  666

Query  556  CATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGAC  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGAC  740

Query  630  GGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTC  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTC  814

Query  704  CACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACC  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACC  888

Query  778  ACAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTAC  851
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTAC  962

Query  852  ACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCC  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCC  1036

Query  926  GCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCC  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCC  1110

Query 1000  CCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGG  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGG  1184

Query 1074  CCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGA  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGA  1258

Query 1148  GCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTC  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTC  1332

Query 1222  CGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGT  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGT  1406

Query 1296  GGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGG  1369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGG  1480

Query 1370  GTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGG  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGG  1554

Query 1444  CTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATC  1517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATC  1628

Query 1518  TTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACT  1591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACT  1702

Query 1592  GCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGG  1665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGG  1776

Query 1666  GCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCC  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCC  1850

Query 1740  GTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGT  1813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGT  1924

Query 1814  CCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTG  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTG  1998

Query 1888  TCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGC  1961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGC  2072

Query 1962  CACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCAC  2035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCAC  2146

Query 2036  CCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGG  2109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGG  2220

Query 2110  GAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2166
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2277