Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08255
• Subject: XM_024449625.1
• Aligned Length: 2166
• Identities: 2042
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGGAGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGA  148
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGA  25

Query  149  GTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  GTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTG  99

Query  223  CACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCT  173

Query  297  GCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  GCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGG  247

Query  371  AAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  AAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCC  321

Query  445  ACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  ACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCG  395

Query  519  CACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  CACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCT  469

Query  593  CCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  CCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACC  543

Query  667  TCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  TCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGA  617

Query  741  GCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCACAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  GCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTC  691

Query  815  CGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  CGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCAC  765

Query  889  AAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  AAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACAT  839

Query  963  GAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  GAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGC  913

Query 1037  CTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  CTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCC  987

Query 1111  GAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  GAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGG  1061

Query 1185  TGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  TGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCC  1135

Query 1259  GGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  GGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGG  1209

Query 1333  TCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  TCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGC  1283

Query 1407  CCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  CCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGG  1357

Query 1481  GCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  GCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGA  1431

Query 1555  GTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  GTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTA  1505

Query 1629  TCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  TCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTT  1579

Query 1703  CCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580  CCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCA  1653

Query 1777  AGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654  AGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCG  1727

Query 1851  CAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728  CAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTG  1801

Query 1925  GGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802  GGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAA  1875

Query 1999  GTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1876  GTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACC  1949

Query 2073  ATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950  ATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAG  2023

Query 2147  GGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2166
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2024  GGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2043