Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08323
• Subject: NM_001353307.2
• Aligned Length: 980
• Identities: 950
• Gaps: 16

Alignment

Query   1  ATGGGGAATCTTCTTAAAGTTTT-------GACATGCACAGACCTTGA-GCAGGGGCCAAATTTTTTCCTTGAT  66
           |||||.|||||..||||.||..|       |||||    |||||...| ||||    ||.||||||||.|.||.
Sbjct   1  ATGGGTAATCTCATTAAGGTGCTAACCAGGGACAT----AGACCACAATGCAG----CACATTTTTTCTTGGAC  66

Query  67  TTTGAAAATGCCCAGCCTACAGAGTCTGAGAAGGAAATTTATAATCAGGTGAATGTAGTATTAAAAGATGCAGA  140
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  67  TTTGAAAATGCCCAGCCTACAGAGTCTGAGAAGGAAATTTATAATCAGGTGAATGTAGTATTAAAAGATGCAGA  140

Query 141  AGGCATCTTGGAGGACTTGCAGTCATACAGAGGAGCTGGCCACGAAATACGAGAGGCAATCCAGCATCCAGCAG  214
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141  AGGCATCTTGGAGGACTTGCAGTCATACAGAGGAGCTGGCCACGAAATACGAGAGGCAATCCAGCATCCAGCAG  214

Query 215  ATGAGAAGTTGCAAGAGAAGGCATGGGGTGCAGTTGTTCCACTAGTAGGCAAATTAAAGAAATTTTACGAATTT  288
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215  ATGAGAAGTTGCAAGAGAAGGCATGGGGTGCAGTTGTTCCACTAGTAGGCAAATTAAAGAAATTTTACGAATTT  288

Query 289  TCTCAGAGGTTAGAAGCAGCATTAAGAGGTCTTCTGGGAGCCTTAACAAGTACCCCATATTCTCCCACCCAGCA  362
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289  TCTCAGAGGTTAGAAGCAGCATTAAGAGGTCTTCTGGGAGCCTTAACAAGTACCCCATATTCTCCCACCCAGCA  362

Query 363  TCTAGAGCGAGAGCAGGCTCTTGCTAAACAGTTTGCAGAAATTCTTCATTTCACACTCCGGTTTGATGAACTCA  436
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363  TCTAGAGCGAGAGCAGGCTCTTGCTAAACAGTTTGCAGAAATTCTTCATTTCACACTCCGGTTTGATGAACTCA  436

Query 437  AGATGACAAATCCTGCCATACAGAATGATTTCAGCTATTATAGAAGAACATTGAGTCGTATGAGGATTAAAAAT  510
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 437  AGATGACAAATCCTGCCATACAGAATGATTTCAGCTATTATAGAAGAACATTGAGTCGTATGAGGATTAACAAT  510

Query 511  GTACCGGCAGAAGGAGAAAATGAAGTAAATAATGAATTGGCAAATCGAATGTCTTTGTTTTATGCTGAGGCAAC  584
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511  GTACCGGCAGAAGGAGAAAATGAAGTAAATAATGAATTGGCAAATCGAATGTCTTTGTTTTATGCTGAGGCAAC  584

Query 585  TCCAATGCTGAAAACCTTGAGTGATGCCACAACAAAATTTGTATCAGAGAATAAAAATTTACCAATAGAAAATA  658
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585  TCCAATGCTGAAAACCTTGAGTGATGCCACAACAAAATTTGTATCAGAGAATAAAAATTTACCAATAGAAAATA  658

Query 659  CCACAGATTGTTTAAGCACAATGGCTAGTGTATGCAGAGTCATGCTGGAAACACCGGAATACAGAAGCAGATTT  732
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659  CCACAGATTGTTTAAGCACAATGGCTAGTGTATGCAGAGTCATGCTGGAAACACCGGAATACAGAAGCAGATTT  732

Query 733  ACAAATGAAGAGACAGTGTCATTCTGCTTGAGGGTAATGGTGGGTGTCATAATACTCTATGACCACGTACATCC  806
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733  ACAAATGAAGAGACAGTGTCATTCTGCTTGAGGGTAATGGTGGGTGTCATAATACTCTATGACCACGTACATCC  806

Query 807  AGTGGGAGCATTTGCTAAAACTTCCAAAATTGATATGAAAGGTTGTATCAAAGTTCTTAAGGACCAACCTCCTA  880
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807  AGTGGGAGCATTTGCTAAAACTTCCAAAATTGATATGAAAGGTTGTATCAAAGTTCTTAAGGACCAACCTCCTA  880

Query 881  ATAGTGTGGAAGGTCTTCTAAATGCTCTCAGGTACACAACAAAACATTTGAATGATGAGACTACCTCCAAGCAA  954
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881  ATAGTGTGGAAGGTCTTCTAAATGCTCTCAGGTACACAACAAAACATTTGAATGATGAGACTACCTCCAAGCAA  954

Query 955  ATTAAATCCATGCTGCAA  972
           ||||||||||||||||||
Sbjct 955  ATTAAATCCATGCTGCAA  972