Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08341
- Subject:
- NM_133995.4
- Aligned Length:
- 1188
- Identities:
- 974
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGGCGGGCGCTGAGTGGAAGTCGCTGGAGGAATGCTTGGAGAAGCACCTGCCGCTCCCCGACTTG---CAGGA 71
||||||||..|.||||||.||||.||||||.|.|||.||||.||.||.|||||||....|||.||| |||
Sbjct 1 ATGGCGGGACCGGAGTGGCAGTCCCTGGAGCAGTGCCTGGAAAAACATCTGCCGCCTGACGATTTGGCCCAG-- 72
Query 72 AGTGAAGCGCGTTCTCTATGGCAAGGA-ACTCAGGAAGCTTGATCTGCCCAGGGAAGCTTTCGAAGCTGCCTCC 144
||||||||..|||||||.||||||.| ||| |||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||| |
Sbjct 73 -GTGAAGCGAATTCTCTACGGCAAGCAGACT-AGGAATCTCGATCTGCCCAGAGAAGCTTTAAAAGCTGCCT-C 143
Query 145 AGAGAAG--ACTTTGAACTGCAGGGATATGCCTTTGAAGCAGCGGAGGAGCAGCTGAGACGACCCCGCATTGTG 216
||| ||| |||||||||||.|||||||||||||.|..|||||..|||||||||.||||.|.||||..||.|||
Sbjct 144 AGA-AAGGAACTTTGAACTGAAGGGATATGCCTTCGGGGCAGCCAAGGAGCAGCAGAGATGCCCCCAGATCGTG 216
Query 217 CACGTGGGGCTGGTTCAGAACAGAATCCCCCTCCCCGCAAATGCCCCTGTGGCAGAACAGGTCTCTGCCCTTCA 290
|.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|...||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 217 CGCGTGGGGCTCGTTCAGAACAGAATCCCGCTCCCCACTTCTGCCCCCGTGGCAGAACAGGTCTCTGCGCTCCA 290
Query 291 -TAGACGCATAAAGGCTATCGTAGAGGTGGCTGCAATGTGTGGAGTCAACATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGG 363
.||| |||||.|||..||.|..||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 CAAGA-GCATAGAGGAGATTGCTGAGGTGGCCGCAATGTGTGGAGTCAATATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGG 363
Query 364 ACTATGCCCTTTGCCTTCTGTACGAGAGAGAAGCTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCAGCAGAGGATGGGCC 437
|.||||||.||.||.||.|||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.
Sbjct 364 AATATGCCGTTCGCTTTTTGTACACGAGAGAAACTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCGGCCGAGGATGGGCT 437
Query 438 CACCACCAGATTCTGTCAGAAGCTGGCGAAGAACCATGACATGGTGGTGGTGTCTCCCATCCTGGAACGAGACA 511
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||.||||.||.||.|
Sbjct 438 CACCACCAGGTTCTGTCAGAAGCTGGCAAAGAAGCACAACATGGTGGTGGTGTCTCCAATCTTGGAGCGTGATA 511
Query 512 GCGAGCATGGGGATGTTTTGTGGAATACAGCCGTGGTGATCTCCAATTCCGGAGC-AGTCCTGGGAAAGACCAG 584
|.||||||||||..|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|| || .|||.||||.||||||||
Sbjct 512 GAGAGCATGGGGGAGTTCTGTGGAACACAGCTGTGGTGATCTCCAATTCAGG-GCTGGTCATGGGGAAGACCAG 584
Query 585 GAAAAACCACATCCCCAGAGTGGGTGATTTCAACGAGTCAACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCG 658
.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 AAAGAACCACATCCCCAGAGTGGGAGACTTCAACGAGTCCACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCG 658
Query 659 TGTTCCAGACGCAGTTCGGAAGGATCGCGGTGAACATTTGCTACGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTTATG 732
||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 659 TGTTCCAGACCCAGTTTGGCAGGATTGCAGTGAACATTTGCTATGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTCATG 732
Query 733 TACAGCATCAACGGGGCTGAGATCATCTTCAACCCCTCGGCCACGATAGGAGCACTCAGCGAGTCCCTGTGGCC 806
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||.||||||.||||||.|||||||
Sbjct 733 TACAGCATCAACGGAGCTGAAATCATCTTCAACCCTTCGGCCACCATTGGAGAACTCAGTGAGTCCTTGTGGCC 806
Query 807 CATCGAGGCCAGAAACGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGCGCCATCAATCGAGTGGG-CACCGAGCAC 879
.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||.||||| || .||.|||
Sbjct 807 GATCGAAGCCAGAAATGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGTGCTCTCAACCGTGTGGGTCA-GGAACAC 879
Query 880 TTCCCGAACGAGTTTACCTCGGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCAGGACTTTGGCTACTTTTATGGCTCGAGCTA 953
|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 880 TTCCCCAATGAGTTTACTTCTGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCATGACCTCGGCTACTTCTATGGTTCGAGCTA 953
Query 954 TGTGGCAGCCCCTGACAGCAGCCGGACTCCTGGGCTGTCCCGTAGCCGGGATGGACTGCTAGTTGCTAAGCTCG 1027
|||||||||.||.||..||||||||||.||.||.||.|||||||..|.||||||.|||||.||..|..|||||.
Sbjct 954 TGTGGCAGCTCCCGATGGCAGCCGGACCCCCGGCCTCTCCCGTAATCAGGATGGGCTGCTGGTCACGGAGCTCA 1027
Query 1028 ACCTAAACCTCTGCCAGCAGGTGAATGATGTCTGGAACTTCAAGATGACGGGCAGGTATGAGATGTACGCACGG 1101
||||.||.||||||||||||.|.||||||.||||||..||||||||||||||..|...|||||||||.||.|||
Sbjct 1028 ACCTCAATCTCTGCCAGCAGATCAATGATTTCTGGACTTTCAAGATGACGGGACGACTTGAGATGTATGCCCGG 1101
Query 1102 GAGCTCGCCGAAGCTGTCAAGTCCAACTACAGCCTCACCATCGTGAAAGAG----------------------- 1152
||.||.||||||||.|||||..||||||||||.|.||.|||.|||||.||.
Sbjct 1102 GAACTTGCCGAAGCGGTCAAACCCAACTACAGTCCCAACATTGTGAAGGAAGACCTGGTACTAGCCCCTAGCTC 1175
Query 1153 ---- 1152
Sbjct 1176 GGGT 1179