Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08344
- Subject:
- NM_001363625.1
- Aligned Length:
- 1278
- Identities:
- 896
- Gaps:
- 333
Alignment
Query 1 ATGAACATGCCCCAGTCCCTG----GG---------------CAA--CCAGCCACTGCCCCCAGAACCGCCATC 53
|||.|||||.||.|| || ||| ||.|||...||||||||..|||||.||
Sbjct 1 ------ATGGCCCAGCCCTTGTCCCGGCCCCTCGTCCTATCCCAATCCCCGCCTTGGCCCCCAGCCCCGCCCTC 68
Query 54 -------------CCTTGG----AACCCCTGC--GG----------AGG------------------------- 73
|.|.|| |.||||||| || |||
Sbjct 69 GCCCCGCTTCCCACATCGGCCCCAGCCCCTGCCTGGGTCCCCATCCAGGACCCCCTTCCAGTCTCTGCCCCTGG 142
Query 74 ---------------GGCCTGGGACCACGT----CCCC---------ACCCGAGCACTGCTGGCCAGTGC--GC 117
|||||.||.||.||| |||| |.||.|||.|.| |.||.||.| ||
Sbjct 143 CCTGGCCCCCATCCCGGCCTCGGCCCTCGTTCCACCCCCTGTCACAAATCCCAGCCCAG--GCCCTGTCCCAGC 214
Query 118 CCGACTC--------TGCGCAACGAGCTGG-------------------------------ACA--CCTTC--T 148
||.|.|| |||..||.|..|||| ||| ||||| |
Sbjct 215 CCCATTCCCAGTGTTTGCTTAAGGCCCTGGCTCAACCCCGTCCCTTGCTGCAGTCCCCATCACAGCCCTTCCTT 288
Query 149 C--------------------------------TGTCCA-------------------------CTT----CTA 161
| |||||| ||| ||
Sbjct 289 CCATCCCACTCCCTGCCCTTGTTCAAGCCCCAGTGTCCAGCCCAGCCCAACCCATTATCTCAGCCTTTGCCCT- 361
Query 162 CATCTTCT---TTGGCCCAAGTGTGGCCCT----TCCCCCTGA------------------GCGCCCAGCC--- 207
|||| ||| ||..|||||||.|..|||| ||||||..| .|.|||||||
Sbjct 362 CATC-TCTGTGTTTACCCAAGTCTCTCCCTCTAGTCCCCCCTATCTCTCATACTCTGCCCCTCTCCCAGCCTAG 434
Query 208 ----------GTGTT--------CGCCA-------TGAGGCTGTTGCCAGTGCTGGACAGTGGAGGC-GTCCTC 255
|.||| ||||| ||..||||||| |.||.|| | |||||.
Sbjct 435 ACTCAAGTCTGGGTTTCAGCTGCCGCCAGCCCTATTGCTGCTGTTG-CTGTTCT------------CTGTCCTT 495
Query 256 AG-CCTGGAGCTCCAGCTCAATGCGAGCTCCGTGCGCCAGGAAAACGTGACGGTGTTTGGATGCTTGACTCACG 328
.| ||.||.||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 GGCCCAGGGGCT------------GAGCTCCGTGCGCCAGGAAAACGTGACGGTGTTTGGATGCTTGACTCACG 557
Query 329 AGGTGCCCTTGAGCCTGGGGGATGCAGCAGTGACCTGTTCCAAAGAGTCCCTGGCCGGCTTCCTCCTCTCTGTC 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 AGGTGCCCTTGAGCCTGGGGGATGCAGCAGTGACCTGTTCCAAAGAGTCCCTGGCCGGCTTCCTCCTCTCTGTC 631
Query 403 AGTGCCACCACCAGGGTTGCCAGGCTGCGAATCCCATTCCCGCAGACGGGGACCTGGTTCCTGGCCCTCCGCTC 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 AGTGCCACCACCAGGGTTGCCAGGCTGCGAATCCCATTCCCGCAGACGGGGACCTGGTTCCTGGCCCTCCGCTC 705
Query 477 CCTGTGCGGGGTGGGGCCTCGGTTCGTGCGGTGCCGCAACGCGACGGCCGAGGTGTGGATGCGCACCTTCCTGT 550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 706 CCTGTGCGGGGTGGGGCCTCGGTTCGTGCGGTGCCGCAACGCGACGGCCGAGGTGCGGATGCGCACCTTCCTGT 779
Query 551 CCCCATGCGTGGACGACTGCGGGCCCTACGGCCAGTGCAAGCTGCTGCGCACACACAATTATCTGTACGCAGCC 624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CCCCATGCGTGGACGACTGCGGGCCCTACGGCCAGTGCAAGCTGCTGCGCACACACAATTATCTGTACGCAGCC 853
Query 625 TGCGAGTGCAAGGCCGGGTGGAGAGGCTGGGGCTGCACCGACAGTGCAGATGCGCTCACCTATGGATTCCAGCT 698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 TGCGAGTGCAAGGCCGGGTGGAGAGGCTGGGGCTGCACCGACAGTGCAGATGCGCTCACCTATGGATTCCAGCT 927
Query 699 GCTGTCCACACTCCTGCTCTGCCTGAGCAACCTCATGTTTCTGCCACCTGTGGTCCTGGCCATTCGGAGTCGAT 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 GCTGTCCACACTCCTGCTCTGCCTGAGCAACCTCATGTTTCTGCCACCTGTGGTCCTGGCCATTCGGAGTCGAT 1001
Query 773 ATGTGCTGGAAGCTGCAGTCTACACCTTCACCATGTTCTTCTCCACGGTATGCGGTGGTGTCTGCATCTTATCA 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 ATGTGCTGGAAGCTGCAGTCTACACCTTCACCATGTTCTTCTCCACGGTATGCGGTGGTGTCTGCATCTTATCA 1075
Query 847 CTGGGTGCTTGTGCATGGTGGTGGGTCACAGTCTGTATTTCCACCACGTTCTCCGAGGGTTTGGGAATGTCTGT 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 CTGGGTGCTTGTGCATGGTGGTGGGTCACAGTCTGTATTTCCACCACGTTCTCCGAGGGTTTGGGAATGTCTGT 1149
Query 921 GCCTTCACTGTGTCTTCTACAGACAGAGACAGCAGTGCTTCCCAAACTGTCATGCATAGATAATGGTCATTTTT 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 GCCTTCACTGTGTCTTCTACAGACAGAGACAGCAGTGCTTCCCAAACTGTCATGCATAGA-------------- 1209
Query 995 GTAAGACACATTGGAGTAAA 1014
Sbjct 1210 -------------------- 1209