Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08371
• Subject: NM_001321276.2
• Aligned Length: 828
• Identities: 708
• Gaps: 117

Alignment

Query   1  MWLRLGPPSLSLSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLGVPY  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AAPPIGEKRFLPPEPPPYWSGIRNATHFPPVCPQNIHTAVPEVMLPVWFTANLDIVATYIQEPNEDCLYLNVYV  148
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------------MLPVWFTANLDIVATYIQEPNEDCLYLNVYV  31

Query 149  PTEDGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGAKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVL  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  32  PTEDGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGAKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVL  105

Query 223  GFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGS  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106  GFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGS  179

Query 297  ALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEIL  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180  ALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEIL  253

Query 371  MEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADR  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254  MEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADR  327

Query 445  DNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGP  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328  DNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGP  401

Query 519  TDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRV  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402  TDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRV  475

Query 593  RDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGS  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476  RDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGS  549

Query 667  WNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASILFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAWAPELGAAPE  740
           |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 550  WNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPE  623

Query 741  EELAALQLGPTHHECEASPPHDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGF  814
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624  EELAALQLGPTHHECEAGPPHDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGF  697

Query 815  NSTGLPHSHSTTRV  828
           ||||||||||||||
Sbjct 698  NSTGLPHSHSTTRV  711