Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08371
• Subject: NM_018977.4
• Aligned Length: 2484
• Identities: 2477
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTGGCTGCGGCTTGGCCCGCCCTCGCTGTCCCTGAGCCCCAAGCCCACGGTTGGCAGGAGCCTGTGCCTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCTGCGGCTTGGCCCGCCCTCGCTGTCCCTGAGCCCCAAGCCCACGGTTGGCAGGAGCCTGTGCCTCAC  74

Query   75  CCTGTGGTTCCTCAGTTTGGCGCTGAGGGCCAGTACCCAGGCCCCAGCACCCACAGTCAACACTCACTTTGGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGTGGTTCCTCAGTTTGGCGCTGAGGGCCAGTACCCAGGCCCCAGCACCCACAGTCAACACTCACTTTGGGA  148

Query  149  AGCTAAGGGGTGCCCGAGTACCACTGCCCAGTGAGATCCTGGGGCCTGTGGACCAATACCTGGGGGTGCCCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTAAGGGGTGCCCGAGTACCACTGCCCAGTGAGATCCTGGGGCCTGTGGACCAATACCTGGGGGTGCCCTAC  222

Query  223  GCAGCTCCCCCGATCGGCGAGAAACGTTTCCTGCCCCCTGAACCACCCCCATACTGGTCGGGCATCCGGAACGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGCTCCCCCGATCGGCGAGAAACGTTTCCTGCCCCCTGAACCACCCCCATCCTGGTCGGGCATCCGGAACGC  296

Query  297  CACACACTTTCCACCAGTGTGCCCCCAGAACATCCACACAGCTGTGCCCGAAGTCATGCTGCCGGTCTGGTTCA  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACACACTTTCCCCCAGTGTGCCCCCAGAACATCCACACAGCTGTGCCCGAAGTCATGCTGCCGGTCTGGTTCA  370

Query  371  CTGCCAACTTGGATATCGTCGCTACTTACATCCAGGAGCCCAACGAAGACTGTCTCTACCTGAACGTCTATGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCCAACTTGGATATCGTCGCTACTTACATCCAGGAGCCCAACGAAGACTGTCTCTACCTGAACGTCTATGTG  444

Query  445  CCGACGGAGGATGGATCCGGCGCTAAGAAACAGGGCGAGGACTTAGCGGATAATGACGGGGATGAAGATGAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGACGGAGGATGGATCCGGCGCTAAGAAACAGGGCGAGGACTTAGCGGATAATGACGGGGATGAAGATGAAGA  518

Query  519  CATCCGGGACAGTGGTGCTAAACCCGTCATGGTCTACATCCACGGAGGCTCTTACATGGAAGGGACAGGCAACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCCGGGACAGTGGTGCTAAACCCGTCATGGTCTACATCCACGGAGGCTCTTACATGGAAGGGACAGGCAACA  592

Query  593  TGATTGATGGCAGCATCCTCGCCAGTTATGGCAATGTCATCGTCATCACCCTCAACTATCGGGTTGGAGTGCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATTGATGGCAGCATCCTCGCCAGTTATGGCAATGTCATCGTCATCACCCTCAACTATCGGGTTGGAGTGCTA  666

Query  667  GGTTTCCTGAGTACTGGAGATCAGGCTGCCAAGGGCAACTATGGGCTCCTTGACCAGATCCAGGCCCTCCGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTTTCCTGAGTACTGGAGATCAGGCTGCCAAGGGCAACTATGGGCTCCTTGACCAGATCCAGGCCCTCCGCTG  740

Query  741  GGTGAGCGAGAATATTGCCTTCTTCGGGGGAGACCCCCGCCGGATCACTGTCTTTGGCTCGGGCATTGGTGCAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGAGCGAGAATATTGCCTTCTTCGGGGGAGACCCCCGCCGGATCACTGTCTTTGGCTCGGGCATTGGTGCAT  814

Query  815  CCTGCGTCAGCCTCCTAACGTTGTCACATCACTCAGAGGGACTTTTCCAGAGAGCCATCATCCAAAGTGGCTCT  888
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTGCGTCAGCCTCCTCACGTTGTCACATCACTCAGAGGGACTTTTCCAGAGAGCCATCATCCAAAGTGGCTCT  888

Query  889  GCTCTGTCCAGCTGGGCTGTGAACTACCAACCAGTGAAGTACACCAGCCTGCTGGCAGACAAAGTGGGCTGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTCTGTCCAGCTGGGCTGTGAACTACCAACCAGTGAAGTACACCAGCCTGCTGGCAGACAAAGTGGGCTGTAA  962

Query  963  TGTGCTGGACACCGTGGATATGGTGGACTGTCTTCGGCAAAAGAGTGCCAAGGAGCTGGTAGAGCAGGACATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGCTGGACACCGTGGATATGGTGGACTGTCTTCGGCAAAAGAGTGCCAAGGAGCTGGTAGAGCAGGACATCC  1036

Query 1037  AGCCAGCCCGCTACCACGTGGCCTTTGGCCCTGTGATTGATGGTGATGTCATTCCTGATGACCCTGAGATCCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCCAGCCCGCTACCACGTGGCCTTTGGCCCTGTGATTGATGGTGATGTCATTCCTGATGACCCTGAGATCCTC  1110

Query 1111  ATGGAGCAGGGCGAGTTCCTCAACTATGACATCATGCTAGGTGTCAACCAGGGCGAGGGTCTCAAGTTTGTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGAGCAGGGCGAGTTCCTCAACTATGACATCATGCTAGGTGTCAACCAGGGCGAGGGTCTCAAGTTTGTGGA  1184

Query 1185  AGGGGTGGTGGACCCTGAGGATGGTGTCTCTGGCACTGACTTTGACTATTCCGTCTCCAATTTTGTGGACAATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGGGTGGTGGACCCTGAGGATGGTGTCTCTGGCACTGACTTTGACTATTCCGTCTCCAATTTTGTGGACAATC  1258

Query 1259  TGTATGGCTATCCTGAGGGTAAGGACACCCTGCGAGAGACCATCAAGTTCATGTATACAGACTGGGCAGACCGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTATGGCTATCCTGAGGGTAAGGACACCCTGCGAGAGACCATCAAGTTCATGTATACAGACTGGGCAGACCGT  1332

Query 1333  GACAACCCTGAGACCCGCCGTAAAACACTGGTGGCACTCTTCACTGACCACCAGTGGGTGGAGCCCTCAGTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACAACCCTGAGACCCGCCGTAAAACACTGGTGGCACTCTTCACTGACCACCAGTGGGTGGAGCCCTCAGTGGT  1406

Query 1407  GACAGCCGATCTGCATGCCCGCTACGGCTCGCCTACCTACTTCTACGCCTTCTATCATCACTGCCAGAGCCTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACAGCCGATCTGCATGCCCGCTACGGCTCGCCTACCTACTTCTACGCCTTCTATCATCACTGCCAGAGCCTCA  1480

Query 1481  TGAAGCCTGCTTGGTCAGATGCAGCTCATGGGGATGAAGTACCCTATGTTTTTGGGGTTCCTATGGTAGGCCCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAAGCCTGCTTGGTCAGATGCAGCTCATGGGGATGAAGTACCCTATGTTTTTGGGGTTCCTATGGTAGGCCCC  1554

Query 1555  ACTGACCTTTTCCCCTGCAACTTCTCCAAGAATGATGTTATGCTCAGTGCTGTCGTCATGACCTATTGGACCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGACCTTTTCCCCTGCAACTTCTCCAAGAATGATGTTATGCTCAGTGCTGTCGTCATGACCTATTGGACCAA  1628

Query 1629  CTTTGCCAAGACTGGGGATCCCAACAAGCCGGTCCCCCAGGACACCAAGTTCATTCACACCAAGGCCAACCGCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTTGCCAAGACTGGGGATCCCAACAAGCCGGTCCCCCAGGACACCAAGTTCATTCACACCAAGGCCAACCGCT  1702

Query 1703  TTGAGGAAGTGGCCTGGTCCAAATACAATCCCCGAGACCAGCTCTACCTTCACATCGGGCTGAAACCAAGGGTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGAGGAAGTGGCCTGGTCCAAATACAATCCCCGAGACCAGCTCTACCTTCACATCGGGCTGAAACCAAGGGTC  1776

Query 1777  CGAGATCATTACCGGGCCACTAAGGTGGCCTTTTGGAAACATCTGGTGCCGCACCTATACAACCTGCATGACAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGAGATCATTACCGGGCCACTAAGGTGGCCTTTTGGAAACATCTGGTGCCCCACCTATACAACCTGCATGACAT  1850

Query 1851  GTTCCACTATACGTCCACCACCACCAAAGTGCCGCCTCCGGATACCACCCACAGCTCCCACATCACCCGCAGGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTCCACTATACGTCCACCACCACCAAAGTGCCGCCTCCGGATACCACCCACAGCTCCCACATCACCCGCAGGC  1924

Query 1925  CCAATGGCAAGACCTGGAGCACCAAGCGGCCAGCCATCTCACCTGCCTACAGCAACGAGAATGCCCAGGGGTCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCAATGGCAAGACCTGGAGCACCAAGCGGCCAGCCATCTCACCTGCCTACAGCAACGAGAATGCCCAGGGGTCC  1998

Query 1999  TGGAACGGGGACCAGGATGCAGGGCCACTCCTGGTGGAGAACCCTCGTGACTACTCCACTGAATTAAGTGTCAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGAACGGGGACCAGGATGCAGGGCCACTCCTGGTGGAGAACCCTCGTGACTACTCCACTGAATTAAGTGTCAC  2072

Query 2073  CATCGCCGTGGGGGCCTCCATCCTGTTCCTTAACGTTCTGGCCTTCGCTGCCCTCTACTACCGTAAGGACAAAC  2146
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CATCGCCGTGGGGGCCTCCCTCCTGTTCCTTAACGTTCTGGCCTTCGCTGCCCTCTACTACCGTAAGGACAAAC  2146

Query 2147  GGCGCCAGGAGCCCCTGCGGCAGCCTAGCCCTCAGCGGGGAGCCTGGGCCCCGGAGTTGGGAGCTGCTCCAGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GGCGCCAGGAGCCCCTGCGGCAGCCTAGCCCTCAGCGGGGAGCCGGGGCCCCGGAGTTGGGAGCTGCTCCAGAG  2220

Query 2221  GAGGAGCTGGCAGCATTACAACTGGGCCCCACCCACCACGAGTGTGAGGCCAGTCCCCCCCATGACACGCTGCG  2294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAGGAGCTGGCAGCATTACAACTGGGCCCCACCCACCACGAGTGTGAGGCCGGTCCCCCCCATGACACGCTGCG  2294

Query 2295  CCTCACTGCATTGCCCGACTACACCCTGACCCTGCGGCGCTCCCCGGATGACATCCCACTCATGACCCCCAACA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTCACTGCATTGCCCGACTACACCCTGACCCTGCGGCGCTCCCCGGATGACATCCCACTCATGACCCCCAACA  2368

Query 2369  CCATCACTATGATCCCCAACTCCCTGGTAGGGCTGCAGACATTGCACCCCTATAACACCTTTGCCGCAGGGTTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCATCACTATGATCCCCAACTCCCTGGTAGGGCTGCAGACATTGCACCCCTATAACACCTTTGCCGCAGGGTTC  2442

Query 2443  AACAGTACCGGGCTGCCCCACTCACACTCCACTACCCGGGTA  2484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AACAGTACCGGGCTGCCCCACTCACACTCCACTACCCGGGTA  2484