Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08371
• Subject: XM_006724663.4
• Aligned Length: 2544
• Identities: 2128
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  ATGTGGCTGCGGCTTGGCCCGCCCTCGCTGTCCCTGAGCCCCAAGCCCACGGTTGGCAGGAGCCTGTGCCTCAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGTGGTTCCTCAGTTTGGCGCTGAGGGCCAGTACCCAGGCCCCAGCACCCACAGTCAACACTCACTTTGGGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCTAAGGGGTGCCCGAGTACCACTGCCCAGTGAGATCCTGGGGCCTGTGGACCAATACCTGGGGGTGCCCTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGCTCCCCCGATCGGCGAGAAACGTTTCCTGCCCCCTGAACCACCCCCATACTGGTCGGGCATCCGGAACGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CACACACTTTCCACCAGTGTGCCCCCAGAACATCCACACAGCTGTGCCCGAAGTCATGCTGCCGGTCTGGTTCA  370
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------ATGCTGCCGGTCTGGTTCA  19

Query  371  CTGCCAACTTGGATATCGTCGCTACTTACATCCAGGAGCCCAACGAAGACTGTCTCTACCTGAACGTCTATGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   20  CTGCCAACTTGGATATCGTCGCTACTTACATCCAGGAGCCCAACGAAGACTGTCTCTACCTGAACGTCTATGTG  93

Query  445  CCGACGGAGGAT------------------------------------------------------------GG  458
            ||||||||||||                                                            ||
Sbjct   94  CCGACGGAGGATGTAAAGCGGATTTCCAAGGAATGCGCCCGAAAGCCCAACAAGAAAATTTGTAGGAAAGGAGG  167

Query  459  ATCCGGCGCTAAGAAACAGGGCGAGGACTTAGCGGATAATGACGGGGATGAAGATGAAGACATCCGGGACAGTG  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  ATCCGGCGCTAAGAAACAGGGCGAGGACTTAGCGGATAATGACGGGGATGAAGATGAAGACATCCGGGACAGTG  241

Query  533  GTGCTAAACCCGTCATGGTCTACATCCACGGAGGCTCTTACATGGAAGGGACAGGCAACATGATTGATGGCAGC  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  GTGCTAAACCCGTCATGGTCTACATCCACGGAGGCTCTTACATGGAAGGGACAGGCAACATGATTGATGGCAGC  315

Query  607  ATCCTCGCCAGTTATGGCAATGTCATCGTCATCACCCTCAACTATCGGGTTGGAGTGCTAGGTTTCCTGAGTAC  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  ATCCTCGCCAGTTATGGCAATGTCATCGTCATCACCCTCAACTATCGGGTTGGAGTGCTAGGTTTCCTGAGTAC  389

Query  681  TGGAGATCAGGCTGCCAAGGGCAACTATGGGCTCCTTGACCAGATCCAGGCCCTCCGCTGGGTGAGCGAGAATA  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  TGGAGATCAGGCTGCCAAGGGCAACTATGGGCTCCTTGACCAGATCCAGGCCCTCCGCTGGGTGAGCGAGAATA  463

Query  755  TTGCCTTCTTCGGGGGAGACCCCCGCCGGATCACTGTCTTTGGCTCGGGCATTGGTGCATCCTGCGTCAGCCTC  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  TTGCCTTCTTCGGGGGAGACCCCCGCCGGATCACTGTCTTTGGCTCGGGCATTGGTGCATCCTGCGTCAGCCTC  537

Query  829  CTAACGTTGTCACATCACTCAGAGGGACTTTTCCAGAGAGCCATCATCCAAAGTGGCTCTGCTCTGTCCAGCTG  902
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  CTCACGTTGTCACATCACTCAGAGGGACTTTTCCAGAGAGCCATCATCCAAAGTGGCTCTGCTCTGTCCAGCTG  611

Query  903  GGCTGTGAACTACCAACCAGTGAAGTACACCAGCCTGCTGGCAGACAAAGTGGGCTGTAATGTGCTGGACACCG  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  GGCTGTGAACTACCAACCAGTGAAGTACACCAGCCTGCTGGCAGACAAAGTGGGCTGTAATGTGCTGGACACCG  685

Query  977  TGGATATGGTGGACTGTCTTCGGCAAAAGAGTGCCAAGGAGCTGGTAGAGCAGGACATCCAGCCAGCCCGCTAC  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TGGATATGGTGGACTGTCTTCGGCAAAAGAGTGCCAAGGAGCTGGTAGAGCAGGACATCCAGCCAGCCCGCTAC  759

Query 1051  CACGTGGCCTTTGGCCCTGTGATTGATGGTGATGTCATTCCTGATGACCCTGAGATCCTCATGGAGCAGGGCGA  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  CACGTGGCCTTTGGCCCTGTGATTGATGGTGATGTCATTCCTGATGACCCTGAGATCCTCATGGAGCAGGGCGA  833

Query 1125  GTTCCTCAACTATGACATCATGCTAGGTGTCAACCAGGGCGAGGGTCTCAAGTTTGTGGAAGGGGTGGTGGACC  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  GTTCCTCAACTATGACATCATGCTAGGTGTCAACCAGGGCGAGGGTCTCAAGTTTGTGGAAGGGGTGGTGGACC  907

Query 1199  CTGAGGATGGTGTCTCTGGCACTGACTTTGACTATTCCGTCTCCAATTTTGTGGACAATCTGTATGGCTATCCT  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  CTGAGGATGGTGTCTCTGGCACTGACTTTGACTATTCCGTCTCCAATTTTGTGGACAATCTGTATGGCTATCCT  981

Query 1273  GAGGGTAAGGACACCCTGCGAGAGACCATCAAGTTCATGTATACAGACTGGGCAGACCGTGACAACCCTGAGAC  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  GAGGGTAAGGACACCCTGCGAGAGACCATCAAGTTCATGTATACAGACTGGGCAGACCGTGACAACCCTGAGAC  1055

Query 1347  CCGCCGTAAAACACTGGTGGCACTCTTCACTGACCACCAGTGGGTGGAGCCCTCAGTGGTGACAGCCGATCTGC  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  CCGCCGTAAAACACTGGTGGCACTCTTCACTGACCACCAGTGGGTGGAGCCCTCAGTGGTGACAGCCGATCTGC  1129

Query 1421  ATGCCCGCTACGGCTCGCCTACCTACTTCTACGCCTTCTATCATCACTGCCAGAGCCTCATGAAGCCTGCTTGG  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  ATGCCCGCTACGGCTCGCCTACCTACTTCTACGCCTTCTATCATCACTGCCAGAGCCTCATGAAGCCTGCTTGG  1203

Query 1495  TCAGATGCAGCTCATGGGGATGAAGTACCCTATGTTTTTGGGGTTCCTATGGTAGGCCCCACTGACCTTTTCCC  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  TCAGATGCAGCTCATGGGGATGAAGTACCCTATGTTTTTGGGGTTCCTATGGTAGGCCCCACTGACCTTTTCCC  1277

Query 1569  CTGCAACTTCTCCAAGAATGATGTTATGCTCAGTGCTGTCGTCATGACCTATTGGACCAACTTTGCCAAGACTG  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CTGCAACTTCTCCAAGAATGATGTTATGCTCAGTGCTGTCGTCATGACCTATTGGACCAACTTTGCCAAGACTG  1351

Query 1643  GGGATCCCAACAAGCCGGTCCCCCAGGACACCAAGTTCATTCACACCAAGGCCAACCGCTTTGAGGAAGTGGCC  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  GGGATCCCAACAAGCCGGTCCCCCAGGACACCAAGTTCATTCACACCAAGGCCAACCGCTTTGAGGAAGTGGCC  1425

Query 1717  TGGTCCAAATACAATCCCCGAGACCAGCTCTACCTTCACATCGGGCTGAAACCAAGGGTCCGAGATCATTACCG  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  TGGTCCAAATACAATCCCCGAGACCAGCTCTACCTTCACATCGGGCTGAAACCAAGGGTCCGAGATCATTACCG  1499

Query 1791  GGCCACTAAGGTGGCCTTTTGGAAACATCTGGTGCCGCACCTATACAACCTGCATGACATGTTCCACTATACGT  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  GGCCACTAAGGTGGCCTTTTGGAAACATCTGGTGCCCCACCTATACAACCTGCATGACATGTTCCACTATACGT  1573

Query 1865  CCACCACCACCAAAGTGCCGCCTCCGGATACCACCCACAGCTCCCACATCACCCGCAGGCCCAATGGCAAGACC  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  CCACCACCACCAAAGTGCCGCCTCCGGATACCACCCACAGCTCCCACATCACCCGCAGGCCCAATGGCAAGACC  1647

Query 1939  TGGAGCACCAAGCGGCCAGCCATCTCACCTGCCTACAGCAACGAGAATGCCCAGGGGTCCTGGAACGGGGACCA  2012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  TGGAGCACCAAGCGGCCAGCCATCTCACCTGCCTACAGCAACGAGAATGCCCAGGGGTCCTGGAACGGGGACCA  1721

Query 2013  GGATGCAGGGCCACTCCTGGTGGAGAACCCTCGTGACTACTCCACTGAATTAAGTGTCACCATCGCCGTGGGGG  2086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  GGATGCAGGGCCACTCCTGGTGGAGAACCCTCGTGACTACTCCACTGAATTAAGTGTCACCATCGCCGTGGGGG  1795

Query 2087  CCTCCATCCTGTTCCTTAACGTTCTGGCCTTCGCTGCCCTCTACTACCGTAAGGACAAACGGCGCCAGGAGCCC  2160
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  CCTCCCTCCTGTTCCTTAACGTTCTGGCCTTCGCTGCCCTCTACTACCGTAAGGACAAACGGCGCCAGGAGCCC  1869

Query 2161  CTGCGGCAGCCTAGCCCTCAGCGGGGAGCCTGGGCCCCGGAGTTGGGAGCTGCTCCAGAGGAGGAGCTGGCAGC  2234
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870  CTGCGGCAGCCTAGCCCTCAGCGGGGAGCCGGGGCCCCGGAGTTGGGAGCTGCTCCAGAGGAGGAGCTGGCAGC  1943

Query 2235  ATTACAACTGGGCCCCACCCACCACGAGTGTGAGGCCAGTCCCCCCCATGACACGCTGCGCCTCACTGCATTGC  2308
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944  ATTACAACTGGGCCCCACCCACCACGAGTGTGAGGCCGGTCCCCCCCATGACACGCTGCGCCTCACTGCATTGC  2017

Query 2309  CCGACTACACCCTGACCCTGCGGCGCTCCCCGGATGACATCCCACTCATGACCCCCAACACCATCACTATGATC  2382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018  CCGACTACACCCTGACCCTGCGGCGCTCCCCGGATGACATCCCACTCATGACCCCCAACACCATCACTATGATC  2091

Query 2383  CCCAACTCCCTGGTAGGGCTGCAGACATTGCACCCCTATAACACCTTTGCCGCAGGGTTCAACAGTACCGGGCT  2456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092  CCCAACTCCCTGGTAGGGCTGCAGACATTGCACCCCTATAACACCTTTGCCGCAGGGTTCAACAGTACCGGGCT  2165

Query 2457  GCCCCACTCACACTCCACTACCCGGGTA  2484
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166  GCCCCACTCACACTCCACTACCCGGGTA  2193