Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08437
• Subject: NM_001110100.2
• Aligned Length: 550
• Identities: 446
• Gaps: 86

Alignment

Query   1  MMSEHDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDEDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAK  74
           ||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MMSEQDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDDDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAK  74

Query  75  LQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRC---------------------------  121
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  75  LQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRCVVPQTTVILNNDRQNAIVAKMEDPLSN  148

Query 122  ------------AVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHHEDGESGSEASDSVSSCGQAGSQSIGSNVTLITLNSEEDYP  183
                       |||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 149  RAPDSLENIISNAVPGRRQNTIVVKVPGQDDSHNEDGESGSEASDSVSNCGQPGSQNIGSNVTLITLNSEEDYP  222

Query 184  NGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYG  257
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  NGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYG  296

Query 258  IRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPNSSSYCPSEPMMSTPPPASELPQP  331
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||.||||.|||  .
Sbjct 297  IRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPSSSSYSASETMMGTPPPTSEL--Q  368

Query 332  QPQPQALHYALANAQQVQIHQIGEDGQVQVIPQGHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDG--------  397
           |.||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 369  QSQPQALHYALANAQQVQIHQIGEDGQVQV---GHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDGQSWGLCQN  439

Query 398  ----------------------------------QVLQGAQLIAVASSDPAAAGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAP  437
                                             ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 440  PIPVSGDSVAQANPSQLWPLGGDTLDLPAGNEMIQVLQGAQLIAVASSDPAATGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAP  513

Query 438  VSDHTAGAQTAEALQPTLQPEMQLEHGAIQIQ  469
           ||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 514  VSDHTAAAQTAEALQPTLQPDMQLEHGAIQIQ  545