Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08437
• Subject: XM_011523175.3
• Aligned Length: 1608
• Identities: 1405
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAG----  70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGGTAC  74

Query   71  --------------TTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  130
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCTGTGGGACATTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  148

Query  131  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  222

Query  205  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  296

Query  279  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  370

Query  353  AAGTGCGATG----------------------------------------------------------------  362
            ||||||||||                                                                
Sbjct  371  AAGTGCGATGCGTCGTCCCCCAGACTACAGTAATACTCAACAATGATCGGCAGAACGCCATTGTAGCCAAGATG  444

Query  363  -----------------------------------------------------CGCTGTGCCTGGGCGTCGGCA  383
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGACCCCTTGAGCAACAGGGCACCGGATTCCCTGGAAAATGTCATTAGCAACGCTGTGCCTGGGCGTCGGCA  518

Query  384  GAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCA  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCA  592

Query  458  GCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAAC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAAC  666

Query  532  TCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCAT  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCAT  740

Query  606  CATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACT  679
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACT  814

Query  680  ACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGAC  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGAC  888

Query  754  CCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAAT  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAAT  962

Query  828  CAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGA  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGA  1036

Query  902  GCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCC  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCC  1110

Query  976  AGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGAT  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGAT  1184

Query 1050  CCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGG  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGG  1258

Query 1124  GGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGT------  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1259  GGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGCTT  1332

Query 1192  ------------------------------------------------------------CAGGTGCTGCAGGG  1205
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct 1333  CTAGAGGCCACCCGCATCCCCTGCCTCCTGGCCCCATCCGTCTTCAAAGCCAGCAGTGGCCAGGTGCTGCAGGG  1406

Query 1206  TGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCG  1279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCG  1480

Query 1280  ACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTG  1353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTG  1554

Query 1354  CAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG  1407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG  1608