Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08437
• Subject: XM_011523184.2
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1138
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAA--------------CGCCAGCGACTAGA  134
                                   ||||             ||||||              |.|||  |||||  
Sbjct    1  -----------------------ATGA-------------TTGAAAACTGTGGCGTCGTCCCCCA--GACTA--  34

Query  135  AATCAATTGCCAGGATCCATCTATAA-AGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGAT  207
                      |||          ||| |.|||                     ||||  ||.|  |||..|.|.
Sbjct   35  ----------CAG----------TAATACTCA---------------------ACAA--TGAT--CGGCAGAAC  63

Query  208  AGCATTGAAGCCAAATTGCAAG-CCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGA  280
            ..|||||.||||||..||.||| |||         ||||                 |||              |
Sbjct   64  GCCATTGTAGCCAAGATGGAAGACCC---------CTTG-----------------AGC--------------A  97

Query  281  ACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGT-----GCA  349
            |||.|  |||                          ||||.|.||||     ||.||     |.||     |||
Sbjct   98  ACAGG--GCA--------------------------CCGGATTCCCT-----GGAAA-----ATGTCATTAGCA  133

Query  350  ACAAAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGC  423
            |            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  A------------CGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGC  195

Query  424  CACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAG  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  CACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAG  269

Query  498  CATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACG  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  CATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACG  343

Query  572  AGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  AGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGC  417

Query  646  ACGGCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTC  719
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  ACGGCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTC  491

Query  720  GGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATA  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATA  565

Query  794  AATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  AATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGG  639

Query  868  CGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCC  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  CGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCC  713

Query  942  TTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGC  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGC  787

Query 1016  ACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  ACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCA  861

Query 1090  CAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCT  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  CAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCT  935

Query 1164  CCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGT----------------------------------------------  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  936  CCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGCTTCTAGAGGCCACCCGCATCCCCTGCCTCCTGGCCCCATCCG  1009

Query 1192  --------------------CAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCG  1245
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  TCTTCAAAGCCAGCAGTGGCCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCG  1083

Query 1246  GCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGA  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  GCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGA  1157

Query 1320  CCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGG  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  CCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGG  1231

Query 1394  CCATCCAGATTCAG  1407
            ||||||||||||||
Sbjct 1232  CCATCCAGATTCAG  1245