Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08437
- Subject:
- XM_024450328.1
- Aligned Length:
- 1494
- Identities:
- 1138
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAA--------------CGCCAGCGACTAGA 134
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Sbjct 1 -----------------------ATGA-------------TTGAAAACTGTGGCGTCGTCCCCCA--GACTA-- 34
Query 135 AATCAATTGCCAGGATCCATCTATAA-AGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGAT 207
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Sbjct 35 ----------CAG----------TAATACTCA---------------------ACAA--TGAT--CGGCAGAAC 63
Query 208 AGCATTGAAGCCAAATTGCAAG-CCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGA 280
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Sbjct 64 GCCATTGTAGCCAAGATGGAAGACCC---------CTTG-----------------AGC--------------A 97
Query 281 ACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGT-----GCA 349
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Sbjct 98 ACAGG--GCA--------------------------CCGGATTCCCT-----GGAAA-----ATGTCATTAGCA 133
Query 350 ACAAAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGC 423
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Sbjct 134 A------------CGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGC 195
Query 424 CACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAG 497
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Sbjct 196 CACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAG 269
Query 498 CATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACG 571
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Sbjct 270 CATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACG 343
Query 572 AGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGC 645
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Sbjct 344 AGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGC 417
Query 646 ACGGCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTC 719
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Sbjct 418 ACGGCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTC 491
Query 720 GGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATA 793
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Sbjct 492 GGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATA 565
Query 794 AATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGG 867
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Sbjct 566 AATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGG 639
Query 868 CGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCC 941
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Sbjct 640 CGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCC 713
Query 942 TTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGC 1015
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Sbjct 714 TTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGC 787
Query 1016 ACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCA 1089
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Sbjct 788 ACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCA 861
Query 1090 CAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCT 1163
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Sbjct 862 CAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCT 935
Query 1164 CCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGT---------------------------------------------- 1191
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Sbjct 936 CCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGCTTCTAGAGGCCACCCGCATCCCCTGCCTCCTGGCCCCATCCG 1009
Query 1192 --------------------CAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCG 1245
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Sbjct 1010 TCTTCAAAGCCAGCAGTGGCCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCG 1083
Query 1246 GCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGA 1319
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Sbjct 1084 GCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGA 1157
Query 1320 CCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGG 1393
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Sbjct 1158 CCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGG 1231
Query 1394 CCATCCAGATTCAG 1407
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Sbjct 1232 CCATCCAGATTCAG 1245