Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08453
• Subject: XM_017021388.2
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1220
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTGTCCAAACAAAAAAAAAAGTGAACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTGTCCAAACAAAAAAAAAAGTGAACA  74

Query   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148

Query  149  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222

Query  223  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  296

Query  297  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  370

Query  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  444

Query  445  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  518

Query  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  592

Query  593  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  666

Query  667  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  740

Query  741  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814

Query  815  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  888

Query  889  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962

Query  963  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  1036
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  963  TGATGGAGAAAT--------------------------------------------------------------  974

Query 1037  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  1110
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1111  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1184
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  975  --GGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1046

Query 1185  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1120

Query 1259  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1194

Query 1333  GAAAACTCTGCAGACCTNGATGATACA  1359
            |||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1195  GAAAACTCTGCAGACCTTGATGATACA  1221