Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08453
• Subject: XM_024449639.1
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1198
• Gaps: 156

Alignment

Query    1  ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTGTCCAAACAAAAAAAAAAGTGAACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148
                               ||||   |.|||.|                ||||.||||   |||          
Sbjct    1  -------------------ATGG---TTTTTGC----------------TGGACAGGA---AGA----------  23

Query  149  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222
                                          ||||.| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   24  ------------------------------ATTACA-GCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  66

Query  223  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  140

Query  297  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  214

Query  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  288

Query  445  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  362

Query  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  436

Query  593  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  510

Query  667  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  584

Query  741  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  658

Query  815  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  732

Query  889  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  806

Query  963  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  880

Query 1037  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  954

Query 1111  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1028

Query 1185  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1102

Query 1259  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1176

Query 1333  GAAAACTCTGCAGACCTNGATGATACA  1359
            |||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1177  GAAAACTCTGCAGACCTTGATGATACA  1203