Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08454
- Subject:
- NM_001083907.3
- Aligned Length:
- 2265
- Identities:
- 2263
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTACATGTTGTGAAAAGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTACATGTTGTGAAAAGGGA 74
Query 75 AGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAACTTAACGTCTTACAAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAACTTAACGTCTTACAAAT 148
Query 149 GTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCAGTTTCTGGAAAAGATA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCAGTTTCTGGAAAAGATA 222
Query 223 CTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGCTCTATGAATTACTAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGCTCTATGAATTACTAAA 296
Query 297 TATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCTGTAATCCAGAGTATCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCTGTAATCCAGAGTATCA 370
Query 371 TATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAAACATTCTGGGGAAATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAAACATTCTGGGGAAATA 444
Query 445 AGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAGCAGTGGTGCTTCCCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAGCAGTGGTGCTTCCCAC 518
Query 519 TGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATTGGTGATACTGTAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATTGGTGATACTGTAGAGG 592
Query 593 TTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAAAGTCTGGTGCATGAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAAAGTCTGGTGCATGAAA 666
Query 667 GCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTAAAGCTACAACCAAAAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTAAAGCTACAACCAAAAT 740
Query 741 TAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGAGAGAGTTTGTGCCAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGAGAGAGTTTGTGCCAGA 814
Query 815 ATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATATTATGAGTTCCAGTCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATATTATGAGTTCCAGTCT 888
Query 889 CTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTCTTCTCCACTGTGCAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTCTTCTCCACTGTGCAGC 962
Query 963 AAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGGGCATCTAAGATGAAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGGGCATCTAAGATGAAAA 1036
Query 1037 ATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAAGAAAATCTTCGAAGAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAAGAAAATCTTCGAAGAC 1110
Query 1111 TTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATATTGCCTCATTTTCCAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATATTGCCTCATTTTCCAC 1184
Query 1185 ATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGAAAGACATACGGGCAGAGTGCAGATGGAG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGGAAGACATACGGGCAGAGTGCAGATGGAG 1258
Query 1259 CTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAAACACAGCCCACTAGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAAACACAGCCCACTAGAG 1332
Query 1333 GTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTGCTGATCCAGAAAATAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTGCTGATCCAGAAAATAA 1406
Query 1407 TTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCTAATGCCTTCCAACTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCTAATGCCTTCCAACTGG 1480
Query 1481 AAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCAAAACTGGGGTCATCCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCAAAACTGGGGTCATCCT 1554
Query 1555 GGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAAAAGAGCAGGAGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAAAAGAGCAGGAGGA 1628
Query 1629 GGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTGGCCAATCTGAGTATAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTGGCCAATCTGAGTATAA 1702
Query 1703 AGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCGACCCACAAGTATACCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCGACCCACAAGTATACCT 1776
Query 1777 CCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAAGACAATCTGATGATGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAAGACAATCTGATGATGA 1850
Query 1851 CAAGTTCCGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTTTCTACTCTCAGGGGCT 1924
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAAGTTCTGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTTTCTACTCTCAGGGGCT 1924
Query 1925 GTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAAAATGTCTATGGATGAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAAAATGTCTATGGATGAA 1998
Query 1999 GCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGCAGGAGAAATTACGACA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGCAGGAGAAATTACGACA 2072
Query 2073 ACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTCACCATTGTGCACCATC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTCACCATTGTGCACCATC 2146
Query 2147 CAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAATAAGCTTCCTGCTCGA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAATAAGCTTCCTGCTCGA 2220
Query 2221 CCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT 2265
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT 2265