Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08454
• Subject: NM_017935.5
• Aligned Length: 2355
• Identities: 2263
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGCCAGCAGCGCCAGGCAAGGGGCTTGGGAGCCCGGACCCCGCCCCCTGCGGCCCAGCGCCCCCAGGAAA  74

Query    1  ----------------ATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTAC  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACAAAAGATATAATAATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTAC  148

Query   59  ATGTTGTGAAAAGGGAAGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAAC  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTTGTGAAAAGGGAAGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAAC  222

Query  133  TTAACGTCTTACAAATGTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCA  206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAACGTCTTACAAATGTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCA  296

Query  207  GTTTCTGGAAAAGATACTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGC  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTCTGGAAAAGATACTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGC  370

Query  281  TCTATGAATTACTAAATATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCT  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTATGAATTACTAAATATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCT  444

Query  355  GTAATCCAGAGTATCATATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAA  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAATCCAGAGTATCATATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAA  518

Query  429  ACATTCTGGGGAAATAAGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAG  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACATTCTGGGGAAATAAGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAG  592

Query  503  CAGTGGTGCTTCCCACTGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATT  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTGGTGCTTCCCACTGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATT  666

Query  577  GGTGATACTGTAGAGGTTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAA  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGATACTGTAGAGGTTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAA  740

Query  651  AGTCTGGTGCATGAAAGCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTA  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTCTGGTGCATGAAAGCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTA  814

Query  725  AAGCTACAACCAAAATTAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGA  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCTACAACCAAAATTAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGA  888

Query  799  GAGAGTTTGTGCCAGAATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATA  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAGTTTGTGCCAGAATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATA  962

Query  873  TTATGAGTTCCAGTCTCTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTC  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTATGAGTTCCAGTCTCTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTC  1036

Query  947  TTCTCCACTGTGCAGCAAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGG  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCTCCACTGTGCAGCAAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGG  1110

Query 1021  GCATCTAAGATGAAAAATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAA  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCATCTAAGATGAAAAATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAA  1184

Query 1095  GAAAATCTTCGAAGACTTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATA  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAAATCTTCGAAGACTTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATA  1258

Query 1169  TTGCCTCATTTTCCACATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGAAAGACATACGGG  1242
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259  TTGCCTCATTTTCCACATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGGAAGACATACGGG  1332

Query 1243  CAGAGTGCAGATGGAGCTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAA  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAGTGCAGATGGAGCTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAA  1406

Query 1317  ACACAGCCCACTAGAGGTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTG  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACACAGCCCACTAGAGGTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTG  1480

Query 1391  CTGATCCAGAAAATAATTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCT  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGATCCAGAAAATAATTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCT  1554

Query 1465  AATGCCTTCCAACTGGAAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCA  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AATGCCTTCCAACTGGAAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCA  1628

Query 1539  AAACTGGGGTCATCCTGGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGG  1612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAACTGGGGTCATCCTGGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGG  1702

Query 1613  AAAAAGAGCAGGAGGAGGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTG  1686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAAAAGAGCAGGAGGAGGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTG  1776

Query 1687  GCCAATCTGAGTATAAAGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCG  1760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCAATCTGAGTATAAAGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCG  1850

Query 1761  ACCCACAAGTATACCTCCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAA  1834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCCACAAGTATACCTCCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAA  1924

Query 1835  GACAATCTGATGATGACAAGTTCCGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTT  1908
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GACAATCTGATGATGACAAGTTCTGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTT  1998

Query 1909  TCTACTCTCAGGGGCTGTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAA  1982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCTACTCTCAGGGGCTGTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAA  2072

Query 1983  AATGTCTATGGATGAAGCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGC  2056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AATGTCTATGGATGAAGCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGC  2146

Query 2057  AGGAGAAATTACGACAACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTC  2130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGGAGAAATTACGACAACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTC  2220

Query 2131  ACCATTGTGCACCATCCAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAA  2204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACCATTGTGCACCATCCAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAA  2294

Query 2205  TAAGCTTCCTGCTCGACCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT  2265
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TAAGCTTCCTGCTCGACCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT  2355