Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08464
• Subject: NM_001320772.1
• Aligned Length: 1338
• Identities: 1092
• Gaps: 246

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCGGCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCACATCCCTAGCAATTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTTTTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGCGCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAGAAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTA  296
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGAACGTGTATCACTTCAAGAAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTA  50

Query  297  CTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCTGGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   51  CTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCTGGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTC  124

Query  371  ACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  ACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTC  198

Query  445  TCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  TCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGG  272

Query  519  AAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  273  AAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAG  346

Query  593  GCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  347  GCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTC  420

Query  667  TATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCT  494

Query  741  CTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  CTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGC  568

Query  815  CTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  CTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGAC  642

Query  889  ATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  ATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTC  716

Query  963  AACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  AACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTC  790

Query 1037  AGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  AGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA  864

Query 1111  AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCAC  938

Query 1185  GGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  GGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGAC  1012

Query 1259  CAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  CAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAG  1086

Query 1333  CAGTCA  1338
            ||||||
Sbjct 1087  CAGTCA  1092