Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08464
- Subject:
- NR_135471.1
- Aligned Length:
- 1936
- Identities:
- 1266
- Gaps:
- 669
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGCGGGGCAGGACCGGCGACCCGGCCCGTGGAGCCGGCGCGGGCGGGCTGCTGAGGTGGCTGTCGCCGGCTCC 74
Query 1 -----------------------------ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCG 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGCTGCGGCTTCCCGGGCCGAGCCCCCGATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCG 148
Query 46 GCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACATCCCTAGCAATTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTT 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACATCCCTAGCAACTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTT 222
Query 120 TTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATCAAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGC 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATCAAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGC 296
Query 194 GCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAG 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAG 370
Query 268 AAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCT 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCT 444
Query 342 GGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTC 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTC 518
Query 416 CTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTG 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTG 592
Query 490 ACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGGAAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAAC 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGGAAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAAC 666
Query 564 ACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGG 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAA---------------- 724
Query 638 TGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCT 711
|||||||||||||||||||
Sbjct 725 -------------------------------------------------------GTATGTGACAATCAGCTCT 743
Query 712 CTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGA 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 CTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGA 817
Query 786 ACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTA 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 ACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTA 891
Query 860 CCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTC 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 CCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTC 965
Query 934 TCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTCAACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGG 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 TCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTCAACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGG 1039
Query 1008 ACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTG 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 ACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTG 1113
Query 1082 GCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAAAATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTA 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 GCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAAAATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTA 1187
Query 1156 GCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGT 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 GCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGT 1261
Query 1230 TATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 TATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGT 1335
Query 1304 GCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCA--------------------------------------- 1338
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 GCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCATGATGAGAAGCACACCTCAGAAATCAGGACATCCCCCCT 1409
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1410 ATCAGGTGGTTTTGGAGAAAACAAGGAAGGCGGAAGAATGGAGTGCAATTGTGTGAGCAGAAAGGGGGGCAGGA 1483
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1484 ATCCCGGGTGCTCCACTGCTTAAACCACAGGACCTGGTTAACTCCTCACCAAGCTTCCCACGACCCTGGTTGCC 1557
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1558 AATGGGCGCGGGAGACATTGTATACACATCATGCTATTTAAAATACGTTCAAACTATAGTGTAAATGCTAATTA 1631
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1632 ACCATATTGGTATATAACCGGAATTTTATATTAAAAGGGGCCTCCTTTTTAAATATATGCCGTGTAAAAAATGT 1705
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1706 ACTTATAGGAACATCTCTTTGAATTGTATTTCTTGTATATTACATACTTAGAGAGAGACTCTTTTAGCCAGGCA 1779
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1780 AAGTCTTTTTTGGCTGTGGCTGGAATAAATCATTTATTACTTGGGAGTCCCATTTTGGACACTAATAATAAAAT 1853
Query 1339 ------------ 1338
Sbjct 1854 CATGGCAATGCA 1865