Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08497
• Subject: NM_018253.3
• Aligned Length: 2217
• Identities: 2216
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAA  74

Query   75  CACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAAC  148

Query  149  TATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGT  222

Query  223  AAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGT  296

Query  297  TCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGA  370

Query  371  TATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAG  444

Query  445  ACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGA  518

Query  519  CTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCC  592

Query  593  TGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGAT  666

Query  667  AAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCT  740

Query  741  TAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCA  814

Query  815  ACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGC  888

Query  889  TGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAA  962

Query  963  GGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTG  1036

Query 1037  GAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCA  1110

Query 1111  CTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACA  1184

Query 1185  GAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGA  1258

Query 1259  AAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAG  1332

Query 1333  CCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCC  1406

Query 1407  TGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTT  1480

Query 1481  CTGCCCTTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGA  1554
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGA  1554

Query 1555  CCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTAT  1628

Query 1629  CTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATG  1702

Query 1703  CGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCA  1776

Query 1777  TTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACC  1850

Query 1851  ATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTC  1924

Query 1925  AGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACAT  1998

Query 1999  AGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGT  2072

Query 2073  TGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTT  2146

Query 2147  CCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2217
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2217