Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08497
• Subject: NM_139118.2
• Aligned Length: 2448
• Identities: 2156
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGGAGGAGGCGAGCCGCAGCGCCGCGGCGACGAACCCAGGGAGTCGGCTTACCCGCTGGCCGCCTCCTGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAAGCGGGAGGGATCCGCGGTGGACCCAGGGAAGCGGAGGAGCCTGGCGGCCACCCCCTCTTCCTCACTTCCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTACTCTCATCGCTCTCGGCCTCCGACACGAAAAGGAAGCAAATGAGCTGATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTC  222

Query    1  ---------ATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGC  65
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGC  296

Query   66  TAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAG  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAG  370

Query  140  CGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAA  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAA  444

Query  214  CCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCA  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCA  518

Query  288  GCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTA  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTA  592

Query  362  GCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCC  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCC  666

Query  436  AAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGT  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGT  740

Query  510  CAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGG  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGG  814

Query  584  CTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAAT  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAAT  888

Query  658  CCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGAC  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  889  CCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAA------------------------------------  926

Query  732  TGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCA  805
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  ------------------------CAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCA  976

Query  806  AGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTA  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  AGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTA  1050

Query  880  GGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATT  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  GGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATT  1124

Query  954  CTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  CTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAA  1198

Query 1028  ATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACT  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  ATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACT  1272

Query 1102  CGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGC  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273  CGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGC  1346

Query 1176  TTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCA  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347  TTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCA  1420

Query 1250  ACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCAC  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421  ACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCAC  1494

Query 1324  CCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTT  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495  CCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTT  1568

Query 1398  TGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTT  1471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569  TGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTT  1642

Query 1472  TGCTCTCTTCTGCCCTTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTG  1545
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643  TGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTG  1716

Query 1546  AGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGC  1619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717  AGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGC  1790

Query 1620  ATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGC  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791  ATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGC  1864

Query 1694  CTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTC  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865  CTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTC  1938

Query 1768  CCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCT  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939  CCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCT  2012

Query 1842  TCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAA  1915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013  TCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAA  2086

Query 1916  ATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAA  1989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087  ATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAA  2160

Query 1990  GTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCG  2063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161  GTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCG  2234

Query 2064  CTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAA  2137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235  CTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAA  2308

Query 2138  ACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGA  2211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309  ACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGA  2382

Query 2212  TTTCTT  2217
            ||||||
Sbjct 2383  TTTCTT  2388