Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08568
• Subject: XM_017316773.1
• Aligned Length: 1663
• Identities: 1290
• Gaps: 227

Alignment

Query    1  ATGGAA--------GCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAA-------------CAG-CT---ATTCC  49
            |||..|        ||||  ||||           ||||   ||.||             ||| ||   .||||
Sbjct    1  ATGACACACACCCCGCAC--GACT-----------TCCG---GATAATTTGTTTGACACTCAGACTGGGTTTCC  58

Query   50  ACGAGAGG--ATCCGCGAGTGTATTATATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCC  121
            |      |  |||| ||       |||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct   59  A------GCCATCC-CG-------TATCTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCC  118

Query  122  TGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTC  195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  119  TGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTG  192

Query  196  GAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGA  269
            |||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  193  GAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTCGCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGA  266

Query  270  GGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACC  343
            ||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  267  GGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTACTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACC  340

Query  344  TTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGC  417
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  341  TCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCCTCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGC  414

Query  418  TTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCT  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  415  TTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCT  488

Query  492  GGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACT  565
            .|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.||||
Sbjct  489  TGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATCCGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACT  562

Query  566  TTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACT  639
            |.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  563  TCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCTACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACT  636

Query  640  CCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGA  713
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  637  CCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCTGTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGA  710

Query  714  GGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTA------------------  769
            |||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|                  
Sbjct  711  GGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAGTGAGTCTAAATCCGCCC  784

Query  770  -----------------------------------------------------------------------ATC  772
                                                                                   |||
Sbjct  785  TTGCTTGGGTGGTGGTGGCCCGGCCTTGGCAAGGACTGAGTATTGGAGGGAAGTATGTCCTGTGCCCTCAGATC  858

Query  773  CTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTC  846
            |.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  859  CCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACATGGAACTGCTGCATAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTC  932

Query  847  CTGCT----------------------------GGAG-------------------------------------  855
            || ||                            ||||                                     
Sbjct  933  CT-CTTGGGTATGTGGCCTGGTAGTTTACCCAAGGAGAGTTGTTCCTTGTCCCAAGTACTTACTAACGACCTCC  1005

Query  856  ---------------AAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTG  914
                           |||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1006  CACCCACACACAGAAAAGCGTCGGAAGGCGTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTG  1079

Query  915  CTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTTCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTG  988
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1080  CTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTCCTCATCGTGGCTGTCCACATCCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTG  1153

Query  989  CCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTC  1062
            |||||||.||.||||||||||.|.|..||.|||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||.|||.||
Sbjct 1154  CCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTGCCCTAGGCCAGGCCTCCTTCTCCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATC  1227

Query 1063  ATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAG  1136
            ||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|.||
Sbjct 1228  ATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTGATGGTGTCCTCAGTGGTGGGTTTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAG  1301

Query 1137  CCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCT  1210
            ||||.||||.||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1302  CCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATCGATGACACAGATCATTGGGAACTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCT  1375

Query 1211  CAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAAC  1284
            ||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  CAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTCTTGGCCTGACACGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAAC  1449

Query 1285  TGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAA  1358
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  TGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCTGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAA  1523

Query 1359  GACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCG  1432
            |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1524  GACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGAGCTGATCCGAGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTG  1597

Query 1433  GTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  1467
            |.||.||||.|||.||||||||||..|||||.||.
Sbjct 1598  GGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGCAGCATCAA  1632