Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08575
• Subject: NM_018217.3
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1733
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCTTTCCGGCTGCTCATCCCGCTCGGCCTCCTGTGCGCGCTGCTGCCTCAGCACCATGGTGCGCCAGGTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTTCCGGCTGCTCATCCCGCTCGGCCTCCTGTGCGCGCTGCTGCCTCAGCACCATGGTGCGCCAGGTCC  74

Query   75  CGACGGCTCCGCGCCAGATCCCGCCCACTACAGGGAGCGAGTCAAGGCCATGTTCTACCACGCCTACGACAGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGACGGCTCCGCGCCAGATCCCGCCCACTACAGGGAGCGAGTCAAGGCCATGTTCTACCACGCCTACGACAGCT  148

Query  149  ACCTGGAGAATGCCTTTCCCTTCGATGAGCTGCGACCTCTCACCTGTGACGGGCACGACACCTGGGGCAGTTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTGGAGAATGCCTTTCCCTTCGATGAGCTGCGACCTCTCACCTGTGACGGGCACGACACCTGGGGCAGTTTT  222

Query  223  TCTCTGACTCTAATTGATGCACTGGACACCTTGCTGATTTTGGGGAATGTCTCAGAATTCCAAAGAGTGGTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTCTGACTCTAATTGATGCACTGGACACCTTGCTGATTTTGGGGAATGTCTCAGAATTCCAAAGAGTGGTTGA  296

Query  297  AGTGCTCCAGGACAGCGTGGACTTTGATATTGATGTGAACGCCTCTGTGTTTGAAACAAACATTCGAGTGGTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTGCTCCAGGACAGCGTGGACTTTGATATTGATGTGAACGCCTCTGTGTTTGAAACAAACATTCGAGTGGTAG  370

Query  371  GAGGACTCCTGTCTGCTCATCTGCTCTCCAAGAAGGCTGGGGTGGAAGTAGAGGCTGGATGGCCCTGTTCCGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGGACTCCTGTCTGCTCATCTGCTCTCCAAGAAGGCTGGGGTGGAAGTAGAGGCTGGATGGCCCTGTTCCGGG  444

Query  445  CCTCTCCTGAGAATGGCTGAGGAGGCGGCCCGAAAACTCCTCCCAGCCTTTCAGACCCCCACTGGCATGCCATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCTCCTGAGAATGGCTGAGGAGGCGGCCCGAAAACTCCTCCCAGCCTTTCAGACCCCCACTGGCATGCCATA  518

Query  519  TGGAACAGTGAACTTACTTCATGGCGTGAACCCAGGAGAGACCCCTGTCACCTGTACGGCAGGGATTGGGACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAACAGTGAACTTACTTCATGGCGTGAACCCAGGAGAGACCCCTGTCACCTGTACGGCAGGGATTGGGACCT  592

Query  593  TCATTGTTGAATTTGCCACCCTGAGCAGCCTCACTGGTGACCCGGTGTTCGAAGATGTGGCCAGAGTGGCTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATTGTTGAATTTGCCACCCTGAGCAGCCTCACTGGTGACCCGGTGTTCGAAGATGTGGCCAGAGTGGCTTTG  666

Query  667  ATGCGCCTCTGGGAGAGCCGGTCAGATATCGGGCTGGTCGGCAACCACATTGATGTGCTCACTGGCAAGTGGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGCGCCTCTGGGAGAGCCGGTCAGATATCGGGCTGGTCGGCAACCACATTGATGTGCTCACTGGCAAGTGGGT  740

Query  741  GGCCCAGGACGCAGGCATCGGGGCTGGCGTGGACTCCTACTTTGAGTACTTGGTGAAAGGAGCCATCCTGCTTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCCAGGACGCAGGCATCGGGGCTGGCGTGGACTCCTACTTTGAGTACTTGGTGAAAGGAGCCATCCTGCTTC  814

Query  815  AGGATAAGAAGCTCATGGCCATGTTCCTAGAGTATAACAAAGCCATCCGGAACTACACCCGCTTCGATGACTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGATAAGAAGCTCATGGCCATGTTCCTAGAGTATAACAAAGCCATCCGGAACTACACCCGCTTCGATGACTGG  888

Query  889  TACCTGTGGGTTCAGATGTACAAGGGGACTGTGTCCATGCCAGTCTTCCAGTCCTTGGAGGCCTACTGGCCTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCTGTGGGTTCAGATGTACAAGGGGACTGTGTCCATGCCAGTCTTCCAGTCCTTGGAGGCCTACTGGCCTGG  962

Query  963  TCTTCAGAGCCTCATTGGAGACATTGACAATGCCATGAGGACCTTCCTCAACTACTACACTGTATGGAAGCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTTCAGAGCCTCATTGGAGACATTGACAATGCCATGAGGACCTTCCTCAACTACTACACTGTATGGAAGCAGT  1036

Query 1037  TTGGGGGGCTCCCGGAATTCTACAACATTCCTCAGGGATACACAGTGGAGAAGCGAGAGGGCTACCCACTTCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGGGGGCTCCCGGAATTCTACAACATTCCTCAGGGATACACAGTGGAGAAGCGAGAGGGCTACCCACTTCGG  1110

Query 1111  CCAGAACTTATTGAAAGCGCAATGTACCTCTACCGTGCCACGGGGGATCCCACCCTCCTAGAACTCGGAAGAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAGAACTTATTGAAAGCGCAATGTACCTCTACCGTGCCACGGGGGATCCCACCCTCCTAGAACTCGGAAGAGA  1184

Query 1185  TGCTGTGGAATCCATTGAAAAAATCAGCAAGGTGGAGTGCGGATTTGCAACAATCAAAGATCTGCGAGACCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTGTGGAATCCATTGAAAAAATCAGCAAGGTGGAGTGCGGATTTGCAACAATCAAAGATCTGCGAGACCACA  1258

Query 1259  AGCTGGACAACCGCATGGAGTCGTTCTTCCTGGCCGAGACTGTGAAATACCTCTACCTCCTGTTTGACCCAACC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTGGACAACCGCATGGAGTCGTTCTTCCTGGCCGAGACTGTGAAATACCTCTACCTCCTGTTTGACCCAACC  1332

Query 1333  AACTTCATCCACAACAATGGGTCCACCTTCGACACGGTGATCACCCCCTATGGGGAGTGCATCCTGGGGGCTGG  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACTTCATCCACAACAATGGGTCCACCTTCGACGCGGTGATCACCCCCTATGGGGAGTGCATCCTGGGGGCTGG  1406

Query 1407  GGGGTACATCTTCAACACAGAAGCTCACCCCATCGACCCTGCCGCCCTGCACTGCTGCCAGAGGCTGAAGGAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGTACATCTTCAACACAGAAGCTCACCCCATCGACCCTGCCGCCCTGCACTGCTGCCAGAGGCTGAAGGAAG  1480

Query 1481  AGCAGTGGGAGGTGGAGGACTTGATGAGGGAATTCTACTCTCTCAAACGGAGCAGGTCGAAATTTCAGAAAAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCAGTGGGAGGTGGAGGACTTGATGAGGGAATTCTACTCTCTCAAACGGAGCAGGTCGAAATTTCAGAAAAAC  1554

Query 1555  ACTGTTAGTTCGGGGCCATGGGAACCTCCAGCAAGGCCAGGAACACTCTTCTCACCAGAAAACCATGACCAGGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGTTAGTTCGGGGCCATGGGAACCTCCAGCAAGGCCAGGAACACTCTTCTCACCAGAAAACCATGACCAGGC  1628

Query 1629  AAGGGAGAGGAAGCCTGCCAAACAGAAGGTCCCACTTCTCAGCTGCCCCAGTCAGCCCTTCACCTCCAAGTTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGGGAGAGGAAGCCTGCCAAACAGAAGGTCCCACTTCTCAGCTGCCCCAGTCAGCCCTTCACCTCCAAGTTGG  1702

Query 1703  CATTACTGGGACAGGTTTTCCTAGACTCCTCA  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATTACTGGGACAGGTTTTCCTAGACTCCTCA  1734