Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08575
• Subject: NR_026728.2
• Aligned Length: 2100
• Identities: 1733
• Gaps: 366

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GAACCCGCAGCAGCTCCCAGGATGAACTGGTTGCAGTGGCTGCTGCTGCTGCGGGGGCGCTGAGAGGACACGAG  74

Query    1  ----ATGCCTTTCCGGCTGCTCATCCCGCTCGGCCTCCTGTGCGCGCTGCTGCCTCAGCACCATGGTGCGCCAG  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTATGCCTTTCCGGCTGCTCATCCCGCTCGGCCTCCTGTGCGCGCTGCTGCCTCAGCACCATGGTGCGCCAG  148

Query   71  GTCCCGACGGCTCCGCGCCAGATCCCGCCCACTA----------------------------------------  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  149  GTCCCGACGGCTCCGCGCCAGATCCCGCCCACTACAGGTGAACTGTGACCCGCCCTTTCGCAGTTGGGGAATGG  222

Query  105  --------------------------------------------------------------------------  104
                                                                                      
Sbjct  223  GAAGCGTGAACCCGGTCCTTTCCCTTTCCGTCCATCCCAGACCCCGACTTGCTCCGACACAGCCGCTAGGTCCC  296

Query  105  --------------------------------------------------------------------------  104
                                                                                      
Sbjct  297  AGGGAGAAATCAGCTAGTGATTCCCACTTTCCGCCCTGTATCTTGTTCTTCCCCCGCTTGTTTTTGTGTTCTTG  370

Query  105  ----------------------------CAGGGAGCGAGTCAAGGCCATGTTCTACCACGCCTACGACAGCTAC  150
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCATGCCTGATTTCTCGTCCCCCACCCAGGGAGCGAGTCAAGGCCATGTTCTACCACGCCTACGACAGCTAC  444

Query  151  CTGGAGAATGCCTTTCCCTTCGATGAGCTGCGACCTCTCACCTGTGACGGGCACGACACCTGGGGCAGTTTTTC  224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAGAATGCCTTTCCCTTCGATGAGCTGCGACCTCTCACCTGTGACGGGCACGACACCTGGGGCAGTTTTTC  518

Query  225  TCTGACTCTAATTGATGCACTGGACACCTTGCTGATTTTGGGGAATGTCTCAGAATTCCAAAGAGTGGTTGAAG  298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGACTCTAATTGATGCACTGGACACCTTGCTGATTTTGGGGAATGTCTCAGAATTCCAAAGAGTGGTTGAAG  592

Query  299  TGCTCCAGGACAGCGTGGACTTTGATATTGATGTGAACGCCTCTGTGTTTGAAACAAACATTCGAGTGGTAGGA  372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCAGGACAGCGTGGACTTTGATATTGATGTGAACGCCTCTGTGTTTGAAACAAACATTCGAGTGGTAGGA  666

Query  373  GGACTCCTGTCTGCTCATCTGCTCTCCAAGAAGGCTGGGGTGGAAGTAGAGGCTGGATGGCCCTGTTCCGGGCC  446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACTCCTGTCTGCTCATCTGCTCTCCAAGAAGGCTGGGGTGGAAGTAGAGGCTGGATGGCCCTGTTCCGGGCC  740

Query  447  TCTCCTGAGAATGGCTGAGGAGGCGGCCCGAAAACTCCTCCCAGCCTTTCAGACCCCCACTGGCATGCCATATG  520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTCCTGAGAATGGCTGAGGAGGCGGCCCGAAAACTCCTCCCAGCCTTTCAGACCCCCACTGGCATGCCATATG  814

Query  521  GAACAGTGAACTTACTTCATGGCGTGAACCCAGGAGAGACCCCTGTCACCTGTACGGCAGGGATTGGGACCTTC  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAACAGTGAACTTACTTCATGGCGTGAACCCAGGAGAGACCCCTGTCACCTGTACGGCAGGGATTGGGACCTTC  888

Query  595  ATTGTTGAATTTGCCACCCTGAGCAGCCTCACTGGTGACCCGGTGTTCGAAGATGTGGCCAGAGTGGCTTTGAT  668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGTTGAATTTGCCACCCTGAGCAGCCTCACTGGTGACCCGGTGTTCGAAGATGTGGCCAGAGTGGCTTTGAT  962

Query  669  GCGCCTCTGGGAGAGCCGGTCAGATATCGGGCTGGTCGGCAACCACATTGATGTGCTCACTGGCAAGTGGGTGG  742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGCCTCTGGGAGAGCCGGTCAGATATCGGGCTGGTCGGCAACCACATTGATGTGCTCACTGGCAAGTGGGTGG  1036

Query  743  CCCAGGACGCAGGCATCGGGGCTGGCGTGGACTCCTACTTTGAGTACTTGGTGAAAGGAGCCATCCTGCTTCAG  816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCAGGACGCAGGCATCGGGGCTGGCGTGGACTCCTACTTTGAGTACTTGGTGAAAGGAGCCATCCTGCTTCAG  1110

Query  817  GATAAGAAGCTCATGGCCATGTTCCTAGAGTATAACAAAGCCATCCGGAACTACACCCGCTTCGATGACTGGTA  890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATAAGAAGCTCATGGCCATGTTCCTAGAGTATAACAAAGCCATCCGGAACTACACCCGCTTCGATGACTGGTA  1184

Query  891  CCTGTGGGTTCAGATGTACAAGGGGACTGTGTCCATGCCAGTCTTCCAGTCCTTGGAGGCCTACTGGCCTGGTC  964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGTGGGTTCAGATGTACAAGGGGACTGTGTCCATGCCAGTCTTCCAGTCCTTGGAGGCCTACTGGCCTGGTC  1258

Query  965  TTCAGAGCCTCATTGGAGACATTGACAATGCCATGAGGACCTTCCTCAACTACTACACTGTATGGAAGCAGTTT  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGAGCCTCATTGGAGACATTGACAATGCCATGAGGACCTTCCTCAACTACTACACTGTATGGAAGCAGTTT  1332

Query 1039  GGGGGGCTCCCGGAATTCTACAACATTCCTCAGGGATACACAGTGGAGAAGCGAGAGGGCTACCCACTTCGGCC  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGGGGCTCCCGGAATTCTACAACATTCCTCAGGGATACACAGTGGAGAAGCGAGAGGGCTACCCACTTCGGCC  1406

Query 1113  AGAACTTATTGAAAGCGCAATGTACCTCTACCGTGCCACGGGGGATCCCACCCTCCTAGAACTCGGAAGAGATG  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAACTTATTGAAAGCGCAATGTACCTCTACCGTGCCACGGGGGATCCCACCCTCCTAGAACTCGGAAGAGATG  1480

Query 1187  CTGTGGAATCCATTGAAAAAATCAGCAAGGTGGAGTGCGGATTTGCAACAATCAAAGATCTGCGAGACCACAAG  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGTGGAATCCATTGAAAAAATCAGCAAGGTGGAGTGCGGATTTGCAACAATCAAAGATCTGCGAGACCACAAG  1554

Query 1261  CTGGACAACCGCATGGAGTCGTTCTTCCTGGCCGAGACTGTGAAATACCTCTACCTCCTGTTTGACCCAACCAA  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGGACAACCGCATGGAGTCGTTCTTCCTGGCCGAGACTGTGAAATACCTCTACCTCCTGTTTGACCCAACCAA  1628

Query 1335  CTTCATCCACAACAATGGGTCCACCTTCGACACGGTGATCACCCCCTATGGGGAGTGCATCCTGGGGGCTGGGG  1408
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCATCCACAACAATGGGTCCACCTTCGACGCGGTGATCACCCCCTATGGGGAGTGCATCCTGGGGGCTGGGG  1702

Query 1409  GGTACATCTTCAACACAGAAGCTCACCCCATCGACCCTGCCGCCCTGCACTGCTGCCAGAGGCTGAAGGAAGAG  1482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGTACATCTTCAACACAGAAGCTCACCCCATCGACCCTGCCGCCCTGCACTGCTGCCAGAGGCTGAAGGAAGAG  1776

Query 1483  CAGTGGGAGGTGGAGGACTTGATGAGGGAATTCTACTCTCTCAAACGGAGCAGGTCGAAATTTCAGAAAAACAC  1556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGTGGGAGGTGGAGGACTTGATGAGGGAATTCTACTCTCTCAAACGGAGCAGGTCGAAATTTCAGAAAAACAC  1850

Query 1557  TGTTAGTTCGGGGCCATGGGAACCTCCAGCAAGGCCAGGAACACTCTTCTCACCAGAAAACCATGACCAGGCAA  1630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGTTAGTTCGGGGCCATGGGAACCTCCAGCAAGGCCAGGAACACTCTTCTCACCAGAAAACCATGACCAGGCAA  1924

Query 1631  GGGAGAGGAAGCCTGCCAAACAGAAGGTCCCACTTCTCAGCTGCCCCAGTCAGCCCTTCACCTCCAAGTTGGCA  1704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGGAGAGGAAGCCTGCCAAACAGAAGGTCCCACTTCTCAGCTGCCCCAGTCAGCCCTTCACCTCCAAGTTGGCA  1998

Query 1705  TTACTGGGACAGGTTTTCCTAGACTCCTCA--------------------------------------------  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1999  TTACTGGGACAGGTTTTCCTAGACTCCTCATAACCACTGGATAATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGGCTAAA  2072

Query 1735  ----------------------------  1734
                                        
Sbjct 2073  CTATAATAAATTGCTTTTGGCTATCATA  2100