Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08580
- Subject:
- XM_017321903.1
- Aligned Length:
- 2258
- Identities:
- 1821
- Gaps:
- 79
Alignment
Query 1 ---------------------ATGGAAGAAGAAGGGCTGGAGTGTCCAAACTCTTCCTCTGAAAAACGCTATTT 53
|||||.|||||.|..|||||...|||.|||.|.||..|.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCTCCCTGCGGGAAGAAATGGATGAAGAGGAACTGGACCATCCGAACGCCTCTCCAGAGAAACGCTATTT 74
Query 54 TCCTGAATCCCTGGATTCCAGCGATGGGGATGAGGAAGAGGTTTTGGCCTGTGAGGATTTGGAACTTAACCCCT 127
.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||.|||..|||||||.||||||.||||.||.|||||||
Sbjct 75 CCCCGAGTCCCTAGATTCCAGTGACGGGGACGAGGAAGGGGTCCTGGCCTGCGAGGATCTGGAGCTGAACCCCT 148
Query 128 TTGATGGATTGCCATATTCATCACGTTATTATAAACTTCTGAAAGAAAGAGAAGATCTTCCTATATGGAAAGAA 201
||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 TTGACGGCTTACCGTATTCATCGCGATATTACAAACTTTTGAAAGAGAGAGAAGAGCTTCCGATATGGAAAGAA 222
Query 202 AAATACTCCTTTATGGAGAACCTGCTTCAAAATCAAATCGTGATTGTTTCAGGAGATGCTAAATGTGGTAAGAG 275
||.||||||||.|||||||..|||||.|||||.||..|.|||.|.||.|||||.||..|.||.|||||.|||||
Sbjct 223 AAGTACTCCTTCATGGAGAGTCTGCTGCAAAACCAGGTTGTGGTGGTGTCAGGGGACTCCAAGTGTGGCAAGAG 296
Query 276 CGCTCAGGTTCCTCAGTGGTGTGCTGAATATTGTCTTTCCATCCACTACCAGCACGGGGGCGTGATATGCACAC 349
|.|| |||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CTCT---------------------------------------------CAGCACGGGGGCGTGATATGCACCC 325
Query 350 AGGTCCACAAGCAGACTGTGGTCCAGCTCGCCCTGCGGGTGGCGGATGAAATGGATGTTAACATTGGTCATGAG 423
|||.||||||.|||||.|..||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||.
Sbjct 326 AGGCCCACAAACAGACGGCAGTCCAGCTGGCCCTGCGGGTGGCCGACGAGATGGATGTGAATATCGGGCACGAA 399
Query 424 GTTGGCTACGTGATCCCTTTCGAGAACTGCTGTACCAACGAAACAATCCTGAGGTATTGTACTGATGATATGCT 497
||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 400 GTCGGCTATGTGATTCCTTTTGAGAACTGCTGCACCACTGAAACAATCCTGAGGTACTGTACTGATGACATGCT 473
Query 498 GCAAAGAGAAATGATGTCCAATCCTTTTTTGGGTAGCTATGGGGTCATCATCTTAGATGATATTCATGAAAGAA 571
|||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.||.||.||||
Sbjct 474 GCAGAGAGAGATGATGTCCAACCCTTTCCTGGGTAGCTATGGCGTCATCATCTTGGACGATGTCCACGAGAGAA 547
Query 572 GCATTGCAACTGATGTGTTACTTGGACTTCTTAAAGATGTTTTACTAGCAAGACCAGAACTGAAGCTCATAATT 645
||.|.||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 548 GCCTGGCGACTGACGTGCTGCTCGGACTCCTTAAAGATGTGCTGCTGGCAAGACCAGAGCTGAAGCTCATAGTT 621
Query 646 AACTCCTCACCTCACCTGATCAGCAAACTCAATTCTTATTATGGAAACGTGCCTGTCATAGAAGTGAAAAATAA 719
||||.|||.||||.|||.|.|||.|||||||.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 622 AACTGCTCGCCTCTCCTCACCAGTAAACTCAGTTCCTACTATGGAGACGTGCCTGTCATAGAAGTGAGAAATAA 695
Query 720 ACACCCTGTGGAGGTTGTGTACCTTAGTGAGGCTCAAAAGGATTCTTTTGAGTCTATTTTACGCCTTATCTTTG 793
.|||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 696 GCACCCGGTGGAGGTGGTGTACCTTAGTGGGGCTCAGAAGGATTCCTTCGAGTCTGTCATACGCCTTATCTTTG 769
Query 794 AAATTCACCACTCGGGTGAGAAAGGTGACATTGTAGTCTTTCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAGAAAGTCTGT 867
||||.||||.||||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||.|
Sbjct 770 AAATCCACCGCTCGGGTGAGAAGGGTGACGTTGTGGTCTTCCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAAAAAACCTAT 843
Query 868 GAAACTGTCTATC---AAGGATCTAACCTAAACCCAGATCTTGGAGAACTGGTGGTTGTTCCTTTGTATCCAAA 938
|||..|||.|.|| |||||||.|||.|||||||||||.|.||.||.||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct 844 GAACTTGTGTGTCAGGAAGGATCCAACTTAAACCCAGATGTGGGCGACCTGGTGGTCATCCCTTTGTATCCCAA 917
Query 939 AGAGAAATGTTCA--TTGTTCAAGCCACTCGATGAAACAGAAAAAAGATGCCAAGTTTATCAAAGAAGAGTGGT 1010
|||||| ||.|| .||||||.||||.|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||
Sbjct 918 AGAGAA--GTGCAGCCTGTTCAGGCCAGTGGACGAAACCGAGAAAAGATGCCAAGTGTATCAGAGACGGGTGGT 989
Query 1011 GTTAACTACTAGCTCTGGAGAGTTTTTGATCTGGAGCAACTCAGTCAGATTTGTTATCGATGTGGGTGTGGAAA 1084
|.|.||.||.||||..||.||||.|.|||||||||||.||.|.||||.||||||.||.|||||.|||.||||||
Sbjct 990 GCTGACCACCAGCTGCGGGGAGTCTCTGATCTGGAGCCACACGGTCAAATTTGTCATTGATGTTGGTCTGGAAA 1063
Query 1085 GAAGAAAGGTGTACAACCCGAGAATAAGAGCAAACTCGCTCGTCATGCAGCCCATCAGCCAGAGCCAGGCAGAG 1158
|||||.||||.||.|||||..|.||.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1064 GAAGACAGGTATATAACCCCCGGATCAGAGCCAACTCCCTCGTCCTGCAGCCCATCAGCCAAAGCCAAGCAGAG 1137
Query 1159 ATACGCAAGCAGATTCTTGGCTCATCTTCTTCAGGAAAATTTTTCTGCCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAA 1232
||.||.||||||.|.||.||.||.|||.|.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ATCCGGAAGCAGCTCCTCGGGTCTTCTCCCTCAGGAAAACTTTTCTGTCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAA 1211
Query 1233 AGACATGACGCCACTGAAGCCAGCAGAAATGCAGGAAGCCAACCTAACAAGCATGGTGCTTTTTATGAAGAGGA 1306
||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.
Sbjct 1212 AGACATGAGGCCCCTTAAGCCAGCGGAAATGCAGGAAGCCAACCTGACTAGCATGGTGCTCTTCATGAAGAGGG 1285
Query 1307 TAGACATTGCGGGCCTAGGCCACTGTGACTTCATGAACAGACCAGCACCAGAAAGTTTGATGCAGGCATTGGAA 1380
|.||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||
Sbjct 1286 TGGACATTGCAGGCCTGGGCCGCTGCGACTTCATGAACAGGCCAGCTCCAGAAAGCCTGATGCAGGCACTGGAA 1359
Query 1381 GACTTAGATTATCTGGCAGCACTGGATAATGATGGAAATCTTTCTGAATTTGGAATCATCATGTCAGAGTTTCC 1454
||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1360 GATTTAGATTACCTGGCAGCCCTGGACAACGATGGGAATCTCTCTGAGTTTGGAATCATCATGTCTGAGTTTCC 1433
Query 1455 TCTTGATCCACAACTCTCGAAGTCTATCTTAGCGTCCTGTGAATTTGACTGTGTAGATGAAGTGCTAACAATCG 1528
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1434 TCTGGATCCACAGCTCTCAAAGTCTATCTTAGCATCCTGTGAATTTGACTGTGTAGACGAAATGCTAACCATCG 1507
Query 1529 CGGCCATGGTAACAGCTCCAAATTGCTTTTCACATGTGCCACATGGAGCTGAAGAGGCTGCCTTGACTTGTTGG 1602
|.|||||||||||||||||.|.||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||..|||||||.|||
Sbjct 1508 CTGCCATGGTAACAGCTCCCAGTTGCTTTTTGCACGTGCCTCATGGTGCTGAGGAGGCTGCAGTGACTTGCTGG 1581
Query 1603 AAGACATTTTTACATCCCGAAGGAGATCACTTTACCCTCATCAGCATTTACAAGGCTTACCAAGACACAACTCT 1676
||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||...|.|||||.||.||||||||.|||..|||
Sbjct 1582 AAAACGTTCTTGCACCCTGAAGGTGATCACTTTACGCTCATCAATGTCTACAATGCCTACCAAGATACAGTTCT 1655
Query 1677 GAATTCTAGCAGTGAGTACTGTGTGGAAAAGTGGTGTCGTGATTACTTCCTCAACTGTTCAGCACTCAGAATGG 1750
|||.|||..||.|||..||||||||||.|.||||||||..||||.||||||||.|||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1656 GAACTCTGCCAATGAACACTGTGTGGAGATGTGGTGTCACGATTGCTTCCTCAGCTGCTCTGCTCTCAGGATGG 1729
Query 1751 CAGATGTTATTCGAGCTGAACTCTTAGAAATTATCAAGCGAATCGAGCTTCCCTATGCAGAACCTGCTTTTGGC 1824
||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1730 CAGACGTTATCCGAGCAGAACTCTTAGAGATCATCAAGCGGATCGAGCTTCCCTATGCAGAGCCTGCCTTTGGC 1803
Query 1825 TCCAAGGAAAACACTCTAAACATAAAGAAAGCTCTTCTGTCCGGTTACTTTATGCAGATTGCTCGGGATGTTGA 1898
||||||||||||....|.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 TCCAAGGAAAACGGGTTGAACATCAAGAAAGCGCTGCTCTCTGGGTACTTCATGCAGATTGCTCGGGATGTTGA 1877
Query 1899 TGGATCAGGTAACTACTTAATGCTGACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCCTGTCTGGTTACTCAATCA 1972
.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.||||
Sbjct 1878 CGGGTCAGGTAACTACTTGATGCTTACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCTTATCAAGCTATTCCATCA 1951
Query 1973 CCAAGAAGATGCCAGAGTGGGTCCTCTTCCATAAATTCAGCATTTCTGAGAACAACTACATCAGGATTACCTCA 2046
|||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||.|..||||.
Sbjct 1952 CCAAGAAGATGCCCGAGTGGGTCCTCTTCCACCAGTTCAGCATATCTGAGAACAACTACATCAGGGTCGCCTCC 2025
Query 2047 GAAATCTCTCCTGAACTATTTATGCAGCTGGTACCACAATACTATTTCAGTAATCTGCCTCCTAGTGAAAGTAA 2120
|.|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2026 GCAGTCTCCCCTGAGCTATTTATGCAGCTGGTACCACAGTACTATTTCAGTAACCTGCCTCCTAGTGAAAGCAA 2099
Query 2121 GGACATTCTACAGCAAGTAGTGGATCACCTATCCCCTGTGTCAACAATGAATAAGGAACAGCAAATGTGTGAGA 2194
||||||.||||||||||..|..|..||||||.||.|.| .|||..||||.|||||.|||.|..|||||||.|
Sbjct 2100 GGACATCCTACAGCAAGCTGCAGGCCACCTACCCACAG---AAACTGTGAACAAGGACCAGGATGTGTGTGACA 2170
Query 2195 CGTGCCC---TGAAACTGAACAGAGATGCACTCTCCAG 2229
.|||||| ||..|||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 2171 AGTGCCCAGATGCTACTGAGCAGAGATGCACAATCCAG 2208