Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08585
- Subject:
- NM_001159749.2
- Aligned Length:
- 1657
- Identities:
- 1415
- Gaps:
- 236
Alignment
Query 1 ATGGGGAAAGTGAATGTGGCCAAGTTGCGTTACATGAGCCGAGATGACTTCAGGGTCTTGACCGCGGTTGAAAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGAAAGTGAATGTGGCCAAGTTGCGTTACATGAGCCGAGATGACTTCAGGGTCTTGACCGCGGTTGAAAT 74
Query 75 GGGCATGAAGAACCATGAAATTGTTCCCGGCAGTTTGATTGCTTCTATAGCCAGCCTTAAACATGGTGGCTGTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGCATGAAGAACCATGAAATTGTTCCCGGCAGTTTGATTGCTTCTATAGCCAGCCTTAAACATGGTGGCTGTA 148
Query 149 ATAAAGTTTTAAGAGAATTAGTGAAACATAAACTCATAGCTTGGGAGCGTACCAAAACTGTCCAGGGCTATCGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATAAAGTTTTAAGAGAATTAGTGAAACATAAACTCATAGCTTGGGAGCGTACCAAAACTGTCCAGGGCTATCGG 222
Query 223 TTGACAAATGCAGGATATGATTACCTAGCTTTGAAAACACTTTCTTCTAGGCAAGTAGTTGAGTCTGTTGGAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGACAAATGCAGGATATGATTACCTAGCTTTGAAAACACTTTCTTCTAGGCAAGTAGTTGAGTCTGTTGGAAA 296
Query 297 CCAGATGGGTGTTGGCAAAGAATCAGATATTTACATTGTTGCAAATGAAGAAGGACAACAATTTGCATTAAAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGATGGGTGTTGGCAAAGAATCAGATATTTACATTGTTGCAAATGAAGAAGGACAACAATTTGCATTAAAGC 370
Query 371 TTCACAGACTAGGAAGAACCTCGTTTCGAAATTTGAAAAACAAACGCGATTATCATAAATATAGGCACAATGTG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 371 TTCACAGACTAGGAAGAACCTCGTTTCGAAATTTGAAAAACAAACGCGATTATCATAAACATAGGCACAATGTG 444
Query 445 TCATGGCTATATTTATCTCGTCTCTCTGCCATGAAGGAATTTGCCTATATGAAGGCATTGTATGAGAGGAAATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCATGGCTATATTTATCTCGTCTCTCTGCCATGAAGGAATTTGCCTATATGAAGGCATTGTATGAGAGGAAATT 518
Query 519 TCCAGTTCCAAAGCCAATTGATTACAATCGTCATGCAGTGGTCATGGAACTCATAAATGGTTATCCACTATGTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCAGTTCCAAAGCCAATTGATTACAATCGTCATGCAGTGGTCATGGAACTCATAAATGGTTATCCACTATGTC 592
Query 593 AGATACACCATGTTGAAGATCCTGCATCAGTATATGATGAAGCTATGGAACTAATTGTCAAACTTGCAAATCAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGATACACCATGTTGAAGATCCTGCATCAGTATATGATGAAGCTATGGAACTAATTGTCAAACTTGCAAATCAT 666
Query 667 GGGCTGATTCATGGAGATTTTAATGAATTTAATCTCATTTTGGATGAAAGTGACCATATCACCATGATTGATTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGCTGATTCATGGAGATTTTAATGAATTTAATCTCATTTTGGATGAAAGTGACCATATCACCATGATTGATTT 740
Query 741 TCCACAGATGGTTTCAACTTCTCATCCCAATGCTGAGTGGTATTTTGACAGAGATGTTAAATGCATTAAAGATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCACAGATGGTTTCAACTTCTCATCCCAATGCTGAGTGGTATTTTGACAGAGATGTTAAATGCATTAAAGATT 814
Query 815 TCTTTATGAAACGTTTCAGCTACGAAAGTGAGCTTTTTCCAACTTTTAAGGATATCAGGAGAGAAGACACTCTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTTTATGAAACGTTTCAGCTACGAAAGTGAGCTTTTTCCAACTTTTAAGGATATCAGGAGAGAAGACACTCTT 888
Query 889 GATGTGGAGGTTTCTGCCAGTGGCTACACAAAGGAAATGCAGGCAGATGATGAACTGCTTCATCCATTAGGTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATGTGGAGGTTTCTGCCAGTGGCTACACAAAGGAAATGCAGGCAGATGATGAACTGCTTCATCCATTAGGTCC 962
Query 963 AGATGATAAAAATATTGAAACAAAAGAGGGATCTGAATTCTCATTTTCAGATGGAGAAGTGGCAGAAAAAGCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGATGATAAAAATATTGAAACAAAAGAGGGATCTGAATTCTCATTTTCAGATGGAGAAGTGGCAGAAAAAGCAG 1036
Query 1037 AGGTTTACGGGTCAGAAAATGAAAGTGAACGGAACTGTCTAGAAGAATCAGAGGGCTGCTATTGCAGATCATCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGTTTACGGGTCAGAAAATGAAAGTGAACGGAACTGTCTAGAAGAATCAGAGGGCTGCTATTGCAGATCATCT 1110
Query 1111 GGAGACCCTGAACAAATAAAGGAAGACAGTTTATCAGAAGAGAGTGCTGATGCACGGAGTTTTGAAATGACTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGAGACCCTGAACAAATAAAGGAAGACAGTTTATCAGAAGAGAGTGCTGATGCACGGAGTTTTGAAATGACTGA 1184
Query 1185 ATTCAATCAAGCTTTAGAAGAAATAAAAGGGCAGGTTGTTGAAAACAACTCTGTAACTGAATTTTCTGAGGAGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATTCAATCAAGCTTTAGAAGAAATAAAAGGGCAGGTTGTTGAAAACAACTCTGTAACTGAATTTTCTGAGGAGA 1258
Query 1259 AAAACAGAACTGAAAATTACAACAGGCAAGATGGTCAGAGAGTTCAAGGAGGAGTCCCTGCTGGCTCTGACGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAACAGAACTGAAAATTACAACAGGCAAGATGGTCAGAGAGTTCAAGGAGGAGTCCCTGCTGGCTCTGACGAG 1332
Query 1333 TATGAAGATGAATGCCCTCATCTAATTGCCTTGTCGTCATTAAATAGAGAATTCAGGCCTTTCAGAGATGAAGA 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TATGAAGATGAATGCCCTCATCTAATTGCCTTGTCGTCATTAAATAGAGAATTCAGGCCTTTCAG--------- 1397
Query 1407 AAATGTGGGAGCTATGAATCAGTATAGAACAAGAACTCTGAGTATCACTTCTTCAGGC-AGTGCTGTAAGCTGT 1479
||||||| ||||.|.| |.||||.|.
Sbjct 1398 ---------------------GTATAGA----------------------CTTCTGTCGATTGCTTTT------ 1422
Query 1480 TCAACAATTCCTCCAGAACTGGTGAAACAGAAGGTGAAACGTCAGTTGACAAAACAGCAAAAATCAGCTGTCAG 1553
Sbjct 1423 -------------------------------------------------------------------------- 1422
Query 1554 ACGTCGATTGCAGAAAGGAGAAGCAAATATATTTACCAAGCAACGTAGGGAAAACATGCAAAATATCAAATCAA 1627
Sbjct 1423 -------------------------------------------------------------------------- 1422
Query 1628 GTTTGGAACCAGCCAGCTTTTGGGGAGAA 1656
Sbjct 1423 ----------------------------- 1422