Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08603
• Subject: NM_001145356.1
• Aligned Length: 1194
• Identities: 1003
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTACCGGCTGTTGGATCTGCGGATGAGGAGGAGGATCCTGCGGAGGAGGATTGTCCTGAATTGGTTCCCAT  74

Query    1  -----------------------ATGTATTTCAAACGT---GCCGCTCGG-GCC---TTTCCCGT----ATTGC  40
                                   |.|      |||.||   ||  ||||| |||   .|.||.||    ||| .
Sbjct   75  TGAGACGACGCAAAGCGAGGAGGAGG------AAAAGTCTGGC--CTCGGCGCCAAGATCCCAGTCACAATT-A  139

Query   41  TCAC---------TGGTGCTGGGAAGACAACACTTCTGAACTATATTTTGACAGAGCAACATAGTAAAAGAGTA  105
            ||||         .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  TCACCGGGTATTTAGGTGCTGGGAAGACAACACTTCTGAACTATATTTTGACAGAGCAACATAGTAAAAGAGTA  213

Query  106  GCGGTCATTTTAAATGAATTTGGGGAAGGAAGTGCGCTGGAGAAATCCTTAGCTGTCAGCCAAGGTGGAGAGCT  179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GCGGTCATTTTAAATGAATTTGGGGAAGGAAGTGCGCTGGAGAAATCCTTAGCTGTCAGCCAAGGTGGAGAGCT  287

Query  180  CTATGAAGAGTGGCTGGAACTTAGAAACGGTTGCCTCTGCTGTTCAGTGAAGGACAGTGGCCTTAGAGCTATTG  253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  CTATGAAGAGTGGCTGGAACTTAGAAACGGTTGCCTCTGCTGTTCAGTGAAGGACAGTGGCCTTAGAGCTATTG  361

Query  254  AGAATTTGATGCAAAAGAAGGGGAAATTTGATTACATACTGTTAGAGACCACTGGATTAGCAGACCCTGGTGCA  327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  AGAATTTGATGCAAAAGAAGGGGAAATTTGATTACATACTGTTAGAGACCACTGGATTAGCAGACCCTGGTGCA  435

Query  328  GTGGCTTCTATGTTTTGGGTTGATGCTGAATTAGGGAGTGATATTTATCTTGATGGTATCATAACTATTGTGGA  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  GTGGCTTCTATGTTTTGGGTTGATGCTGAATTAGGGAGTGATATTTATCTTGATGGTATCATAACTATTGTGGA  509

Query  402  TTCAAAATATGGATTAAAACATTTAACAGAAGAGAAACCTGATGGCCTTATCAATGAAGCTACTAGGCAAGTTG  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  510  TTCAAAATATGGATTAAAACATTTAACAGAAGAGAAACCTGATGGCCTTATCAATGAAGCTACTAGACAAGTTG  583

Query  476  CTTTGGCAGATGCCATTCTCATTAATAAAACAGACCTGGTTCCAGAAGAAGATGTAAAGAAATTAAGAACGACA  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  CTTTGGCAGATGCCATTCTCATTAATAAAACAGACCTGGTTCCAGAAGAAGATGTAAAGAAATTAAGAACGACA  657

Query  550  ATTAGATCCATAAATGGACTAGGACAAATCTTAGAAACACAAAGATCAAGAGTTGATCTCTCTAATGTATTAGA  623
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  658  ATTAGATCCATAAATGGACTAGGACAAATCTTAGAAACACAAAGATC---------------------------  704

Query  624  TCTTCATGCCTTTGATAGTCTCTCTGGAATAAGTTTGCAGAAAAAACTTCAGCATGTGCCAGGAACACAACCTC  697
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  ------------------------------AAGTTTGCAGAAAAAACTTCAGCATGTGCCAGGAACACAACCTC  748

Query  698  ACCTTGATCAGAGTATTGTTACAATCACATTTGAAGTACCAGGAAATGCAAAGGAAGAACATCTTAATATGTTT  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  ACCTTGATCAGAGTATTGTTACAATCACATTTGAAGTACCAGGAAATGCAAAGGAAGAACATCTTAATATGTTT  822

Query  772  ATTCAGAATCTCCTGTGGGAAAAGAATGTGAGAAACAAGGACAATCACTGCATGGAGGTCATAAGGCTGAAGGG  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  ATTCAGAATCTCCTGTGGGAAAAGAATGTGAGAAACAAGGACAATCACTGCATGGAGGTCATAAGGCTGAAGGG  896

Query  846  ATTGGTGTCAATCAAAGACAAATCACAACAAGTGATTGTCCAGGGTGTCCATGAGCTCTATGATCTGGAGGAGA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  ATTGGTGTCAATCAAAGACAAATCACAACAAGTGATTGTCCAGGGTGTCCATGAGCTCTATGATCTGGAGGAGA  970

Query  920  CTCCAGTGAGCTGGAAGGATGACACTGAGAGAACAAATCGATTGGTCCTCCTTGGCAGAAATTTAGATAAGGAT  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  CTCCAGTGAGCTGGAAGGATGACACTGAGAGAACAAATCGATTGGTCCTCCTTGGCAGAAATTTAGATAAGGAT  1044

Query  994  ATCCTTAAACAGCTGTTTATAGCTACTGTGACAGAAACAGAAAAGCAGTGGACAACACGTTTCCAAGAAGATCA  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  ATCCTTAAACAGCTGTTTATAGCTACTGTGACAGAAACAGAAAAGCAGTGGACAACACGTTTCCAAGAAGATCA  1118

Query 1068  AGTTTGTACA  1077
            ||||||||||
Sbjct 1119  AGTTTGTACA  1128