Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08611
• Subject: NM_001253701.2
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1213
• Gaps: 146

Alignment

Query    1  MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKL  74
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Sbjct    1  MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKL  74

Query   75  SLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  SLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDA  148

Query  149  FLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFI  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  FLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFI  222

Query  223  PGFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPEPIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  PGFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIG  296

Query  297  GLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKL  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKL  370

Query  371  KVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNES  444
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Sbjct  371  KVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNES  444

Query  445  FNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDL  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDL  518

Query  519  KPHEDQQDINKDVGVKTSESTTTVKSKVGEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHD  592
            ||||||||||||    ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  KPHEDQQDINKD----TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHD  588

Query  593  DVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQNNSNCSSPSRMSD  666
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Sbjct  589  DVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQNNSNCSSPSRMSD  662

Query  667  SVSLNTDSSQDTSLCSPVKQTHIDINSKIRQEDENFNSLLQNGDILNSSTEEKFKAHDKKDFNLPEYDLNVEER  740
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Sbjct  663  SVSLNTDSSQDTSLCSPVKQTHIDINSKIRQEDENFNSLLQNGDILNSSTEEKFKAHDKKDFNLPEYDLNVEER  736

Query  741  LVLIEKSVDSTATADDTHKLDHINMNLNKLITNDTFQPEIMERSKTQDIVLGTSFLSINSKEETEHLENGNKYP  814
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Sbjct  737  LVLIEKSVDSTATADDTHKLDHINMNLNKLITNDTFQPEIMERSKTQDIVLGTSFLSINSKEETEHLENGNKYP  810

Query  815  NLESVNKVNGHSEETSQSPNRTEPHDSDCSVDLGISKSTEDLSPQKSGPVGSVVKSHSITNMEIGGLKIYDILS  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  NLESVNKVNGHSEETSQSPNRTEPHDSDCSVDLGISKSTEDLSPQKSGPVGSVVKSHSITNMEIGGLKIYDILS  884

Query  889  DNGPQQPSTTVKITSAVDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLISGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  DNGPQQPSTTVKITSAVDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLISGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPT  958

Query  963  SGPQSAPQIYGPPQYNIQYSSSAAVKDTLWHSKQNPQIDHASFPPQLLPRSESTENQSYAKHSANMNFSNHNNV  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  SGPQSAPQIYGPPQYNIQYSSSAAVKDTLWHSKQNPQIDHASFPPQLLPRSESTENQSYAKHSANMNFSNHNNV  1032

Query 1037  RANTAYHLHQRLGPARHGEMWAISPNDRLIPAVTRSTIQRQSSVSSTASVNLGDPGSTRRAQIPEGDYLSYREF  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  RANTAYHLHQRLGPARHGEMWAISPNDRLIPAVTRSTIQRQSSVSSTASVNLGDPGSTRRAQIPEGDYLSYREF  1106

Query 1111  HSAGRTPPMMPGSQRPLSARTYSIDGPNASRPQSARPSINEIPERTMSVSDFNYSRTSPSKRPNARVGSEHSLL  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  HSAGRTPPMMPGSQRPLSARTYSIDGPNASRPQSARPSINEIPERTMSVSDFNYSRTSPSKRPNARVGSEHSLL  1180

Query 1185  DPPGKSKVPRDWREQVLRHIGAKKLEKMPLSNGQMGPASQASGKL-----------------------------  1229
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.........                             
Sbjct 1181  DPPGKSKVPRDWREQVLRHIEAKKLEKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPQASVARHPSREQLIDYLMLKVA  1254

Query 1230  --------------------------------------------------------------------------  1229
                                                                                      
Sbjct 1255  HQPPYTQPHCSPRQGHELAKQEIRVRVEKDPELGFSISGGVGGRGNPFRPDDDGIFVTRVQPEGPASKLLQPGD  1328

Query 1230  ---------------------------------------  1229
                                                   
Sbjct 1329  KIIQANGYSFINIEHGQAVSLLKTFQNTVELIIVREVSS  1367