Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08649
• Subject: NM_020647.4
• Aligned Length: 1983
• Identities: 1981
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACGGGAGGAAGGTTCGACTTCGACGATGGCGGCACCTACTGCGGCGGCTGGGAGGAGGGCAAGGCGCACGG  74
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Sbjct    1  ATGACGGGCGGAAGGTTCGACTTCGACGATGGCGGCACCTACTGCGGCGGCTGGGAGGAGGGCAAGGCGCACGG  74

Query   75  GCATGGCATCTGCACGGGGCCCAAGGGCCAGGGCGAGTACTCGGGCTCCTGGTCGCACGGCTTCGAGGTGGTCG  148
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Sbjct   75  GCATGGCATCTGCACGGGGCCCAAGGGCCAGGGCGAGTACTCGGGCTCCTGGTCGCACGGCTTCGAGGTGGTCG  148

Query  149  GAGGCTACACCTGGCCCAGCGGCAACACCTACCAGGGCTACTGGGCGCAGGGCAAGCGGCACGGGCTGGGGGTG  222
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Sbjct  149  GAGGCTACACCTGGCCCAGCGGCAACACCTACCAGGGCTACTGGGCGCAGGGCAAGCGGCACGGGCTGGGGGTG  222

Query  223  GAGACGAAGGGCAAGTGGATGTACCGGGGGGAGTGGTCACATGGTTTCAAGGGGCGCTACGGGGTCCGGCAGAG  296
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Sbjct  223  GAGACGAAGGGCAAGTGGATGTACCGGGGGGAGTGGTCACATGGTTTCAAGGGGCGCTACGGGGTCCGGCAGAG  296

Query  297  CCTGTGCACCCCCGCTCGCTACGAGGGTACCTGGAGTAACGGGCTGCAAGACGGGTACGGCGTGGAGACCTACG  370
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Sbjct  297  CCTGTGCACCCCCGCTCGCTACGAGGGTACCTGGAGTAACGGGCTGCAAGACGGGTACGGCGTGGAGACCTACG  370

Query  371  GGGACGGAGGTACCTACCAGGGCCAGTGGGCCGGAGGCATGCGGCATGGCTACGGCGTGCGCCAGAGCGTGCCC  444
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Sbjct  371  GGGACGGAGGTACCTACCAGGGCCAGTGGGCCGGAGGCATGCGGCATGGCTACGGCGTGCGCCAGAGCGTGCCC  444

Query  445  TACGGCATGGCCACGGTGATCCGCTCACCGCTGCGTACCTCGCTGGCCTCGCTGCGCAGCGAGCAGAGCAATGG  518
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Sbjct  445  TACGGCATGGCCACGGTGATCCGCTCACCGCTGCGTACCTCGCTGGCCTCGCTGCGCAGCGAGCAGAGCAATGG  518

Query  519  CAGCGTGCTCCACGACGCCGCAGCCGCCGCCGACAGCCCGGCCGGCACCCGCGGCGGTTTCGTGCTCAACTTCC  592
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Sbjct  519  CAGCGTGCTCCACGACGCCGCAGCCGCCGCCGACAGCCCGGCCGGCACCCGCGGCGGTTTCGTGCTCAACTTCC  592

Query  593  ACGCAGACGCTGAGCTAGCGGGCAAGAAGAAGGGCGGCCTCTTCCGGAGGGGCTCCCTTCTTGGAAGCATGAAA  666
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Sbjct  593  ACGCAGACGCTGAGCTAGCGGGCAAGAAGAAGGGCGGCCTCTTCCGGAGGGGCTCCCTTCTTGGAAGCATGAAA  666

Query  667  CTTCGCAAGTCCGAATCCAAGTCTTCCATCTCGAGCAAGCGCAGCTCTGTCCGCAGCGACGCGGCCATGAGCAG  740
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Sbjct  667  CTTCGCAAGTCCGAATCCAAGTCTTCCATCTCGAGCAAGCGCAGCTCTGTCCGCAGCGACGCGGCCATGAGCAG  740

Query  741  AATTAGTTCCAGCGATGCCAACTCCACGATCAGCTTTGGCGATGTAGATTGTGATTTTTGCCCGGTGGAAGACC  814
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Sbjct  741  AATTAGTTCCAGCGATGCCAACTCCACGATCAGCTTTGGCGATGTAGATTGTGATTTTTGCCCGGTGGAAGACC  814

Query  815  ACGTGGACGCCACCACCACGGAAACCTACATGGGCGAGTGGAAGAACGACAAGCGCAACGGCTTCGGCGTTAGC  888
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Sbjct  815  ACGTGGACGCCACCACCACGGAAACCTACATGGGCGAGTGGAAGAACGACAAGCGCAACGGCTTCGGCGTTAGC  888

Query  889  GAGCGCTCCAATGGCATGAAGTATGAAGGGGAGTGGGCAAATAACAAGAGGCATGGATATGGCTGTACCGTGTT  962
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Sbjct  889  GAGCGCTCCAATGGCATGAAGTATGAAGGGGAGTGGGCAAATAACAAGAGGCATGGATATGGCTGTACCGTGTT  962

Query  963  TCCTGACGGCTCCAAAGAAGAGGGAAAATACAAAAATAATATTCTGGTCCGTGGGATAAGGAAGCAGCTTATAC  1036
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Sbjct  963  TCCTGACGGCTCCAAAGAAGAGGGAAAATACAAAAATAATATTCTGGTCCGTGGGATAAGGAAGCAGCTTATAC  1036

Query 1037  CAATAAGACATACAAAAACTAGGGAGAAGGTGGACAGAGCAATTGAAGGCGCCCAAAGGGCAGCTGCCATGGCC  1110
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Sbjct 1037  CAATAAGACATACAAAAACTAGGGAGAAGGTGGACAGAGCAATTGAAGGCGCCCAAAGGGCAGCTGCCATGGCC  1110

Query 1111  AGAACCAAAGTGGAAATAGCAAATTCAAGGACTGCACATGCCAGAGCGAAGGCCGATGCCGCCGACCAGGCCGC  1184
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Sbjct 1111  AGAACCAAAGTGGAAATAGCAAATTCAAGGACTGCACATGCCAGAGCGAAGGCCGATGCCGCCGACCAGGCCGC  1184

Query 1185  GCTGGCCGCTCGCCAGGAGTGCGACATCGCGAGAGCTGTGGCCAGGGAGCTGTCACCCGATTTCTACCAACCAG  1258
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Sbjct 1185  GCTGGCCGCTCGCCAGGAGTGCGACATCGCGAGAGCTGTGGCCAGGGAGCTGTCACCTGATTTCTACCAACCAG  1258

Query 1259  GCCCTGATTACGTCAAACAGAGATTTCAGGAAGGTGTAGATGCTAAAGAAAATCCAGAAGAAAAGGTACCAGAA  1332
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Sbjct 1259  GCCCTGATTACGTCAAACAGAGATTTCAGGAAGGTGTAGATGCTAAAGAAAATCCAGAAGAAAAGGTACCAGAA  1332

Query 1333  AAGCCACCTACACCAAAGGAGTCTCCTCATTTTTATCGCAAAGGCACGACACCCCCAAGATCTCCTGAGGCAAG  1406
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Sbjct 1333  AAGCCACCTACACCAAAGGAGTCTCCTCATTTTTATCGCAAAGGCACGACACCCCCAAGATCTCCTGAGGCAAG  1406

Query 1407  TCCCAAACACAGCCACTCTCCTGCTTCCTCCCCAAAGCCCCTGAAGAAGCAAAACCCCAGCTCAGGGGCGAGAC  1480
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Sbjct 1407  TCCCAAACACAGCCACTCTCCTGCTTCCTCCCCAAAGCCCCTGAAGAAGCAAAACCCCAGCTCAGGGGCGAGAC  1480

Query 1481  TCAACCAAGACAAAAGGAGTGTGGCTGATGAGCAGGTGACGGCCATTGTCAATAAGCCCTTGATGTCAAAGGCT  1554
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Sbjct 1481  TCAACCAAGACAAAAGGAGTGTGGCTGATGAGCAGGTGACGGCCATTGTCAATAAGCCCTTGATGTCAAAGGCT  1554

Query 1555  CCCACGAAGGAGGCAGGAGCGGTTGTGCCCCAGTCCAAGTACTCTGGCCGCCACCACATCCCCAACCCCAGTAA  1628
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Sbjct 1555  CCCACGAAGGAGGCAGGAGCGGTTGTGCCCCAGTCCAAGTACTCTGGCCGCCACCACATCCCCAACCCCAGTAA  1628

Query 1629  CGGGGAGCTGCATTCTCAGTATCACGGCTACTACGTGAAGCTGAACGCCCCCCAGCACCCTCCAGTAGACGTGG  1702
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Sbjct 1629  CGGGGAGCTGCATTCTCAGTATCACGGCTACTACGTGAAGCTGAACGCCCCCCAGCACCCTCCAGTAGACGTGG  1702

Query 1703  AGGACGGCGATGGATCCAGCCAGTCTTCCTCAGCACTGGTGCACAAGCCATCCGCTAACAAGTGGAGTCCCTCC  1776
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Sbjct 1703  AGGACGGCGATGGATCCAGCCAGTCTTCCTCAGCACTGGTGCACAAGCCATCCGCTAACAAGTGGAGTCCCTCC  1776

Query 1777  AAATCTGTGACAAAACCAGTTGCCAAAGAAAGCAAAGCTGAGCCAAAAGCTAAGAAGTCTGAACTTGCTATACC  1850
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Sbjct 1777  AAATCTGTGACAAAACCAGTTGCCAAAGAAAGCAAAGCTGAGCCAAAAGCTAAGAAGTCTGAACTTGCTATACC  1850

Query 1851  AAAGAATCCAGCAAGCAACGATTCATGCCCTGCTTTGGAAAAAGAAGCCAATTCAGGCCCTAATTCAATCATGA  1924
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Sbjct 1851  AAAGAATCCAGCAAGCAACGATTCATGCCCTGCTTTGGAAAAAGAAGCCAATTCAGGCCCTAATTCAATCATGA  1924

Query 1925  TTGTCCTTGTCATGCTGTTGAATATCGGGTTGGCCATTCTTTTTGTTCACTTTCTAACT  1983
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Sbjct 1925  TTGTCCTTGTCATGCTGTTGAATATCGGGTTGGCCATTCTTTTTGTTCACTTTCTAACT  1983