Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08649
- Subject:
- XM_011238396.2
- Aligned Length:
- 1991
- Identities:
- 1784
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGACGGGAGGAAGGTTCGACTTCGACGATGGCGGCACCTACTGCGGCGGCTGGGAGGAGGGCAAGGCGCACGG 74
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Sbjct 1 ATGACGGGCGGAAGGTTCGACTTCGACGATGGCGGCACCTACTGCGGCGGCTGGGAGGAGGGCAAGGCGCACGG 74
Query 75 GCATGGCATCTGCACGGGGCCCAAGGGCCAGGGCGAGTACTCGGGCTCCTGGTCGCACGGCTTCGAGGTGGTCG 148
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Sbjct 75 GCATGGCATCTGCACGGGGCCCAAGGGCCAGGGCGAGTACTCTGGCTCCTGGTCGCACGGCTTCGAGGTGGTTG 148
Query 149 GAGGCTACACCTGGCCCAGCGGCAACACCTACCAGGGCTACTGGGCGCAGGGCAAGCGGCACGGGCTGGGGGTG 222
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Sbjct 149 GAGTCTACACCTGGCCCAGCGGCAACACCTACCAGGGCTACTGGGCGCAGGGCAAGCGGCACGGGCTGGGGGTG 222
Query 223 GAGACGAAGGGCAAGTGGATGTACCGGGGGGAGTGGTCACATGGTTTCAAGGGGCGCTACGGGGTCCGGCAGAG 296
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Sbjct 223 GAGACGAAGGGCAAGTGGATGTACCGGGGGGAGTGGTCACATGGTTTCAAGGGGCGCTACGGGGTCCGGCAGAG 296
Query 297 CCTGTGCACCCCCGCTCGCTACGAGGGTACCTGGAGTAACGGGCTGCAAGACGGGTACGGCGTGGAGACCTACG 370
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Sbjct 297 CTTGTGCACCCCCGCCCGCTACGAGGGGACCTGGAGTAACGGGCTGCAGGACGGGTACGGCGTGGAGACCTACG 370
Query 371 GGGACGGAGGTACCTACCAGGGCCAGTGGGCCGGAGGCATGCGGCATGGCTACGGCGTGCGCCAGAGCGTGCCC 444
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Sbjct 371 GGGATGGAGGTACCTACCAGGGCCAGTGGGCTGGAGGCATGCGGCATGGCTACGGTGTCCGCCAGAGTGTGCCC 444
Query 445 TACGGCATGGCCACGGTGATCCGCTCACCGCTGCGTACCTCGCTGGCCTCGCTGCGCAGCGAGCAGAGCAATGG 518
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Sbjct 445 TATGGCATGGCCACAGTGATCCGTTCCCCGCTGCGCACTTCCCTGGCCTCGCTGCGCAGTGAGCAGAGCAACGG 518
Query 519 CAGCGTGCTCCACGACGCCGCAGCC---GCCGCCGACAGCCCGGCCGGCACCCGCGGCGGTTTCGTGCTCAACT 589
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Sbjct 519 CAGCGTGCTGCATGAAGCTGCAGCCGCAGCTGCAGACAGCCCGGCTGGAACAAGAGGTGGCTTCGTGCTCAACT 592
Query 590 TCCACGCAGACGCTGAGCTAGCGGGCAAGAAGAAGGGCGGCCTCTTCCGGAGGGGCTCCCTTCTTGGAAGCATG 663
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Sbjct 593 TCCATGCGGACACGGAACT---GGGCAAGAAGAAGGGCGGCCTCTTCCGTCGGGGTTCCCTTCTCGGCAGCATG 663
Query 664 AAACTTCGCAAGTCCGAATCCAAGTCTTCCATCTCGAGCAAGCGCAGCTCTGTCCGCAGCGACGCGGCCATGAG 737
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Sbjct 664 AAACTCCGCAAGTCCGAATCCAAGTCTTCCATCTCCAGCAAGCGCAGCTCGGTCCGCAGTGATGCAGCCATGAG 737
Query 738 CAGAATTAGTTCCAGCGATGCCAACTCCACGATCAGCTTTGGCGATGTAGATTGTGATTTTTGCCCGGTGGAAG 811
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Sbjct 738 CAGAATCAGTTCTAGCGATGCCAACTCCACCATCAGCTTTGGTGACGTCGACTGTGATTTTTGCCCCGTGGAAG 811
Query 812 ACCACGTGGACGCCACCACCACGGAAACCTACATGGGCGAGTGGAAGAACGACAAGCGCAACGGCTTCGGCGTT 885
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Sbjct 812 ATCACGTGGATGCCACTACCACGGAAACCTACATGGGCGAGTGGAAGAACGATAAGCGCAATGGCTTCGGCATC 885
Query 886 AGCGAGCGCTCCAATGGCATGAAGTATGAAGGGGAGTGGGCAAATAACAAGAGGCATGGATATGGCTGTACCGT 959
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Sbjct 886 AGCGAACGCTCCAATGGCATGAAGTACGAAGGCGAGTGGGCCAATAACAAGAGGCATGGGTACGGCTGCACTGT 959
Query 960 GTTTCCTGACGGCTCCAAAGAAGAGGGAAAATACAAAAATAATATTCTGGTCCGTGGGATAAGGAAGCAGCTTA 1033
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Sbjct 960 GTTTCCTGATGGCTCCAAAGAAGAGGGAAAATACAAAAATAATATCCTGGTCCGTGGGATAAGGAAGCAGCTTA 1033
Query 1034 TACCAATAAGACATACAAAAACTAGGGAGAAGGTGGACAGAGCAATTGAAGGCGCCCAAAGGGCAGCTGCCATG 1107
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Sbjct 1034 TACCAATAAGAAATACAAAAACTAGAGAGAAGGTGGATAGAGCAATTGAAGGTGCACAAAGGGCGGCAGCCATG 1107
Query 1108 GCCAGAACCAAAGTGGAAATAGCAAATTCAAGGACTGCACATGCCAGAGCGAAGGCCGATGCCGCCGACCAGGC 1181
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Sbjct 1108 GCCAGAACCAAAGTGGAAATAGCAAACTCAAGGACTGCACATGCCAGAGCAAAAGCTGATGCTGCCGACCAAGC 1181
Query 1182 CGCGCTGGCCGCTCGCCAGGAGTGCGACATCGCGAGAGCTGTGGCCAGGGAGCTGTCACCCGATTTCTACCAAC 1255
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Sbjct 1182 TGCACTGGCTGCTCGCCAGGAGTGCGACATAGCAAGAGCTGTGGCCAGAGAGCTGTCACCTGATTTCTACCAAC 1255
Query 1256 CAGGCCCTGATTACGTCAAACAGAGATTTCAGGAAGGTGTAGATGCTAAAGAAAATCCAGAAGAAAAGGTACCA 1329
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Sbjct 1256 CAGGCCCCGATTATATCAAACAAAGATGTCAGGAAGGGGGAGATATTAAAGAAAATCCAGAAGAAAAGGTCCTA 1329
Query 1330 GAAAAGCCACCTACACCAAAGGAGTCTCCTCATTTTTATCGCAAAGGCACGACACCCCCAAGATCTCCTGAGGC 1403
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Sbjct 1330 GAAAAGCCTCCGTCACCAAAGGAATCTCCTCATTTTTATCGCAAAGGCACCACACCCCCCAGGTCTCCTGAGTC 1403
Query 1404 AAGTCCCAAACACAGCCACTCTCC---TGCTTCCTCCCCAAAGCCCCTGAAGAAGCAAAACCCCAGCTCAGGGG 1474
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Sbjct 1404 AAGTCCCAAACAGAGCCACTCTCCCCAGCCTTCCTCCCCAGAGCCCTCAAAGAAACAAAACCCCAGCCCAGGGG 1477
Query 1475 CGAGACTCAACCAAGACAAAAGGAGTGTGGCTGATGAGCAGGTGACGGCCATTGTCAATAAGCCCTTGATGTCA 1548
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Sbjct 1478 CAAGACTCAGTCAAGATAAACAGAGCCTAGCTGAGGAACAAGTGACAGCCTTTGTCAATAAACCCTCTATGTCA 1551
Query 1549 AAGGCTCCCACGAAGGAGGCAGGAGCGGTTGTGCCCCAGTCCAAGTACTCTGGCCGCCACCACATCCCCAACCC 1622
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Sbjct 1552 AAGGCTCCCGCAAAAGAATTGGGAGCATCTGT------GTCCAAGTACTCTGGCCGCCACCATGTCCCCAACCC 1619
Query 1623 CAGTAACGGGGAGCTGCATTCTCAGTATCACGGCTACTACGTGAAGCTGAACGCCCCCCAGCACCCTCCAGTAG 1696
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Sbjct 1620 CAGCAACGGGGAGCTGCACTCTCAGTATCACGGCTACTATGTGAAACTGAACACACCCCAGCATCCTCCAGAAG 1693
Query 1697 ACGTGGAGGACGGC-GATGGATCCAGCCAGTCTTCCTCAGCACTGGTGCACAAG-CCATCCGCTAACAAGTGGA 1768
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Sbjct 1694 ACAGGGAGGATGACAGA-GGAGTCAGCCAGTCTTCCTCAGCATTGGTAC-CTAGACCATCACCTAACAAGTGGG 1765
Query 1769 GTCCCTCCAAATCTGTGACAAAACCAGTTGCCAAAGAAAGCAAAGCTGAGCCAAAAGCTAAGAAGTCTGAACTT 1842
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Sbjct 1766 GTCCCCCTAAATCTGTGACAAAACCAGTTGCCAAAGAAAGCAAAACTGAGCCAAAAGCAAAGAAGTCTGAACTT 1839
Query 1843 GCTATACCAAAGAATCCAGCAAGCAACGATTCATGCCCTGCTTTGGAAAAAGAAGCCAATTCAGGCCCTAATTC 1916
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Sbjct 1840 GCTATACCAAAGAATCCAGCAAGCAATGATACCTGCCCTTCCTTGGAAAAAGAAGCCAACTCTGGCCCTAATTC 1913
Query 1917 AATCATGATTGTCCTTGTCATGCTGTTGAATATCGGGTTGGCCATTCTTTTTGTTCACTTTCTAACT 1983
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Sbjct 1914 CATCATGATTGTCCTGGTCATGCTGTTGAATATTGGGTTGGCCATTCTTTTTGTTCACTTTCTGACT 1980