Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08649
• Subject: XM_011238397.2
• Aligned Length: 1991
• Identities: 1784
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGACGGGAGGAAGGTTCGACTTCGACGATGGCGGCACCTACTGCGGCGGCTGGGAGGAGGGCAAGGCGCACGG  74
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Sbjct    1  ATGACGGGCGGAAGGTTCGACTTCGACGATGGCGGCACCTACTGCGGCGGCTGGGAGGAGGGCAAGGCGCACGG  74

Query   75  GCATGGCATCTGCACGGGGCCCAAGGGCCAGGGCGAGTACTCGGGCTCCTGGTCGCACGGCTTCGAGGTGGTCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GCATGGCATCTGCACGGGGCCCAAGGGCCAGGGCGAGTACTCTGGCTCCTGGTCGCACGGCTTCGAGGTGGTTG  148

Query  149  GAGGCTACACCTGGCCCAGCGGCAACACCTACCAGGGCTACTGGGCGCAGGGCAAGCGGCACGGGCTGGGGGTG  222
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGTCTACACCTGGCCCAGCGGCAACACCTACCAGGGCTACTGGGCGCAGGGCAAGCGGCACGGGCTGGGGGTG  222

Query  223  GAGACGAAGGGCAAGTGGATGTACCGGGGGGAGTGGTCACATGGTTTCAAGGGGCGCTACGGGGTCCGGCAGAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGACGAAGGGCAAGTGGATGTACCGGGGGGAGTGGTCACATGGTTTCAAGGGGCGCTACGGGGTCCGGCAGAG  296

Query  297  CCTGTGCACCCCCGCTCGCTACGAGGGTACCTGGAGTAACGGGCTGCAAGACGGGTACGGCGTGGAGACCTACG  370
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Sbjct  297  CTTGTGCACCCCCGCCCGCTACGAGGGGACCTGGAGTAACGGGCTGCAGGACGGGTACGGCGTGGAGACCTACG  370

Query  371  GGGACGGAGGTACCTACCAGGGCCAGTGGGCCGGAGGCATGCGGCATGGCTACGGCGTGCGCCAGAGCGTGCCC  444
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Sbjct  371  GGGATGGAGGTACCTACCAGGGCCAGTGGGCTGGAGGCATGCGGCATGGCTACGGTGTCCGCCAGAGTGTGCCC  444

Query  445  TACGGCATGGCCACGGTGATCCGCTCACCGCTGCGTACCTCGCTGGCCTCGCTGCGCAGCGAGCAGAGCAATGG  518
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Sbjct  445  TATGGCATGGCCACAGTGATCCGTTCCCCGCTGCGCACTTCCCTGGCCTCGCTGCGCAGTGAGCAGAGCAACGG  518

Query  519  CAGCGTGCTCCACGACGCCGCAGCC---GCCGCCGACAGCCCGGCCGGCACCCGCGGCGGTTTCGTGCTCAACT  589
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Sbjct  519  CAGCGTGCTGCATGAAGCTGCAGCCGCAGCTGCAGACAGCCCGGCTGGAACAAGAGGTGGCTTCGTGCTCAACT  592

Query  590  TCCACGCAGACGCTGAGCTAGCGGGCAAGAAGAAGGGCGGCCTCTTCCGGAGGGGCTCCCTTCTTGGAAGCATG  663
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Sbjct  593  TCCATGCGGACACGGAACT---GGGCAAGAAGAAGGGCGGCCTCTTCCGTCGGGGTTCCCTTCTCGGCAGCATG  663

Query  664  AAACTTCGCAAGTCCGAATCCAAGTCTTCCATCTCGAGCAAGCGCAGCTCTGTCCGCAGCGACGCGGCCATGAG  737
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Sbjct  664  AAACTCCGCAAGTCCGAATCCAAGTCTTCCATCTCCAGCAAGCGCAGCTCGGTCCGCAGTGATGCAGCCATGAG  737

Query  738  CAGAATTAGTTCCAGCGATGCCAACTCCACGATCAGCTTTGGCGATGTAGATTGTGATTTTTGCCCGGTGGAAG  811
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  738  CAGAATCAGTTCTAGCGATGCCAACTCCACCATCAGCTTTGGTGACGTCGACTGTGATTTTTGCCCCGTGGAAG  811

Query  812  ACCACGTGGACGCCACCACCACGGAAACCTACATGGGCGAGTGGAAGAACGACAAGCGCAACGGCTTCGGCGTT  885
            |.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.
Sbjct  812  ATCACGTGGATGCCACTACCACGGAAACCTACATGGGCGAGTGGAAGAACGATAAGCGCAATGGCTTCGGCATC  885

Query  886  AGCGAGCGCTCCAATGGCATGAAGTATGAAGGGGAGTGGGCAAATAACAAGAGGCATGGATATGGCTGTACCGT  959
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Sbjct  886  AGCGAACGCTCCAATGGCATGAAGTACGAAGGCGAGTGGGCCAATAACAAGAGGCATGGGTACGGCTGCACTGT  959

Query  960  GTTTCCTGACGGCTCCAAAGAAGAGGGAAAATACAAAAATAATATTCTGGTCCGTGGGATAAGGAAGCAGCTTA  1033
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GTTTCCTGATGGCTCCAAAGAAGAGGGAAAATACAAAAATAATATCCTGGTCCGTGGGATAAGGAAGCAGCTTA  1033

Query 1034  TACCAATAAGACATACAAAAACTAGGGAGAAGGTGGACAGAGCAATTGAAGGCGCCCAAAGGGCAGCTGCCATG  1107
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Sbjct 1034  TACCAATAAGAAATACAAAAACTAGAGAGAAGGTGGATAGAGCAATTGAAGGTGCACAAAGGGCGGCAGCCATG  1107

Query 1108  GCCAGAACCAAAGTGGAAATAGCAAATTCAAGGACTGCACATGCCAGAGCGAAGGCCGATGCCGCCGACCAGGC  1181
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Sbjct 1108  GCCAGAACCAAAGTGGAAATAGCAAACTCAAGGACTGCACATGCCAGAGCAAAAGCTGATGCTGCCGACCAAGC  1181

Query 1182  CGCGCTGGCCGCTCGCCAGGAGTGCGACATCGCGAGAGCTGTGGCCAGGGAGCTGTCACCCGATTTCTACCAAC  1255
            .||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1182  TGCACTGGCTGCTCGCCAGGAGTGCGACATAGCAAGAGCTGTGGCCAGAGAGCTGTCACCTGATTTCTACCAAC  1255

Query 1256  CAGGCCCTGATTACGTCAAACAGAGATTTCAGGAAGGTGTAGATGCTAAAGAAAATCCAGAAGAAAAGGTACCA  1329
            |||||||.|||||..|||||||.||||.|||||||||.|.||||..||||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1256  CAGGCCCCGATTATATCAAACAAAGATGTCAGGAAGGGGGAGATATTAAAGAAAATCCAGAAGAAAAGGTCCTA  1329

Query 1330  GAAAAGCCACCTACACCAAAGGAGTCTCCTCATTTTTATCGCAAAGGCACGACACCCCCAAGATCTCCTGAGGC  1403
            ||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 1330  GAAAAGCCTCCGTCACCAAAGGAATCTCCTCATTTTTATCGCAAAGGCACCACACCCCCCAGGTCTCCTGAGTC  1403

Query 1404  AAGTCCCAAACACAGCCACTCTCC---TGCTTCCTCCCCAAAGCCCCTGAAGAAGCAAAACCCCAGCTCAGGGG  1474
            ||||||||||||.|||||||||||   ..|||||||||||.|||||...|||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 1404  AAGTCCCAAACAGAGCCACTCTCCCCAGCCTTCCTCCCCAGAGCCCTCAAAGAAACAAAACCCCAGCCCAGGGG  1477

Query 1475  CGAGACTCAACCAAGACAAAAGGAGTGTGGCTGATGAGCAGGTGACGGCCATTGTCAATAAGCCCTTGATGTCA  1548
            |.|||||||..|||||.|||..|||..|.|||||.||.||.|||||.|||.||||||||||.||||..||||||
Sbjct 1478  CAAGACTCAGTCAAGATAAACAGAGCCTAGCTGAGGAACAAGTGACAGCCTTTGTCAATAAACCCTCTATGTCA  1551

Query 1549  AAGGCTCCCACGAAGGAGGCAGGAGCGGTTGTGCCCCAGTCCAAGTACTCTGGCCGCCACCACATCCCCAACCC  1622
            |||||||||.|.||.||....|||||...|||      ||||||||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1552  AAGGCTCCCGCAAAAGAATTGGGAGCATCTGT------GTCCAAGTACTCTGGCCGCCACCATGTCCCCAACCC  1619

Query 1623  CAGTAACGGGGAGCTGCATTCTCAGTATCACGGCTACTACGTGAAGCTGAACGCCCCCCAGCACCCTCCAGTAG  1696
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Sbjct 1620  CAGCAACGGGGAGCTGCACTCTCAGTATCACGGCTACTATGTGAAACTGAACACACCCCAGCATCCTCCAGAAG  1693

Query 1697  ACGTGGAGGACGGC-GATGGATCCAGCCAGTCTTCCTCAGCACTGGTGCACAAG-CCATCCGCTAACAAGTGGA  1768
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Sbjct 1694  ACAGGGAGGATGACAGA-GGAGTCAGCCAGTCTTCCTCAGCATTGGTAC-CTAGACCATCACCTAACAAGTGGG  1765

Query 1769  GTCCCTCCAAATCTGTGACAAAACCAGTTGCCAAAGAAAGCAAAGCTGAGCCAAAAGCTAAGAAGTCTGAACTT  1842
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Sbjct 1766  GTCCCCCTAAATCTGTGACAAAACCAGTTGCCAAAGAAAGCAAAACTGAGCCAAAAGCAAAGAAGTCTGAACTT  1839

Query 1843  GCTATACCAAAGAATCCAGCAAGCAACGATTCATGCCCTGCTTTGGAAAAAGAAGCCAATTCAGGCCCTAATTC  1916
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Sbjct 1840  GCTATACCAAAGAATCCAGCAAGCAATGATACCTGCCCTTCCTTGGAAAAAGAAGCCAACTCTGGCCCTAATTC  1913

Query 1917  AATCATGATTGTCCTTGTCATGCTGTTGAATATCGGGTTGGCCATTCTTTTTGTTCACTTTCTAACT  1983
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Sbjct 1914  CATCATGATTGTCCTGGTCATGCTGTTGAATATTGGGTTGGCCATTCTTTTTGTTCACTTTCTGACT  1980