Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08657
Subject:
NM_001363666.2
Aligned Length:
700
Identities:
535
Gaps:
65

Alignment

Query   1  MMPFPVTTQGPPQPAPPPNRYGVSSPISLAVPKETDCLLTQRLIETLRPFGVFEEEEELQRRILVLDKLNNLVK  74
            |||||||||..|..||...||..||||||.||||||.|||.|||||.||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct   1  -MPFPVTTQGSQQTQPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQKLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVK  73

Query  75  EWIREISESKSLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPSHVDRSDFFTSFYAKLKLQEEVKDLR  148
           ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  74  EWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLR  147

Query 149  AVQEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRILNGCRVTDEILHLVPNIDNFR  222
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 148  AVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFR  221

Query 223  LTLRAIKLWAKCHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAVASTLVRKFFLVFSEWEWPNPVLLKEPEERNL  296
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.|||.||
Sbjct 222  LTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNL  295

Query 297  NLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSISTRMVMIEEFKQGLAITHEILLSKAEWSKLFEAPSFFQ  370
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 296  NLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQ  369

Query 371  KYKHYIVLLASASTEKQHLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDMEEFRTMWVIGLGL  444
           ||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..
Sbjct 370  KYKHYIVLLASAPTEKQRLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDKEEFRTMWVIGLVF  443

Query 445  KKPDNSEILSIDLTYDIQSFTDTVYRQAVNSKMFEMGMKITAVHLRRKELHQLLPHHVLQDKKAHSTEGRRLTD  518
           ||..|||.||.|||||||||||||||||.||||||..|||.|.|..||.||||||.||||.||.|||||..||.
Sbjct 444  KKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRKQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVKLTA  517

Query 519  LNDSSFDLSAGCENSMSVPSSTSTMKTGPLIS--SSQGRNSPALAVMTASVANIQATEFSLQQVNTNESSGVAL  590
           |||||.|||....|||||||.||..||.||.|  |||| ||||.||..|||.||||||.|..|||..||||...
Sbjct 518  LNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSATKTSPLNSSGSSQG-NSPAPAVTAASVTNIQATEVSVPQVNSSESSGGTS  590

Query 591  NESIPHAVSQPAISPSPKAMVARVVSSTCLISHPDLQETQQQTYLIL---------------------------  637
           .||||....||||||.||..|.||||||.|...|........|....                           
Sbjct 591  SESIPQTATQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNPPPRSSGNAATSGNAATKIPTPIVGVKRTSSPHKEESPKKTK  664

Query 638  ----------------------------------  637
                                             
Sbjct 665  TEEKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR  698