Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08657
Subject:
NM_019943.2
Aligned Length:
642
Identities:
543
Gaps:
5

Alignment

Query   1  MMPFPVTTQGPPQPAPPPNRYGVSSPISLAVPKETDCLLTQRLIETLRPFGVFEEEEELQRRILVLDKLNNLVK  74
           ||||.|||||..||||.|...|.|||||||.||.||..|||.|||||.||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct   1  MMPFAVTTQGAQQPAPAPKQFGISSPISLAAPKDTDRELTQKLIETLQPFGVFEEEEELQRRILILQKLNNLVK  74

Query  75  EWIREISESKSLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPSHVDRSDFFTSFYAKLKLQEEVKDLR  148
           |||||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  75  EWIREISESRNLPQAVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRNDFFTSFYDKLKLQEEVKDLR  148

Query 149  AVQEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRILNGCRVTDEILHLVPNIDNFR  222
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 149  AVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDSFR  222

Query 223  LTLRAIKLWAKCHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAVASTLVRKFFLVFSEWEWPNPVLLKEPEERNL  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  LTLRAIKLWAKCHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVRKFFLVFSEWEWPNPVLLKEPEERNL  296

Query 297  NLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSISTRMVMIEEFKQGLAITHEILLSKAEWSKLFEAPSFFQ  370
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 297  NLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMIEEFKQGLAITHEILLNKAEWSKLFEAPSFFQ  370

Query 371  KYKHYIVLLASASTEKQHLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDMEEFRTMWVIGLGL  444
           ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 371  KYKHYIVLLASAPTEKQHLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKETADKEEFRTMWVIGLVL  444

Query 445  KKPDNSEILSIDLTYDIQSFTDTVYRQAVNSKMFEMGMKITAVHLRRKELHQLLPHHVLQDKKAHSTEGRRLTD  518
           |||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|.||||||||||||.||||.|..|.||..|||.
Sbjct 445  KKPENSEILSIDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEMDMKIAAMHLRRKELHQLLPNHVLQKKETHLTESVRLTA  518

Query 519  LNDSSFDLSAGCENSMSVPSSTSTMKTGPLISSSQGRNSPALAVMTASVANIQATEFSLQQVNTNESSGVALNE  592
           ..|||..||...||||..||.|.|||||||....|||||||||||.|||.|||....|||.||..||||.||.|
Sbjct 519  VTDSSLLLSIDSENSMTAPSPTGTMKTGPLTGNPQGRNSPALAVMAASVTNIQFPDVSLQHVNPIESSGIALSE  592

Query 593  SIPHAVSQPAISPSPKAMVARVVSSTCLISHPDLQETQQQTYL---IL--  637
           |||...|||.|||.||....||||||.|..||........|..   ||  
Sbjct 593  SIPQIPSQPTISPPPKPTMTRVVSSTHLVNHPSRPSGNTATNIPNPILGV  642