Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08703
• Subject: XM_006497469.3
• Aligned Length: 1160
• Identities: 960
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAAGAGACCCTCGGAACC-----GGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCT  143
                           |..|     |||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct    1  ---------------ATGCAGCGTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACTGGGAAGCT  59

Query  144  CTTTGCTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCC  217
            |||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct   60  CTTCGCAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGATTGCCGTGC  133

Query  218  TGAGAAAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTC  291
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  134  TTAGAAAGATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCTACCTGGTC  207

Query  292  ATGCAGCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAG  365
            |||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  208  ATGCAACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAG  281

Query  366  CACTCTGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGC  439
            ||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  282  CACTCTCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGC  355

Query  440  CCGAAAATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATG  513
            |.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  356  CGGAGAATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATG  429

Query  514  GAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAA  587
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  430  GAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAA  503

Query  588  ACCTTACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTT  661
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  504  ACCGTACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTT  577

Query  662  TTTATGATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGG  735
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  578  TTTATGATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGG  651

Query  736  GATGACATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTG  809
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  652  GATGACATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTG  725

Query  810  TGAGCAGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCG  883
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  726  TGAGCAGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTG  799

Query  884  CCCAGATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATG  957
            |||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  800  CCCAGATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATG  873

Query  958  AGAAAACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCA  1031
            .|.|..||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct  874  CGGAGGCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTGGCCAGCCA  947

Query 1032  AAAAGACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCG  1105
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct  948  AAAAGATTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGTCGGAGCTG  1021

Query 1106  AGCGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG  1155
            ||.|||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||||||||||
Sbjct 1022  AGAGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG  1071