Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08719
• Subject: NM_001350538.1
• Aligned Length: 946
• Identities: 844
• Gaps: 101

Alignment

Query   1  MVPWVRTMGQKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYIHILMIFWSFVAGVVTFYCSLGPDSL  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MVPWVRTMGQKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYIHILMIFWSFVAGVVTFYCSLGPDSL  74

Query  75  LPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPSLLLENYQPWLDLKISSKVDASLSE---------  139
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  75  LPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPSLLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVLELVLENF  148

Query 140  -----------------------------------VDIPSIITKKLLKAAMKHIEVIVKARQKVKNTEFLQQAA  178
                                              |||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 149  VYPWYRDVTDDESFVDELRITLRFFASVLIRRIHKVDIPSIITKKLLKAAMKHIEVIVKARQ------------  210

Query 179  LEEYGPELHVALRSRRDELHYLRKLTELLFPYILPPKATDCRSLTLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLL  252
                                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211  ------------------------------------KATDCRSLTLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLL  248

Query 253  IIFIDDSPPEKATEPASPLVPFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKQIREQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTVE  326
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249  IIFIDDSPPEKATEPASPLVPFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKQIREQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTVE  322

Query 327  EFNDRILRPELSNDEMLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYE  400
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323  EFNDRILRPELSNDEMLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYE  396

Query 401  HVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLN---------RNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTT  465
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397  HVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLNRGSLSLDDFRNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTT  470

Query 466  MEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVF  539
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471  MEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVF  544

Query 540  CIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQK  613
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545  CIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQK  618

Query 614  LLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPS  687
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619  LLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPS  692

Query 688  RPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEVMTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMG  761
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693  RPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEVMTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMG  766

Query 762  TRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCENTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLV  835
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767  TRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCENTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLV  840

Query 836  KCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTFWM  893
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 841  KCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM  898