Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08719
Subject:
NM_001350550.1
Aligned Length:
902
Identities:
551
Gaps:
350

Alignment

Query   1  MVPWVRTMGQKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYIHILMIFWSFVAGVVTFYCSLGPDSL  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  LPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPSLLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVDIPSIITK  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  KLLKAAMKHIEVIVKARQKVKNTEFLQQAALEEYGPELHVALRSRRDELHYLRKLTELLFPYILPPKATDCRSL  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  TLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLLIIFIDDSPPEKATEPASPLVPFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKQI  296
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 297  REQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTVEEFNDRILRPELSNDEMLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPF  370
                                                        |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------MLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPF  29

Query 371  IVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLN------  438
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  30  IVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLNRGSLSL  103

Query 439  ---RNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNL  509
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104  DDFRNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNL  177

Query 510  AAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPD  583
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178  AAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPD  251

Query 584  AQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVP  657
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252  AQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVP  325

Query 658  GKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEV  731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326  GKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEV  399

Query 732  MTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCE  805
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400  MTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCE  473

Query 806  NTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLVKCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPEL  879
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474  NTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLVKCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPEL  547

Query 880  NKVQKEVTSVTFWM  893
           |||||||||||.||
Sbjct 548  NKVQKEVTSVTSWM  561