Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08720
• Subject: NM_001350538.1
• Aligned Length: 946
• Identities: 896
• Gaps: 48

Alignment

Query   1  MVPWVRTMGQKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYIHILMIFWSFVVGVVTFYCSLGPDSL  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   1  MVPWVRTMGQKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYIHILMIFWSFVAGVVTFYCSLGPDSL  74

Query  75  LPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPSLLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVLELVLENF  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  LPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPSLLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVLELVLENF  148

Query 149  VYPWYRDVTDDESFVDELRITLRFFASVLIRRIHKVDIPSIITKKLLKAAMKHIEVIVKARQKVKNTEFLQQAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 149  VYPWYRDVTDDESFVDELRITLRFFASVLIRRIHKVDIPSIITKKLLKAAMKHIEVIVKARQ------------  210

Query 223  LEEYGPELHVALRSRRDELHYLRKLTELLFPYILPPKATDCRSLTLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLL  296
                                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211  ------------------------------------KATDCRSLTLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLL  248

Query 297  IIFIDDSPPEKATEPASPLVRFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKQIREQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTVE  370
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249  IIFIDDSPPEKATEPASPLVPFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKQIREQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTVE  322

Query 371  EFNDRILRPELSNDEMLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYE  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323  EFNDRILRPELSNDEMLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYE  396

Query 445  HVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLNRGSLSLDDFRNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397  HVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLNRGSLSLDDFRNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTT  470

Query 519  MEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVF  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471  MEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVF  544

Query 593  CIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQK  666
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Sbjct 545  CIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQK  618

Query 667  LLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPS  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619  LLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPS  692

Query 741  RPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEVMTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMG  814
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Sbjct 693  RPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEVMTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMG  766

Query 815  TRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCENTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLV  888
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Sbjct 767  TRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCENTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLV  840

Query 889  KCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM  946
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841  KCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM  898