Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08746
• Subject: NM_001331003.2
• Aligned Length: 1345
• Identities: 1318
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  74
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Sbjct    1  MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  74

Query   75  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  148

Query  149  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  222

Query  223  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLE-----------------------  273
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  223  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELAKANMQLLYERLLRRKQLRTQK  296

Query  274  ---LEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRV  344
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  DNHLEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRV  370

Query  345  RRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVT  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVT  444

Query  419  EGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEIL  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEIL  518

Query  493  VDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATY  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  VDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATY  592

Query  567  ASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSS  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSS  666

Query  641  LTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAI  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAI  740

Query  715  HSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSI  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  HSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSI  814

Query  789  SSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVS  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  SSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVS  888

Query  863  YSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEK  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  YSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEK  962

Query  937  INSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAF  1010
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Sbjct  963  INSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAF  1036

Query 1011  LQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEGGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRI  1084
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  LQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRI  1110

Query 1085  DFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLS  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  DFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLS  1184

Query 1159  LSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYV  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  LSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYV  1258

Query 1233  PYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFL  1306
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Sbjct 1259  PYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFL  1332

Query 1307  EKFFLVAALKYFQ  1319
            |||||||||||||
Sbjct 1333  EKFFLVAALKYFQ  1345