Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08746
• Subject: NM_001331005.2
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1285
• Gaps: 229

Alignment

Query    1  MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  74
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------MKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  41

Query   75  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  115

Query  149  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  189

Query  223  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENP  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENP  263

Query  297  DELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQ  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  DELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQ  337

Query  371  SHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTE-------------------------  419
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  338  SHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTEDLDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYET  411

Query  420  --------------------------------------------------------------------------  419
                                                                                      
Sbjct  412  EESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSLKGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSV  485

Query  420  --------------------------------------------------------------------------  419
                                                                                      
Sbjct  486  VLVGYKCLKSTASNDLIKCFEGNPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIEN  559

Query  420  -----------------------GKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDP  470
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  VQPDQFDPLNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDP  633

Query  471  FSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPS  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  FSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPS  707

Query  545  TKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  TKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN  781

Query  619  VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKS  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKS  855

Query  693  SITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTG  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  SITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTG  929

Query  767  TAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQ  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  TAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQ  1003

Query  841  GLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  GLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDG  1077

Query  915  TINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSST  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  TINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSST  1151

Query  989  SYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEGGSEDGVHLIVCVHGLD  1062
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1152  SYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLD  1225

Query 1063  GNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLI  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  GNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLI  1299

Query 1137  IRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLS  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  IRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLS  1373

Query 1211  NKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALP  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  NKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALP  1447

Query 1285  NTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ  1319
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448  NTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ  1482