Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08746
- Subject:
- NM_001351599.1
- Aligned Length:
- 1541
- Identities:
- 1318
- Gaps:
- 222
Alignment
Query 1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI 74
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Sbjct 1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI 74
Query 75 LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL 148
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Sbjct 75 LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL 148
Query 149 HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP 222
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Sbjct 149 HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP 222
Query 223 DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLE----------------------- 273
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Sbjct 223 DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELAKANMQLLYERLLRRKQLRTQK 296
Query 274 ---LEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRV 344
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Sbjct 297 DNHLEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRV 370
Query 345 RRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVT 418
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Sbjct 371 RRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVT 444
Query 419 E------------------------------------------------------------------------- 419
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Sbjct 445 EDLDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYETEESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSLKGKNEESNKSKV 518
Query 420 -------------------------------------------------------------------------- 419
Sbjct 519 KVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSVVLVGYKCLKSTASNDLIKCFEGNPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMR 592
Query 420 -------------------------------------------------GKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSS 444
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Sbjct 593 QTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIENVQPDQFDPLNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSS 666
Query 445 DDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEK 518
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Sbjct 667 DDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEK 740
Query 519 EALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLV 592
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Sbjct 741 EALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLV 814
Query 593 FETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPE 666
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Sbjct 815 FETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPE 888
Query 667 CHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKS 740
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Sbjct 889 CHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKS 962
Query 741 SCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYS 814
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Sbjct 963 SCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYS 1036
Query 815 EIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKE 888
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Sbjct 1037 EIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKE 1110
Query 889 DEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSA 962
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Sbjct 1111 DEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSA 1184
Query 963 PRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASS 1036
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Sbjct 1185 PRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASS 1258
Query 1037 VPYFSVEEEGGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDE 1110
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Sbjct 1259 VPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDE 1332
Query 1111 IIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW 1184
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Sbjct 1333 IIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKW 1406
Query 1185 KKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEM 1258
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Sbjct 1407 KKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEM 1480
Query 1259 IHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ 1319
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Sbjct 1481 IHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ 1541