Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08746
- Subject:
- NM_001351602.1
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1318
- Gaps:
- 196
Alignment
Query 1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI 74
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Sbjct 1 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI 74
Query 75 LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL 148
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Sbjct 75 LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL 148
Query 149 HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP 222
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Sbjct 149 HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP 222
Query 223 DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENP 296
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Sbjct 223 DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENP 296
Query 297 DELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQ 370
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Sbjct 297 DELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQ 370
Query 371 SHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTE------------------------- 419
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Sbjct 371 SHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTEDLDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYET 444
Query 420 -------------------------------------------------------------------------- 419
Sbjct 445 EESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSLKGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSV 518
Query 420 -------------------------------------------------------------------------- 419
Sbjct 519 VLVGYKCLKSTASNDLIKCFEGNPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIEN 592
Query 420 -----------------------GKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDP 470
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Sbjct 593 VQPDQFDPLNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDP 666
Query 471 FSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPS 544
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Sbjct 667 FSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPS 740
Query 545 TKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN 618
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Sbjct 741 TKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN 814
Query 619 VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKS 692
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Sbjct 815 VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKS 888
Query 693 SITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTG 766
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Sbjct 889 SITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTG 962
Query 767 TAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQ 840
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Sbjct 963 TAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQ 1036
Query 841 GLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDG 914
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Sbjct 1037 GLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDG 1110
Query 915 TINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSST 988
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Sbjct 1111 TINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSST 1184
Query 989 SYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEGGSEDGVHLIVCVHGLD 1062
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Sbjct 1185 SYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLD 1258
Query 1063 GNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLI 1136
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Sbjct 1259 GNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLI 1332
Query 1137 IRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLS 1210
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Sbjct 1333 IRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLS 1406
Query 1211 NKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALP 1284
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Sbjct 1407 NKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALP 1480
Query 1285 NTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ 1319
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Sbjct 1481 NTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ 1515