Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08746
• Subject: NM_001351609.1
• Aligned Length: 1345
• Identities: 1008
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------MIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  62

Query  149  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  136

Query  223  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLE-----------------------  273
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  137  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELAKANMQLLYERLLRRKQLRTQK  210

Query  274  ---LEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRV  344
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  DNHLEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRV  284

Query  345  RRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVT  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  RRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQSHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVT  358

Query  419  EGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEIL  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  EGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDPFSGENITVKLGPWTELRQEEIL  432

Query  493  VDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPSTKEYHVVVSGDTIKLPDISATY  566
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  433  VDNLLPNFESLESN------------------------------------------------------------  446

Query  567  ASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYNVKFSLGNHCTESTSAISEIQSS  640
                                                                                      
Sbjct  447  --------------------------------------------------------------------------  446

Query  641  LTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKSSITLQQQSVVFSGNLDNETVAI  714
                                                                                      
Sbjct  447  --------------------------------------------------------------------------  446

Query  715  HSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSI  788
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  ----------------DEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTGTAITLNSKLICLGTPCVISGSI  504

Query  789  SSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVS  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  SSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQGLVENYFGSQSSTDISDTCAVS  578

Query  863  YSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEK  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  YSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDGTINAHYTSRDELMEERLTKSEK  652

Query  937  INSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAF  1010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  INSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSSTSYNFTSSISWYESSPKPQIQAF  726

Query 1011  LQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEGGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRI  1084
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  LQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRI  800

Query 1085  DFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLS  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  DFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLS  874

Query 1159  LSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYV  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  LSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYV  948

Query 1233  PYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFL  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  PYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFL  1022

Query 1307  EKFFLVAALKYFQ  1319
            |||||||||||||
Sbjct 1023  EKFFLVAALKYFQ  1035