Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08862
• Subject: NM_027188.3
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1122
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAACAGGGGAAACGGGCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCG  74
            ||||||.|.||||||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||.|.||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGGCACTGAAGGTGGAAAAGTTCACGACTGCCAACCGGGGAAACGGGCTGCGTGCTGTGGCTCCACTGCG  74

Query   75  CCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGGATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCG  148
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  CCCCGGGGAGCTGCTCTTCCGCTCCGACCCCTTGGCTTACACTGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTAGTCTGTG  148

Query  149  ACCGCTGCCTTCTCGGGAAGGAAAAGCTGATGCGATGCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAG  222
            |.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  ATCGCTGCCTACTGGGGAAGGAGAAGCTGATGCGTTGTTCTCAATGCCGAATTGCCAAATACTGCAGTGCCAAG  222

Query  223  TGTCAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAGCTGCAAACCCAGATATCCTCC  296
            ||||||||||||||.|||||.|||||||..||||||||||..||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  TGTCAGAAAAAAGCCTGGCCGGACCACAGACGGGAATGCAGTTGTCTTAAAAGCTGCAAGCCCAGATATCCGCC  296

Query  297  AGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTGTCTTCAAACTTATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAGCTTT  370
            .||||||||..|||||||.|||||.|||.||.||||.||.|||||||.|...||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  297  CGACTCCGTGAGACTTCTGGGCAGGGTTATCGTCAAGCTGATGGATGAAAAGCCCTCAGAGTCAGAGAAACTTT  370

Query  371  ACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAATATTAACAAACTGACTGAAGATAGGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTA  444
            |.||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||.|.|
Sbjct  371  ATTCATTTTATGATCTGGAGTCCAATATTAGCAAACTCACTGAAGATAAGAAAGAGGGCCTGAGGCAACTTGCA  444

Query  445  ATGACATTTCAACATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTTGACCTTTTTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||
Sbjct  445  ATGACTTTTCAACATTTCATGAGAGAGGAGATCCAGGATGCGTCTCAGCTGCCGCCTTCTTTTGACCTTTTTGA  518

Query  519  AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAACTCTTTCACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct  519  AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAATTCGTTCACTATCTGCAACGCGGAGATGCAGGAGGTCGGCGTTGGCCTGT  592

Query  593  ATCCCAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCGATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTA  666
            |.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCCAGTATGTCTTTGCTGAATCACAGCTGTGACCCCAACTGCTCCATCGTATTCAACGGGCCCCACCTCTTA  666

Query  667  CTGCGAGCAGTCCGAGACATCGAGGTGGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGATGACCAGTGA  740
            |||||.|||||.||.||.||.||.|..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  CTGCGTGCAGTGCGGGAAATTGAAGCAGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGACATGCTGATGACCAGCGA  740

Query  741  GGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAATGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAGG  814
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAACGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAGTGTGACTGCATCCGATGCCAAACCCAGGACAAGG  814

Query  815  ATGCTGATATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGAAAAAAATTGAAGAACTG  888
            |||||||.||||||||.|||||.||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  815  ATGCTGACATGCTAACGGGTGACGAGCAAATATGGAAGGAGGTTCAAGAGTCGCTGAAGAAAATCGAAGAGCTG  888

Query  889  AAGGCACACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCCATGTGCCAGGCGATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||..|.||||||||
Sbjct  889  AAGGCGCACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCGCTGTGCCAGGCGATCATAAACAGCAATTCCAACCGGCTTCC  962

Query  963  CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCTGCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGG  1036
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..||.||||||
Sbjct  963  CGACATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGTGCCATGGATGCCTGCATCAACCTGGGGATGCTGGAGG  1036

Query 1037  AAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACCATGGAGCCATACAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGTCAGAGGG  1110
            |.||.||||||||.|..|..||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  AGGCGTTGTTCTACGCCATGCGCACCATGGAGCCGTACCGGATTTTTTTCCCTGGAAGCCATCCCGTCAGAGGT  1110

Query 1111  GTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCATGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACT  1184
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  GTGCAAGTGATGAAAGTTGGCAAGCTGCAGCTCCATCAAGGCATGTTTCCTCAAGCCATGAAGAACCTGAGGCT  1184

Query 1185  GGCTTTTGATATTATGAGAGTGACACATGGCAGAGAACACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTACTTTTAGAAG  1258
            |||.|||||.|||||||.||||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||
Sbjct 1185  GGCCTTTGACATTATGAAAGTGACCCACGGCCGAGAGCACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTTCTCCTGGAAG  1258

Query 1259  AATGCGACGCCAACATCAGAGCATCC  1284
            ||||.||.||||||||..||||.|||
Sbjct 1259  AATGTGATGCCAACATACGAGCCTCC  1284