Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08879
- Subject:
- NM_001363426.1
- Aligned Length:
- 2391
- Identities:
- 1959
- Gaps:
- 429
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTCTGGCCTACAACCTGGGCAAGCGGGAGATCAACCACTACTTCAGCGTGAGGAGCGCCAAGGTGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGCGCTGGTGGCCGTGCTGCTGCTCGCAGCGTGCCACCTCGCCTCCCGCCGCTACCGAGGCAATGATTCGTGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AATACCTTCTCTCAAGTGGCAGATTTCTTGGAGAGAAAGTTTGGCAACCTCACAGTTGTATGATGCATAAATAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAATCAGTGAAGCAAAGAACTGCCTTGTAGATAAACATATTGCATTTATTGGAGATTCCAGAATTCGTCAATT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTTTTATTCTTTTGTAAAAATAATTAATCCCCAATTCAAAGAAGAAGGAAATAAGCATGAAAACATTCCTTTTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AAGACAAGACTGCATCAGTTAAAGTGGATTTTCTGTGGCATCCTGAAGTTAATGGTTCTATGAAACAGTGTATC 444
|||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------ATGAAACAGTGTATC 15
Query 445 AAAGTGTGGACTGAGGATTCCATTGCAAAGCCACATGTGATTGTAGCAGGAGCTGCCACATGGTCCATCAAGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 AAAGTGTGGACTGAGGATTCCATTGCAAAGCCACATGTGATTGTAGCAGGAGCTGCCACATGGTCCATCAAGAT 89
Query 519 TCACAATGGTAGCAGTGAAGCGCTTTCTCAATATAAAATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 TCACAATGGTAGCAGTGAAGCGCTTTCTCAATATAAAATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAAT 163
Query 593 TGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 TGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAAG 237
Query 667 ATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 ATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATTC 311
Query 741 TAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 TAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGCT 385
Query 815 TACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 TACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAAG 459
Query 889 CCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCAC 533
Query 963 TTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 TTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACTG 607
Query 1037 ATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 ATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATCT 681
Query 1111 TTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACAGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACAA 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 TTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACCGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACAA 755
Query 1185 ATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 ATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAATA 829
Query 1259 CTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 CTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGATT 903
Query 1333 TATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTATT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 TATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTATT 977
Query 1407 TCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTACAGAGTATGTCAGGTTT 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 978 TCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTATAGAGTATGTCAGGTTT 1051
Query 1481 TATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 TATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGTC 1125
Query 1555 CCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAGC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 CCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAGC 1199
Query 1629 AAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTGG 1273
Query 1703 CATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 CATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAAT 1347
Query 1777 GTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348 GTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTTA 1421
Query 1851 TCTGGCCTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAATT 1924
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 TCTGGCTTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAATT 1495
Query 1925 TTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 TTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGAG 1569
Query 1999 TGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGATA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 TGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGATA 1643
Query 2073 TGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAGCTATTTATTTGCCAGTATC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1644 TGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAGCTATTTATTTGCCAGTATC 1717
Query 2147 ACATATGGCTGGCAGCGGACACAAGGGGTATCTTGGTACTGATACCTGGAAACCCTATGCTCAACATCATTGTC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718 ACATATGGCTGGCAGCGGACACAAGGGGTATCTTGGTACTGATACCTGGAAACCCTATGCTCAACATCATTGTC 1791
Query 2221 AGCACTTTCATATTTGTTTGTGTGGCACATGAAATTTCTCAGATCACTAATGATCTTGCACAGATTATTATTCC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 AGCACTTTCATATTTGTTTGTGTGGCACATGAAATTTCTCAGATCACTAATGATCTTGCACAGATTATTATTCC 1865
Query 2295 TAAAGATAACTCATCTCTCTTGAAAAGGTTGGCATGTATAGCTGCATTTTTTTGTGGACTCCTCATCTTATCAT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866 TAAAGATAACTCATCTCTCTTGAAAAGGTTGGCATGTATAGCTGCATTTTTTTGTGGACTCCTCATCTTATCAT 1939
Query 2369 CCATTCAAGATAAATCAAAACAT 2391
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 CCATTCAAGATAAATCAAAACAT 1962
