Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08879
- Subject:
- NM_001363428.1
- Aligned Length:
- 2391
- Identities:
- 1833
- Gaps:
- 555
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTCTGGCCTACAACCTGGGCAAGCGGGAGATCAACCACTACTTCAGCGTGAGGAGCGCCAAGGTGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGCGCTGGTGGCCGTGCTGCTGCTCGCAGCGTGCCACCTCGCCTCCCGCCGCTACCGAGGCAATGATTCGTGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AATACCTTCTCTCAAGTGGCAGATTTCTTGGAGAGAAAGTTTGGCAACCTCACAGTTGTATGATGCATAAATAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAATCAGTGAAGCAAAGAACTGCCTTGTAGATAAACATATTGCATTTATTGGAGATTCCAGAATTCGTCAATT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTTTTATTCTTTTGTAAAAATAATTAATCCCCAATTCAAAGAAGAAGGAAATAAGCATGAAAACATTCCTTTTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AAGACAAGACTGCATCAGTTAAAGTGGATTTTCTGTGGCATCCTGAAGTTAATGGTTCTATGAAACAGTGTATC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AAAGTGTGGACTGAGGATTCCATTGCAAAGCCACATGTGATTGTAGCAGGAGCTGCCACATGGTCCATCAAGAT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TCACAATGGTAGCAGTGAAGCGCTTTCTCAATATAAAATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAAT 592
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Sbjct 1 -------------------------------------ATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAAT 37
Query 593 TGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAAG 666
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Sbjct 38 TGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAAG 111
Query 667 ATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATTC 740
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Sbjct 112 ATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATTC 185
Query 741 TAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGCT 814
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Sbjct 186 TAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGCT 259
Query 815 TACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAAG 888
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Sbjct 260 TACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAAG 333
Query 889 CCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCAC 962
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Sbjct 334 CCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCAC 407
Query 963 TTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACTG 1036
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Sbjct 408 TTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACTG 481
Query 1037 ATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATCT 1110
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Sbjct 482 ATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATCT 555
Query 1111 TTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACAGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACAA 1184
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Sbjct 556 TTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACCGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACAA 629
Query 1185 ATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAATA 1258
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Sbjct 630 ATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAATA 703
Query 1259 CTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGATT 1332
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Sbjct 704 CTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGATT 777
Query 1333 TATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTATT 1406
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Sbjct 778 TATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTATT 851
Query 1407 TCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTACAGAGTATGTCAGGTTT 1480
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Sbjct 852 TCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTATAGAGTATGTCAGGTTT 925
Query 1481 TATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGTC 1554
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Sbjct 926 TATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGTC 999
Query 1555 CCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAGC 1628
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Sbjct 1000 CCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAGC 1073
Query 1629 AAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTGG 1702
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Sbjct 1074 AAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTGG 1147
Query 1703 CATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAAT 1776
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Sbjct 1148 CATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAAT 1221
Query 1777 GTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTTA 1850
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Sbjct 1222 GTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTTA 1295
Query 1851 TCTGGCCTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAATT 1924
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Sbjct 1296 TCTGGCTTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAATT 1369
Query 1925 TTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGAG 1998
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Sbjct 1370 TTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGAG 1443
Query 1999 TGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGATA 2072
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Sbjct 1444 TGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGATA 1517
Query 2073 TGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAGCTATTTATTTGCCAGTATC 2146
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Sbjct 1518 TGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAGCTATTTATTTGCCAGTATC 1591
Query 2147 ACATATGGCTGGCAGCGGACACAAGGGGTATCTTGGTACTGATACCTGGAAACCCTATGCTCAACATCATTGTC 2220
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Sbjct 1592 ACATATGGCTGGCAGCGGACACAAGGGGTATCTTGGTACTGATACCTGGAAACCCTATGCTCAACATCATTGTC 1665
Query 2221 AGCACTTTCATATTTGTTTGTGTGGCACATGAAATTTCTCAGATCACTAATGATCTTGCACAGATTATTATTCC 2294
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Sbjct 1666 AGCACTTTCATATTTGTTTGTGTGGCACATGAAATTTCTCAGATCACTAATGATCTTGCACAGATTATTATTCC 1739
Query 2295 TAAAGATAACTCATCTCTCTTGAAAAGGTTGGCATGTATAGCTGCATTTTTTTGTGGACTCCTCATCTTATCAT 2368
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Sbjct 1740 TAAAGATAACTCATCTCTCTTGAAAAGGTTGGCATGTATAGCTGCATTTTTTTGTGGACTCCTCATCTTATCAT 1813
Query 2369 CCATTCAAGATAAATCAAAACAT 2391
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Sbjct 1814 CCATTCAAGATAAATCAAAACAT 1836
