Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08890
• Subject: NM_029929.3
• Aligned Length: 1798
• Identities: 1557
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTCACCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTGTTGCGCGAGGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCGA  74
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGCACCTGTCGTACGGGCGAGTGAACCTGAACGTGCTGCGCGAGGCGGTGCGTCGGGAGCTGCGCGA  74

Query   75  GTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCAAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATTG  148
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  GTTCCTGGACAAGTGCGCTGGGAGCAAGGCAATAGTGTGGGATGAGTACTTAACAGGACCATTTGGACTGATCG  148

Query  149  CACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGCT  222
            |||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.||||||
Sbjct  149  CACAGTACTCACTACTAAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAGTCGTCTGCCCGCAGCT  222

Query  223  GATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCAG  296
            |||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  GATGTCAAGAACATCATTTTTTTGGTCAGACCCAGGCTAGAGCTGATGGACATAATTGCTGAGAATGTACTCAG  296

Query  297  TGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAGC  370
            |||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||..||||.||.||||
Sbjct  297  TGAGGACAGGCGTGGCCCTACCAGGGATTTCCATATTTTGTTTGTGCCTCGCCGGAGCCTACTGTGTGAGCAGC  370

Query  371  GGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGAT  444
            ||.|||||||.|||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GGCTGAAGGACCTGGGGGTTTTGGGATCCTTTATTCATCGAGAAGAATACAGCTTGGATCTCATTCCATTTGAT  444

Query  445  GGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGTA  518
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGGGACCTCTTATCCATGGAGTCAGAGGGCGCTTTCAAAGAGTGCTACCTGGAAGGCGACCAGACCAGCCTGTA  518

Query  519  CCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAGGCGCTGTATGGAACTATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAGT  592

Query  593  GCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCCT  666
            |.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.||.
Sbjct  593  GTGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGGTCAGGATGAAGAGGGAGTTCACAGGAAGCCAGAACTCAGTGTTCCCC  666

Query  667  GTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATGA  740
            ||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|..|.||.||.||.|||.|.|||||.||.|||||
Sbjct  667  GTGTTTGATAACCTCTTGCTGCTTGATCGCAATGTGGATCTCCTGACGCCACTCGCCTCCCAGCTCACGTATGA  740

Query  741  AGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAGA  814
            |||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  741  AGGCCTCATCGATGAGATTTACGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAGTTGCCTCCAGAGAAGTTTGCACCCAAGA  814

Query  815  AACAG------GGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAG  882
            |.|||      |||..||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct  815  AGCAGGGTGGCGGCAGTGGTGGGAAGGACCTTCCCACGGAGGCCAAGAAGCTTCAGCTCAACTCCGCAGAGGAG  888

Query  883  CTCTATGCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTC  956
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  CTCTACGCCGAGATCCGAGACAAGAACTTCAACGCTGTGGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAGGCGAAGATCATCTC  962

Query  957  TGCAGCATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACA  1030
            ||||||.||||||||..|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct  963  TGCAGCGTTCGAGGAGCGACACAACGCTAAGACAGTCGGGGAGATCAAGCAGTTTGTGTCCCAGCTACCCCACA  1036

Query 1031  TGCAGGCAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAA  1104
            ||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037  TGCAGGCAGCCAGGGGATCGCTCGCCAACCACACCTCAATTGCAGAGTTAATCAAAGACGTCACCACTTCTGAA  1110

Query 1105  GACTTTTTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACAT  1178
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1111  GACTTCTTTGATAAGTTGACAGTGGAGCAGGAGTTCATGTCCGGGATAGACACTGATAAGGTCAACAGTTACAT  1184

Query 1179  TGAGGATTGTATCGCCCAAAAG----CACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGT  1248
            .|||||.||.||.|||||||||    |||||    |||||||||.|.|||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1185  CGAGGACTGCATTGCCCAAAAGCATCCACTC----ATCAAGGTGCTGAGACTGGTTTGCCTCCAGTCTGTGTGC  1254

Query 1249  AATAGTGGGCTCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACAT  1322
            ||.||.||||||||.||.||.||..||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1255  AACAGCGGGCTCAAGCAGAAGGTGCTGGACTATTACAGAAGGGAGATCCTCCAGACCTACGGCTATGAGCACAT  1328

Query 1323  ATTGACCTTACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTA  1396
            |.|||||||..|||||||||||||||||||||||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1329  ACTGACCTTGAACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTCAAGGCTCAGACAGGGGGCAGAAACAATTACCCAACAA  1402

Query 1397  TACGGAAAACATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGT  1470
            |.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1403  TCCGGAAAACACTGCGCCTCTGGATGGACGATGTCAATGAACAAAACCCCACAGACATATCCTATGTGTACAGC  1476

Query 1471  GGGTATGCCCCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCT  1544
            ||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1477  GGTTATGCTCCACTCAGCGTGCGACTGGCTCAGCTCCTTTCCCGGCCAGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTTCT  1550

Query 1545  CCGCATCCTCCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGG  1618
            ||||||.||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1551  CCGCATTCTCCCAGGGCCCCACTTTGAAGAAAGACAGCCACTGCCCACCGGGCTGCAGAAGAAACGCCAGCCAG  1624

Query 1619  GAGAAAACCGAGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTC  1692
            ||||||||.||||.||.|||.||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||.|.
Sbjct 1625  GAGAAAACAGAGTCACACTGGTATTTTTCCTCGGGGGCGTCACCTTTGCGGAAATAGCCGCCCTGCGATTTTTG  1698

Query 1693  TCCCAGTTGGAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGA  1766
            ||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1699  TCCCAGCTGGAAGATGGAGGCACCGAGTATGTCATTGCGACCACTAAACTGATGAATGGAAACAGCTGGATAGA  1772

Query 1767  GGCTCTGATGGAAAACCCTTTC  1788
            .|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1773  AGCTCTCATGGAAAAGCCTTTC  1794